Gene Information

Name : hysA2 (HMPREF0772_11345)
Accession : YP_005747427.1
Strain : Staphylococcus aureus TCH60
Genome accession: NC_017342
Putative virulence/resistance : Virulence
Product : hyaluronate lyase
Function : -
COG functional category : -
COG ID : -
EC number : 4.2.2.1
Position : 1421214 - 1423634 bp
Length : 2421 bp
Strand : -
Note : -

DNA sequence :
ATGACAAATAAAATGAAGAAATGGCAAAAATTATCCACCATTACGTTATTAATGACCGGAGTGATTGCTTTAAATAATGG
TGAATTTAGAAATGTTGATAAACATCAAATCGCTGTGGCTGATACGAATGTTCAAACGCCAGATTATGAAAAATTGAAGA
AGACGTGGCTCGACGTTAACTACGGTTATGATCAGTATGATGAGAATAATCAAGATATGAAGAAGAAGTTTGATGCTAAA
GAAAAAGAAGCCAAGAAGTTACTTGATGACATGAAAACTGATACGAATAGAACATATTTGTGGTCAGGAGCTGAAAACCT
TGAAACTAATTCTTCTCACATGACAAAAACCTATCGTAATATCGAGAAAATCGCAGAAGCAATGCAACATAAGAATACGG
TATTAAAAACAGTTGAAAACAAGTTGAAAATAAAAGAAGCCCTAGATTGGATGCACAAAAATGTTTATGGCAAGAATCCT
TCTCAAAAAGTCGAGGATTTAACTAAAAATCGTAAGGGGCAAACTACACCCAAGAATAACTCATTGAATTGGTGGGATTA
TGAAATTGGTACGCCAAGAGCATTAACAAATACACTACTTCTAATGGATGATATGCTCACTAAAGATGAAATGAAAAATT
ATTCAAAACCTATTAGTACATATGCACCATCCAGTGACAAAATTTTATCTTCTGTTGGTGAATCAGAAGATGCTAAAGGT
GGAAATTTAGTGGACATTTCTAAAGTAAAACTTTTAGAAAGTGTTATTGAAGAAGATGTAGATATGTTGAAAAAGTCTAT
AGATTCTTTTAATAAAGTGTTCACTTATGTTCAAGATTCTGCCACTGGTAAAGGTCGCAATGGATTCTATAAAGATGGCT
CTTACATTGATCATCAAGATGTCCCTTACACTGGTGCTTATGGTGTTGTACTATTAGAGGGTATTTCTCAAATGATGCCG
ATGATAAAAGAATCTCCTTTTAAAACTACACAAGATAATGCTACATTAAGCAATTGGATTGACGAAGGGTTTATGCCATT
AATCTATAAAGGTGAAATGATGGATTTATCACGAGGTAGAGCTATCAGTCGTGAAAATGAAACGAGTCATACAGCGTCAG
CGACTGTAATGAAATCATTGTTGAGATTGAATGATACCATGGATGATTCAACAAAAACTAGATATAAGCAAATCGTTAAA
ACTTCTGTTAATTCTGATTCAAGTTACAACCAAAATAATTATTTAAATTCATATTCAGACATAGCTAAAATGAAAAAGTT
AATGAATGATAGTACTATTTCTAAAAACGATTTAACACAGCAACTTAAAATATATAATGACATGGATCGTGTCACCTATC
ACAATAAAGACCTGGACTTTGCATTTGGTTTAAGTATGACATCGAAAAACATCGCACGATACGAAAATATCAACGGAGAG
AACTTAAAAGGTTGGCACACCGGTGCAGGCATGTCTTATTTATATAACAGCGATGTCAAACACTATCGCGATAACTTCTG
GGCAACAGCCGATATGACTTGTCTTCCAGGCACTACTACTTTAAATGATATGCCATCTACTAATACTAAGAATGATAAAT
CTTTTGTTGGCGGGACAAAATTAAATAATAAATACGCAAGCATCGGTATGGATTTTGAAAATCAGGACAAAACTTTAACT
GCCAAAAAATCATATTTCATATTAAACGATAAAATTGTCTTCTTAGGAACTGGCATTAAAAGTACTGATTCATCAAAGAA
TCCAGTTACAAGTGTTGAAAATCGCAAAGCAAATGGGTATAAATTATTTAAAGATGATATTGAAATTACCACTTCAGATG
TTAATGCTCAGGAAACCCATTCAGTCTTTTTAGAGTCCAACGATACTAAAAAGAACATTGGTTATCATTTCTTAGACAAG
CCAAAAATAACTGTAAAAAAAGAAAGTCATACTGGTAAGTGGAGTGAAATTAATAAAAGTCAAAAAAAAGATGACAAAAA
AGATGAGTATTATGAAGTAACTCAAACACATAATACATCTGACAGTAAATATGCATATGTTTTGTATCCTGGTTTATCAA
AAAGTGATTTTAAATCGAAGAATAATAATGTAAGTATTGTTAAACAAGATGAAGATTTTCATGTGATAAAAGATAATGAT
GGCGTATTTGCTGGGGTTAATTATAGTGATAATACTAAATCTTTTGATATAAACGGAATTACTGTTGAATTAAAAGAAAA
AGGCATGTTTGTAATTAAAAAGAAAGATGATAAAGCATATAAATGTAGCTTCTATAATCCTGAAACTACAAATACCGCTT
CAAATATAGAATCAAAAATTTTTATTAAAGGTTACACCATAACTAATAAAAGTGTCACAAACTCTAATGATGCTGGTGTA
AACTTTGAATTAACTAAATAA

Protein sequence :
MTNKMKKWQKLSTITLLMTGVIALNNGEFRNVDKHQIAVADTNVQTPDYEKLKKTWLDVNYGYDQYDENNQDMKKKFDAK
EKEAKKLLDDMKTDTNRTYLWSGAENLETNSSHMTKTYRNIEKIAEAMQHKNTVLKTVENKLKIKEALDWMHKNVYGKNP
SQKVEDLTKNRKGQTTPKNNSLNWWDYEIGTPRALTNTLLLMDDMLTKDEMKNYSKPISTYAPSSDKILSSVGESEDAKG
GNLVDISKVKLLESVIEEDVDMLKKSIDSFNKVFTYVQDSATGKGRNGFYKDGSYIDHQDVPYTGAYGVVLLEGISQMMP
MIKESPFKTTQDNATLSNWIDEGFMPLIYKGEMMDLSRGRAISRENETSHTASATVMKSLLRLNDTMDDSTKTRYKQIVK
TSVNSDSSYNQNNYLNSYSDIAKMKKLMNDSTISKNDLTQQLKIYNDMDRVTYHNKDLDFAFGLSMTSKNIARYENINGE
NLKGWHTGAGMSYLYNSDVKHYRDNFWATADMTCLPGTTTLNDMPSTNTKNDKSFVGGTKLNNKYASIGMDFENQDKTLT
AKKSYFILNDKIVFLGTGIKSTDSSKNPVTSVENRKANGYKLFKDDIEITTSDVNAQETHSVFLESNDTKKNIGYHFLDK
PKITVKKESHTGKWSEINKSQKKDDKKDEYYEVTQTHNTSDSKYAYVLYPGLSKSDFKSKNNNVSIVKQDEDFHVIKDND
GVFAGVNYSDNTKSFDINGITVELKEKGMFVIKKKDDKAYKCSFYNPETTNTASNIESKIFIKGYTITNKSVTNSNDAGV
NFELTK

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
hysA1 YP_041274.1 hyaluronate lyase precursor 1 Virulence vSa¥â Protein 0.0 99

• Homologs from VFDB (virulence genes)

GeneGenBank Accn Product ID of source DB Alignment Type E-val Identity
hysA2 YP_005747427.1 hyaluronate lyase VFG1315 Protein 0.0 75