|
Name : polA (SAA6008_01657) Accession : YP_005745007.1 Strain : Staphylococcus aureus JKD6008 Genome accession: NC_017341 Putative virulence/resistance : Unknown Product : DNA-directed DNA polymerase I Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 1769320 - 1771950 bp Length : 2631 bp Strand : - Note : - DNA sequence : GTGAATAAATTAGTATTAATCGATGGTAATAGCTTAAGTTTTAGAGCTTTTTATGCATTACCTTTGTTATCAAACAAAGC AGGCATTCATACCAATGCAGTATATGGTTTTGCAATGTTACTAGAGAAGATTTTAAAAGAAGAAAAGCCAAATCATTTTT TAGTAGCGTTTGATGCAGGTAAAACGACTTTCAGACATGAAAAATATAGTGAATATAAAGGTGGACGCCAGAAAACGCCG CCTGAACTAAGTGAGCAATTTCCTTATATTCGCCAATTATTAGATGCTTATCATATTAAACGTTATGAATTAGATAACTA TGAGGCAGATGATATTATCGGAACTTTAAGTAAAGAAGCAGATAAAGCGGGCTTTCAGACAATTATTATTACGGGAGACC GAGATTTAACACAACTTGCAACGGATAATGTAACCATTTATTACACTAAAAAAGGTGTTACTGATGTTGATCATTATACA CCTGACTTTATTGCGGAAAAATACAACGGGTTAACACCTAATCAAATTATTGATATGAAAGGATTAATGGGAGATACTTC TGATAATATACCAGGTGTTGCAGGTGTTGGAGAGAAAACAGCAATAAAATTGCTAAACCAATTTGACACAGTAGAAGGTG TCTATGAACATTTAGATGAAATTTCAGGTAAAAAGTTAAAAGAAAAACTTCAAAATAGCAAAGAAGATGCATTAATGAGT AAAGAATTAGCAACGATTAATGTAGATAGTCCGATTGAAGTAAAACTTGAAGATACGTTAATGACTCATCAAGATGAACA ACAAGAAAAAATCGAATTGTTTAAGAAGTTAGAATTCAAACAATTGTTGGCTGACATTGATCAATCAGCAAGCGTTGAAG ATGCAATAGAAAAGACATTTGAAATTGAAACGTCTTTTGATAATATTGATTTTACTTCATTGAAAGAAGCGGCCATCCAT TTCGAATTAGACGGTGGTAACTATTTGCGAAATAATATTTTAAAATTCTCTTTATTTACAGGTGAGAAACATATTGTAAT TAATGCGGATGACATAAATAATTATGTCGAACTAGTTTCATGGTTAGAAAATCCGAATTCGAAAAAAGTCGTATATGATG CTAAAAAAACATATGTAGCATCACATAGATTGGGGATTGATATTCAAAATATTTCTTTCGATATTATGTTGGCCAGTTAT ATAATTGATCCATCTCGTACGATTAGTGATGTTCAATCAGTTGTTTCATTGTACGGTCAAAGTTTTGTGAAAGACGATGT GAGTATATATGGAAAAGGTAAGAAATTTAAGGTACCTGAAGATGATGTTTTAAATCCATATGTTGCTTCTATTACTGATG CAATTTACTTTGCGAAACCAAATATGGATAAACAATTAGAAGAATACAATCAGGTAGAACTCTTGGCTGATTTAGAGCTA CCGCTAGCTAAGATTTTAAGTGAAATGGAAGAAATTGGTATATTTACAGATGTTCATGATTTAGAAGAAATGGAAAAAGA AATTCAAGAAAAATTAGACGTCTTGATTCGAAATATCCATGATGCAGCTGGTGAAGATTTTAATATAAATTCTCCTAAGC AATTAGGTGTTGTATTGTTTGAGACATTACAATTACCTGTTATTAAAAAGACGAAAACAGGATATTCTACTGCTGTAGAT GTCTTAGAGCAATTGCAAGGTGAACATCCTATCATTGATTATATTTTAGAATATCGTCAATTATCTAAGTTACAGTCTAC TTATGTTGAAGGATTGCAAAAGGTAATTAGTGATGATCAACGTATCCATACACGTTTTAATCAAACTTTAGCGCAAACTG GACGTTTATCAAGTGTAGATCCTAATTTACAAAATATTCCGGTTAGACTTGAAGAAGGGCGTAAAATAAGAAAAGCCTTT AAACCAACTTCAAAAGATAGCGTTATATTATCAGCAGATTATTCTCAAATTGAATTGCGTGTATTAGCACACATTACACA AGATGAGAGTATGAAAGAAGCATTTATCAACGGCGATGATATTCATACAGCAACTGCTATGAAAGTATTTGGTGTAGAAG CTGATCAAGTCGATAGTTTAATGCGTCGTCAAGCAAAAGCAGTTAACTTTGGAATTGTTTATGGGATAAGTGATTATGGT TTAAGTCAAAGTTTAGGTATTACTCGTAAAAAAGCAAAAGCATTCATTGATGATTATTTAGCTAGTTTCCCAGGTGTAAA ACAATATATGTCTGATATTGTAAAAGATGCCAAAGCTTTAGGTTACGTGGAAACATTGCTACATCGTCGACGCTATATTC CTGATATTACGAGTCGTAACTTTAATTTACGCGGCTTTGCTGAACGTACTGCTATGAATACGCCAATACAGGGCAGTGCT GCAGATATCATTAAACTGGCAATGGTTAAATTTGCTCAAAAAATGAAAGAGACAACATATCAAGCTAAACTATTATTACA AGTACACGATGAATTAATTTTTGAAGTACCTAAGTCAGAAGTAGATTCATTTAGTGAATTTGTAGAAGAGATAATGGAAA ATGCATTGCAATTAGATGTTCCATTAAAAGTAGACTCAAGTTATGGTGCAACCTGGTATGATGCAAAATAA Protein sequence : MNKLVLIDGNSLSFRAFYALPLLSNKAGIHTNAVYGFAMLLEKILKEEKPNHFLVAFDAGKTTFRHEKYSEYKGGRQKTP PELSEQFPYIRQLLDAYHIKRYELDNYEADDIIGTLSKEADKAGFQTIIITGDRDLTQLATDNVTIYYTKKGVTDVDHYT PDFIAEKYNGLTPNQIIDMKGLMGDTSDNIPGVAGVGEKTAIKLLNQFDTVEGVYEHLDEISGKKLKEKLQNSKEDALMS KELATINVDSPIEVKLEDTLMTHQDEQQEKIELFKKLEFKQLLADIDQSASVEDAIEKTFEIETSFDNIDFTSLKEAAIH FELDGGNYLRNNILKFSLFTGEKHIVINADDINNYVELVSWLENPNSKKVVYDAKKTYVASHRLGIDIQNISFDIMLASY IIDPSRTISDVQSVVSLYGQSFVKDDVSIYGKGKKFKVPEDDVLNPYVASITDAIYFAKPNMDKQLEEYNQVELLADLEL PLAKILSEMEEIGIFTDVHDLEEMEKEIQEKLDVLIRNIHDAAGEDFNINSPKQLGVVLFETLQLPVIKKTKTGYSTAVD VLEQLQGEHPIIDYILEYRQLSKLQSTYVEGLQKVISDDQRIHTRFNQTLAQTGRLSSVDPNLQNIPVRLEEGRKIRKAF KPTSKDSVILSADYSQIELRVLAHITQDESMKEAFINGDDIHTATAMKVFGVEADQVDSLMRRQAKAVNFGIVYGISDYG LSQSLGITRKKAKAFIDDYLASFPGVKQYMSDIVKDAKALGYVETLLHRRRYIPDITSRNFNLRGFAERTAMNTPIQGSA ADIIKLAMVKFAQKMKETTYQAKLLLQVHDELIFEVPKSEVDSFSEFVEEIMENALQLDVPLKVDSSYGATWYDAK |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| polA | YP_281523.1 | DNA polymerase I | Not tested | Not named | Protein | 0.0 | 48 |
