Gene Information

Name : HMPREF0772_11186 (HMPREF0772_11186)
Accession : YP_005747268.1
Strain : Staphylococcus aureus TCH60
Genome accession: NC_017342
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : bacteriophage tail length tape measure protein
Function : -
COG functional category : -
COG ID : -
EC number : -
Position : 1257417 - 1261946 bp
Length : 4530 bp
Strand : +
Note : -

DNA sequence :
ATGGGAGAAAGAATAAAAGGTTTATCTATAGGTTTGGATTTAGATGCAGCAAATTTAAATAGATCATTTGCAGAAATCAA
ACGAAACTTTAAAACTTTAAATTCTGACTTAAAATTAACCGGTAACAACTTCAAATATACCGAAAAATCAACTCATAGTT
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CGTTATAAAGGTAAGTGGATTCATGACCAGATGATGCGAGTTGCAAAGCGTGAAAGCAACTATCAATCAAATGCAGTGAA
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CTAAACGAGGGTACACTAATTATAATAATCCAGTACATCAAGGTATCTCAGCAATGCAGTACATTGTTAGACGATATGGT
TGGGGTGGTTTTAAACGTGCTGGTGATTACGCATATGCTACAGGTGGAAAAGTTTTTGATGGTTGGTATAACTTAGGTGA
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CAGAAGTAAGAGGGAAAAAAGCGAGTAAAAATAAGCGTCCTAGCCAATTATCAGACTTAAACGGGTTTGATGATCCTAGC
TTATTATTGAAAATGATTGAACAACAGCAACAACAAATAGCTTTATTACTGAAAATAGCACAATCTAACGATGTGATTGC
AGATAAAGATTATCAGCCGATTATTGACGAATACGCTTTTGATAAAAAGGTGAACGCGTCTATAGAAAAGCGAGAAAGGC
AAGAATCAACAAAAGTAAAGTTTAGAAAAGGAGGAATTGCTATTCAATGA

Protein sequence :
MGERIKGLSIGLDLDAANLNRSFAEIKRNFKTLNSDLKLTGNNFKYTEKSTHSYKQRIKELDGTITGYKKNVDDLAKQYG
KVSQEQGENSAEAQKLRQEYNKQANELNFLEKELEKTTTEFEEFKKAQVEAQRMAESGWGKTSKVFESMGPKLTKMGDGL
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LAGLAVAFTIAYKKSETFRNFVNGAINSVKQTFSNFIQFIQPFIDSVKNVFKQAVSAIVDFAKDIWSQINGFFNENGISI
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TNMKNWLSNTWSSIRTNTIGKAQSLFSGVKSKFTNLWNATKEIFSNLRNWMSNIWNSIKDNTVGIASRLWSKVRGIFTNM
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LLLKMIEQQQQQIALLLKIAQSNDVIADKDYQPIIDEYAFDKKVNASIEKRERQESTKVKFRKGGIAIQ

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
SAKOR_01932 YP_008492120.1 hypothetical protein Not tested ¥ÕSa3 Protein 0.0 99
SAV1955 NP_372479.1 phi PVL ORF 15 and 16-like protein Not tested ¥ÕSa3 Protein 0.0 98
SAUSA300_1930 YP_494581.1 phi77 ORF001-like protein, phage tail tape measure protein Not tested ¥ÕSa3 Protein 0.0 97
SAUSA300_1930 YP_494581.1 phi77 ORF001-like protein, phage tail tape measure protein Not tested ¥ÕSa3 Protein 0.0 97
SA1766 NP_375064.1 hypothetical protein Not tested ¥ÕSa3 Protein 0.0 97
MW1895 NP_646712.1 hypothetical protein Not tested ¥ÕSa3 Protein 0.0 52