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Name : pdp (HMPREF0772_11054) Accession : YP_005747136.1 Strain : Staphylococcus aureus TCH60 Genome accession: NC_017342 Putative virulence/resistance : Unknown Product : pyrimidine-nucleoside phosphorylase Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : 2.4.2.2 Position : 1128229 - 1129569 bp Length : 1341 bp Strand : + Note : COG: COG0213 DNA sequence : ATGCTTTGTCCTAAGCTTTTTAAGAAAAGGATGATAAAAATGAGAATGATAGACATTATTGAGAAAAAGCGTGACGGTCA TACACTAACAACGGAAGAAATTAATTTCTTTATTGACGGCTATGTTAAAGGGGATATTCCTGATTATCAAGCGTCAAGTT TAGCAATGGCGATTTATTTCCAAGATATGAACGATGATGAGCGTGCAGCATTAACGATGGCTATGGTTAATTCTGGTGAT ATGATAGATTTGAGTGATATTAAAGGTGTCAAAGTAGATAAGCACTCAACAGGTGGTGTAGGAGATACAACTACATTGGT TTTAGCACCATTAGTAGCAGCTGTAGATGTTCCTGTTGCAAAAATGAGTGGGCGTGGATTAGGTCATACAGGTGGTACGA TTGATAAATTAGAAGCAATTGATGGTTTTCATGTTGAAATAGATGAAGCAACATTTGTGAAATTGGTTAATGAAAATAAA GTGGCAGTTGTAGGACAATCAGGAAATTTAACTCCTGCAGATAAAAAATTATATGCCTTAAGGGATGTTACTGGTACTGT CAATTCAATACCATTAATTGCCTCTTCAATTATGAGTAAAAAGATTGCTGCTGGTGCAGATGCAATTGTATTAGATGTAA AAACTGGTAGCGGTGCATTTATGAAAACATTAGAAGATGCTGAAGCATTAGCGCACGCAATGGTACGTATTGGTAATAAT GTGGGACGTAATACGATGGCGATTATTTCTGATATGAATCAGCCACTTGGACGTGCGATTGGCAATGCGCTTGAGTTACA AGAAGCAATTGATACGTTGAAAGGACAAGGTCCGAAAGATTTAACAGAACTTGTATTAACATTAGGTTCTCAAATGGTTG TACTTGCAAACAAAGCTGAAACGCTTGAAGAAGCGAGAGCGTTGCTAATTGAGGCAATTGATTCAGGTGCAGCATTAGAA AAATTCAAAACATTTATTAAAAACCAAGGTGGCGACGAAACAGTTATTGACCATCCAGAGCGTTTGCCACAAGCTCAATA TCAAATCGAATATAAAGCTAAAAAATCAGGTTATGTGACTGAGTTAGTCTCTAACGATATAGGTGTCGCTTCGATGATGT TAGGAGCGGGACGTTTAACAAAAGAGGATGATATTGATTTAGCGGTTGGTATTGTTTTAAATAAAAAAATTGGTGATAAA GTAGAAGAAGGAGAATCATTATTAACGATTCACAGTAATCGCCAAGATGTAGACGATGTTGTTAAAAAATTAGATTCAAG CATAACAATTGCTGATTATGTTGTATCGCCTACATTAATTCATAAAATAATTACAGAGTAG Protein sequence : MLCPKLFKKRMIKMRMIDIIEKKRDGHTLTTEEINFFIDGYVKGDIPDYQASSLAMAIYFQDMNDDERAALTMAMVNSGD MIDLSDIKGVKVDKHSTGGVGDTTTLVLAPLVAAVDVPVAKMSGRGLGHTGGTIDKLEAIDGFHVEIDEATFVKLVNENK VAVVGQSGNLTPADKKLYALRDVTGTVNSIPLIASSIMSKKIAAGADAIVLDVKTGSGAFMKTLEDAEALAHAMVRIGNN VGRNTMAIISDMNQPLGRAIGNALELQEAIDTLKGQGPKDLTELVLTLGSQMVVLANKAETLEEARALLIEAIDSGAALE KFKTFIKNQGGDETVIDHPERLPQAQYQIEYKAKKSGYVTELVSNDIGVASMMLGAGRLTKEDDIDLAVGIVLNKKIGDK VEEGESLLTIHSNRQDVDDVVKKLDSSITIADYVVSPTLIHKIITE |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| deoA | YP_005163381.1 | Thymidine phosphorylase | Not tested | Not named | Protein | 2e-71 | 47 |
