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Name : hsdR (HMPREF0772_10303) Accession : YP_005746385.1 Strain : Staphylococcus aureus TCH60 Genome accession: NC_017342 Putative virulence/resistance : Unknown Product : type I restriction-modification system subunit R Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : 3.1.21.3 Position : 325574 - 328363 bp Length : 2790 bp Strand : - Note : COG: COG0610 DNA sequence : ATGGCATACCAAAGTGAATACGCATTAGAAAATGAAATGATGAATCAACTTGAACAATTGGGTTACGAAAGAGTAACGAT ACGTGATAATAAGCAATTGCTTGATAATTTTAGAACGATTTTAAATGAGCGTCATGCGGACAAATTAGAAGGCAATCCCT TAACAGATAAAGAATTTCAACGTCTGTTAACGATGATTGATGGGAAAAGTATTTTCGAAAGTGCCCGTATTTTACGTGAT AAATTACCACTTAGACGTGATGATGAGTCTGAGATTTATTTGTCGTTTTTAGATACGAAAAGTTGGTGTAAAAATAAGTT TCAAGTGACGAATCAAGTATCGGTCGAGGATACATATAAAGCACGTTATGATGTAACGATATTAATCAACGGACTACCCC TTGTCCAAGTTGAATTGAAACGTCGAGGCATTGATATTAATGAGGCGTTTAACCAAGTAAAACGTTACCGTAAACAAAAT TACACAGGCTTATTCCGCTACATACAAATGTTTATCATTAGTAATGGTGTTGAAACGCGATACTTTTCTAATAATGATAG CGAACTATTGAAGAGTCACATGTTTTATTGGAGTGATAAACAGAATAACCGAATCAATACATTGCAATCGTTTGCTGAGT CATTTATGAGACCTTGTCAATTAGCTAAGATGATATCACGCTATATGATTATTAATGAAACAGATAGAATACTGATGGCA ATGCGTCCGTATCAAGTGTATGCGGTAGAAGCACTTATTCAACAAGCGACTGAGACAGGGAATAATGGATATGTGTGGCA TACAACGGGAAGTGGTAAGACGTTGACTTCTTTTAAAGCGAGTCAGATTTTATCACAACAAGATGACATTAAGAAAGTTA TCTTTTTGGTTGACCGTAAAGACTTGGATAGTCAAACAGAAGAGGAATTTAATAAATTTGCTAAGGGTGCTGTCGACAAA ACATTTAATACCTCGCAACTGGTACGCCAACTAAATGATAAAAGTTTGCCACTTATTGTAACGACGATTCAAAAAATGGC TAAAGCGATTCAAGGTAATGCCCATTTATTAGAACAGTATAAAACAAATAAAGTTGTATTTATTATTGATGAGTGTCATC GCAGTCAATTTGGTGACATGCATCGTCTAGTTAAACAACATTTCAAAAATGCCCAATATTTTGGGTTCACTGGTACGCCA CGTTTCCCAGAAAATAGTAGTCAAGATGGTAGAACAACTGCAGATATTTTTGGTAGATGTTTACATACGTATTTAATTAG AGATGCCATTCATGATGGTAATGTACTTGGTTTCTCAGTTGACTATATTAATACTTTTAAAAATAAAGCTTTAAAAGCAG AAGATAACAGCATGGTTGAAGCAATTGATACGGAAGAAGTATGGTTAGCGGATAAACGTGTGGAATTAGTAACACGACAT ATCATCAATAATCATGATAAATATACACGTAATCGTCAATATTCAAGTATATTTACAGTTCAAAGTATTCACGCGCTTAT TAAATATTATGAGACATTTAAGCGACTTAACAAAAAGTTGGAACAACCATTAACGGTAGCTGGTATATTTACGTTTAAAC CTAATGAAGATGATCGTGATGGTGAAGTGCCATATCATTCACGTGAAAAATTAGAGATAATGATTAGTGATTATAATAAA AAGTTCGAGACGAATTTTTCAACAGACACAACTAATGAGTATTTTAACCATATTTCAAAAAACGTTAAAAAGGGCGTTAA AGATAGTAAAATTGATATCTTAATCGTTGTTAATATGTTCTTAACTGGTTTTGATAGTAAAGTACTGAACACTTTATATG TTGATAAGAATTTAATGTATCATGATTTAATTCAAGCGTATTCACGTACAAATAGGGTTGAAAAAGAATCAAAGCCATTT GGTAAAATTGTAAACTATCGTGACTTGAAAAAAGAGACAGACGATGCACTGAGAGTATTCTCACAAACAAATGATACGGA TACAATTTTAATGCGTAGTTATGAAGAGTATAAAAAAGAATTTATTGACGCTTATCGTGAGCTTAAAATGATTGTGCCGA CACCACACATGGTTGATGACATTCAAGATGAAGAAGAGCTAAAGCGCTTTGTTGAAGCTTATCGTTTATTAGCTAAAATA ATATTACGTTTAAAAGCATTTGACGAGTTTGAGTTTACAATTGATGAAATTGGAATGGATGAACAAGAGAATGAAGACTA TAAAAGTAAATATTTAGCCGTGTACGATCAAGTAAAAAGAGCGACGGCTGAGAAAAATAAAGTATCCATTTTAAATGATA TTGATTTCGAAATAGAAATGATGCGTAATGATACGATTAATGTGAATTATATTATGAATATATTGAGACAAATTGATCTT GAAGACAAAGCGGAACAACGTCGTAACCAAGAACAAATTAGACGTATTTTAGATCATGCAGATGATCCGACATTGAGGTT AAAACGAGATCTAATTAGAGAATTCATCGACAATGTTGTACCTTCTTTAAATAAGGATGATGATATCGATCAAGAATATG TTAATTTCGAAAGTATTAAAAAAGAAGCGGAGTTCAAAGGATTTGCTGGAGAGAGATCTATCGATGAACAAGCCCTAAAA ACAATTTCAAATGACTACCAGTATAGTGGTGTTGTAAACCCACATCACCTTAAAAAAATGATTGGTGATTTGCCATTGAA AGAAAAACGTAAAGCAAGAAAAGCCATTGAATCTTTCGTGGCAGAAACAACTGAAAAATACGGTGTGTAA Protein sequence : MAYQSEYALENEMMNQLEQLGYERVTIRDNKQLLDNFRTILNERHADKLEGNPLTDKEFQRLLTMIDGKSIFESARILRD KLPLRRDDESEIYLSFLDTKSWCKNKFQVTNQVSVEDTYKARYDVTILINGLPLVQVELKRRGIDINEAFNQVKRYRKQN YTGLFRYIQMFIISNGVETRYFSNNDSELLKSHMFYWSDKQNNRINTLQSFAESFMRPCQLAKMISRYMIINETDRILMA MRPYQVYAVEALIQQATETGNNGYVWHTTGSGKTLTSFKASQILSQQDDIKKVIFLVDRKDLDSQTEEEFNKFAKGAVDK TFNTSQLVRQLNDKSLPLIVTTIQKMAKAIQGNAHLLEQYKTNKVVFIIDECHRSQFGDMHRLVKQHFKNAQYFGFTGTP RFPENSSQDGRTTADIFGRCLHTYLIRDAIHDGNVLGFSVDYINTFKNKALKAEDNSMVEAIDTEEVWLADKRVELVTRH IINNHDKYTRNRQYSSIFTVQSIHALIKYYETFKRLNKKLEQPLTVAGIFTFKPNEDDRDGEVPYHSREKLEIMISDYNK KFETNFSTDTTNEYFNHISKNVKKGVKDSKIDILIVVNMFLTGFDSKVLNTLYVDKNLMYHDLIQAYSRTNRVEKESKPF GKIVNYRDLKKETDDALRVFSQTNDTDTILMRSYEEYKKEFIDAYRELKMIVPTPHMVDDIQDEEELKRFVEAYRLLAKI ILRLKAFDEFEFTIDEIGMDEQENEDYKSKYLAVYDQVKRATAEKNKVSILNDIDFEIEMMRNDTINVNYIMNILRQIDL EDKAEQRRNQEQIRRILDHADDPTLRLKRDLIREFIDNVVPSLNKDDDIDQEYVNFESIKKEAEFKGFAGERSIDEQALK TISNDYQYSGVVNPHHLKKMIGDLPLKEKRKARKAIESFVAETTEKYGV |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| SSP0054 | YP_300144.1 | type I site-specific restriction-modification system restriction subunit | Not tested | SCC15305cap | Protein | 0.0 | 76 |
