Name : polA (HMPREF0772_11461) Accession : YP_005747543.1 Strain : Staphylococcus aureus TCH60 Genome accession: NC_017342 Putative virulence/resistance : Unknown Product : DNA-directed DNA polymerase I Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : 2.7.7.7 Position : 1556697 - 1559327 bp Length : 2631 bp Strand : + Note : COG: COG0749 DNA sequence : GTGAATAAATTAGTATTAATCGATGGTAATAGCTTAAGTTTTAGAGCTTTTTATGCATTACCTTTGTTATCAAACAAAGC AGGCATTCATACCAATGCAGTATATGGTTTTGCAATGTTACTAGAGAAGATTTTAAAAGAAGAAAAGCCAAATCATTTTT TAGTAGCGTTTGATGCAGGTAAAACGACTTTCAGACATGAAAAATATAGTGAATATAAAGGTGGACGCCAGAAAACGCCG CCTGAACTAAGTGAGCAATTTCCTTATATACGCCAATTATTAGATGCTTATCATATTAAACGTTATGAATTAGATAACTA TGAGGCAGATGATATTATCGGAACTTTAAGTAAAGAAGCAGATAAAGCGGGCTTTCAGACAATTATTATTACGGGAGACC GAGATTTAACACAACTTGCAACGGATAATGTAACCATTTATTACACTAAAAAAGGTGTTACTGATGTTGATCATTATACA CCTGACTTTATTGCTGAAAAATACAACGGGTTAACACCTAATCAAATTATTGATATGAAGGGATTAATGGGAGATACTTC TGATAATATACCAGGTGTTGCAGGTGTTGGAGAGAAAACAGCAATAAAATTGCTGAACCAATTTGACACAGTAGAAGGTG TTTATGAACATTTAGATGAAATTTCAGGTAAAAAGTTAAAAGAAAAACTTCAAAACAGCAAAGAAGATGCATTAATGAGT AAAGAATTAGCAACGATTAATGTAGATAGTCCGATTGAAGTAAAACTTGAAGATACGTTAATGACTCATCAAGATGAACA ACAAGAAAAAATCGAATTGTTTAAGAAGTTAGAATTCAAACAATTGTTGGCTGACATTGATCAATCAGCAAGTGGTGAAG ATGCAATAGAAAAGACATTTGAAATTGAAACGTCTTTTGATAATGTTGATTTTACTTCATTGAAAGAAGCGACCATCCAT TTCGAATTAGACGGTGGCAACTATTTGCGAAATAATATTTTAAAATTCTCTTTATTTACAGGTGAGAAACATATTGTAAT TAATGCGGATGACATAATTAATTATGCTGAACTAGTTTCATGGTTAGAAAATCCGAATACGAAAAAAGTCGTATATGATG CTAAAAAAACATATGTAGCATCACATAGATTGGGAATTGATATTCAAAATATTTCATTCGATATTATGTTGGCCAGTTAT ATAATTGATCCATCTCGTACGATTAGTGATGTTCAATCAGTTGTTTCATTGTACGGTCAAAGTTTTGTGAAAGACGATGT GAGTATATATGGAAAAGGTAAGAAATTTAAGGTACCTGAAGATGATGTTTTAAATCCATATGTTGCTTCTATTACTGATG CAATTTACTTTGCGAAACCAAATATGGATAAACAATTAGAAGAATACAATCAGGTAGAACTCTTAGCTGATTTAGAGCTA TCGCTAGCTAAGATTTTAAGTGAAATGGAAGAAATTGGTATATATACAGATGTTCATGATTTAGAAGAAATGGAAAAAGA AATTCAAGAAAAATTAGACGTCTTGATTCGAAATATCCATGATGCAGCTGGTGAAGATTTTAATATAAATTCTCCTAAGC AATTAGGTGTTGTATTGTTTGAGACATTACAATTACCTGTTATTAAAAAGACGAAAACAGGATATTCTACTGCTGTAGAT GTCTTAGAGCAATTGCAAGGTGAACATCCTATCATTGATTATATTTTAGAATATCGTCAATTATCTAAGTTGCAGTCTAC TTATGTTGAAGGATTGCAAAAGGTAATTAGTGATGATCAACGTATCCATACACGTTTTAACCAAACTTTAGCGCAAACTG GACGTTTATCAAGTGTAGATCCTAATTTACAAAATATTCCGGTTAGACTTGAAGAAGGGCGTAAAATAAGAAAAGCCTTT AAACCAACTTCAAAAGATAGCGTTATATTATCAGCAGATTATTCTCAAATTGAATTGCGTGTATTAGCACACATTACACA AGATGAGAGTATGAAAGAAGCATTTATCAACGGCGATGATATTCATACAGCAACTGCTATGAAAGTATTTGGTGTAGAAG CTGATCAAGTCGATAGTTTAATGCGTCGTCAAGCAAAAGCGGTTAACTTTGGAATTGTTTATGGGATAAGTGATTATGGT TTAAGTCAAAGTTTAGGTATTACTCGTAAAAAAGCAAAAGCATTCATTGATGATTATTTAGCTAGTTTCCCAGGTGTAAA ACAATATATGTCTGATATTGTAAAAGATGCCAAAGCTTTAGGTTTCGTGGAAACATTGCTACATCGTCGACGCTATATTC CTGATATTACGAGTCGTAACTTTAATTTACGTGGCTTTGCTGAACGTACTGCTATGAATACGCCAATACAAGGCAGTGCT GCAGATATCATTAAACTGGCAATGGTTAAATTTGCGCAAAAAATGAAAGAGACAACATATCAAGCTAAACTATTATTACA AGTACACGATGAATTAATTTTTGAAGTACCTAAGTCAGAAGTAGATTCATTTAGTGAATTTGTAGAAGAGATAATGGAAA ATGCATTGCAATTAGATGTTCCATTAAAAGTAGACTCAAGTTATGGTGCAACTTGGTATGATGCAAAATAA Protein sequence : MNKLVLIDGNSLSFRAFYALPLLSNKAGIHTNAVYGFAMLLEKILKEEKPNHFLVAFDAGKTTFRHEKYSEYKGGRQKTP PELSEQFPYIRQLLDAYHIKRYELDNYEADDIIGTLSKEADKAGFQTIIITGDRDLTQLATDNVTIYYTKKGVTDVDHYT PDFIAEKYNGLTPNQIIDMKGLMGDTSDNIPGVAGVGEKTAIKLLNQFDTVEGVYEHLDEISGKKLKEKLQNSKEDALMS KELATINVDSPIEVKLEDTLMTHQDEQQEKIELFKKLEFKQLLADIDQSASGEDAIEKTFEIETSFDNVDFTSLKEATIH FELDGGNYLRNNILKFSLFTGEKHIVINADDIINYAELVSWLENPNTKKVVYDAKKTYVASHRLGIDIQNISFDIMLASY IIDPSRTISDVQSVVSLYGQSFVKDDVSIYGKGKKFKVPEDDVLNPYVASITDAIYFAKPNMDKQLEEYNQVELLADLEL SLAKILSEMEEIGIYTDVHDLEEMEKEIQEKLDVLIRNIHDAAGEDFNINSPKQLGVVLFETLQLPVIKKTKTGYSTAVD VLEQLQGEHPIIDYILEYRQLSKLQSTYVEGLQKVISDDQRIHTRFNQTLAQTGRLSSVDPNLQNIPVRLEEGRKIRKAF KPTSKDSVILSADYSQIELRVLAHITQDESMKEAFINGDDIHTATAMKVFGVEADQVDSLMRRQAKAVNFGIVYGISDYG LSQSLGITRKKAKAFIDDYLASFPGVKQYMSDIVKDAKALGFVETLLHRRRYIPDITSRNFNLRGFAERTAMNTPIQGSA ADIIKLAMVKFAQKMKETTYQAKLLLQVHDELIFEVPKSEVDSFSEFVEEIMENALQLDVPLKVDSSYGATWYDAK |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
polA | YP_281523.1 | DNA polymerase I | Not tested | Not named | Protein | 0.0 | 48 |