Name : SAPIG0213 (SAPIG0213) Accession : YP_005733023.1 Strain : Staphylococcus aureus ST398 Genome accession: NC_017333 Putative virulence/resistance : Unknown Product : type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family subfamily, putative Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : 3.1.21.3 Position : 228868 - 231657 bp Length : 2790 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGGCATACCAAAGTGAATACGCATTAGAAAATGAAATGATGAATCAACTTGAACAATTGGGTTACGAAAGAGTAACGAT ACGTGATAATAAGCAATTGCTTGATAATTTTAGAACGATTTTAAATGAGCGTCATGCGGACAAATTAGAAGGCAATCCCT TAACAGATAAAGAGTTTCAACGTCTGTTAACGATGATTGATGGGAAAAGTATTTTCGAGAGTGCCCGTATTTTACGTGAT AAATTACCACTTAGACGTGATGATGAGTCTGAGATTTATTTGTCGTTTTTAGATACGAAAAGTTGGTGTAAAAATAAGTT TCAAGTGACGAATCAAGTATCTGTCGAGGATACATATAAAGCACGTTATGATGTAACGATATTAATCAACGGACTACCCC TTGTCCAAGTTGAATTGAAACGTCGAGGTATTGATATTAATGAGGCGTTTAACCAAGTAAAACGTTACCGCAAACAAAAT TACACAGGCTTATTCCGCTACATACAAATGTTTATCATTAGTAATGGTGTTGAAACGCGATACTTTTCTAATAATGATAG CGAACTATTGAAGAGTCACATGTTTTATTGGAGTGATAAACAGAATAACCGAATCAATACATTACAATCATTTGCTGAGT CGTTTATGAGACCTTGTCAATTAGCTAAGATGATATCGCGCTATATGATTATTAATGAAACAGATAGAATACTGATGGCA ATGCGCCCGTATCAAGTGTATGCGGTAGAAGCACTAATTCAACAAGCGACTGAGACAGGGAATAATGGATATGTGTGGCA TACAACTGGAAGTGGTAAGACATTGACTTCTTTTAAAGCGAGTCAGATTTTATCACAACAAGATGACATTAAGAAAGTTA TCTTTTTGGTTGGCCGTAAAGACTTGGATAGTCAAACAGAAGAGGAATTTAATAAATTTGCTAAGGGTGCTGTAGACAAA ACTTTTAATACCTCGCAACTGGTACGCCAACTAAATGATAAAAGTTTGCCACTTATTGTAACGACGATTCAAAAAATGGC TAAAGCGATTCAAGGGAATGCCCATTTATTAGAACAGTATAAAACGAATAAAGTTGTATTTATTATTGATGAGTGTCATC GCAGTCAATTTGGTGACATGCATCGTCTAGTTAAACAACATTTCAAAAATGCCCAATACTTTGGATTCACTGGTACGCCA CGTTTTCCAGAAAATAGTAGTCAAGATGGTAGGACAACTGCAGATATTTTCGGTAGATGCTTACATACGTATTTAATTAG AGATGCCATTCATGATGGTAATGTACTTGGTTTCTCAGTTGACTATATTAATACTTTTAAAAATAAAGCTTTAAAAGCAG AAGATAACAGCATGGTTGAAGCAATTGATACGGAAGAAGTATGGTTAGCGGATAAACGTGTGGAATTAGTAACACGACAT ATCATCAATAATCATGATAAATATACACGTAATCGTCAATATTCAAGTATATTTACAGTCCAAAGTATTCACGCGCTTAT TAAATATTATGAGACATTTAAGCGACTTAACAAAAAGTTGGAACAACCATTAACGGTAGCTGGTATATTTACGTTTAAAC CTAATGAAGATGATCGTGATGGTGAAGTGCCATATCATTCACGTGAAAAATTAGAGATAATGATTAGCGATTATAATAAA AAGTTCGAGACGAATTTTTCAACAGACACAACTAATGAGTATTTTAATCATATTTCAAAAAACGTTAAAAAGGGCGTTAA AGATAGTAAAATTGATATCTTAATCGTTGTTAATATGTTCTTAACTGGTTTTGATAGTAAAGTACTGAACACTTTATATG TTGACAAGAATTTAATGTATCATGATTTAATTCAAGCGTATTCACGTACAAATAGGGTTGAAAAAGAATCAAAGCCATTT GGTAAAATTGTAAACTATCGTGACTTGAAAAAAGAGACAGACGATGCACTGAGAGTATTCTCACAAACAAATGATACGGA TACAATTTTAATGCGTAGTTATGAAGAGTATAAAAAAGAATTTATGGACGCTTATCGTGAGCTTAAAATGATTGTGCCGA CACCACATATGGTTGATGACATTCAAGATGAAGAAGAGCTAAAGCGCTTTGTTGAAGCTTATCGTTTATTAGCTAAAATA ATATTACGTTTAAAAGCATTTGACGAGTTTGAGTTTACAATTGATGAAATTGGAATGGATGAACAAGAGAATGAAGACTA TAAAAGTAAATATTTAGCTGTGTACGATCAAGTAAAAAGAGCGACGGCTGAGAAAAATAAAGTATCCATTTTAAATGATA TTGATTTCGAAATAGAAATGATGCGTAATGATACGATTAATGTGAATTATATTATGAATATATTGAGACAAATTGATCTT GAAGACAAAGCGGAACAACGTCGTAACCAAGAACAAATTAGACGCATTTTAGATCATGCAGATGATCCGACATTGAGGTT AAAACGAGATCTAATTAGAGAATTCATCGACAATGTTGTACCTTCTTTAAATAAGGATGATGATATCGATCAAGAATATG TTAATTTCGAAAGTATTAAAAAAGAAGCGGAGTTCAAAGGATTTGCTGGAGAGAGATCTATCGATGAACAAGCCCTAAAA ACAATTTCAAATGACTACCAGTATAGTGGTGTTGTAAACCCACATCACCTTAAAAAAATGATTGGTGATTTGCCATTGAA AGAAAAGCGTAAAGCAAGAAAAGCCATTGAATCTTTCGTGGCAGAAACAACTGAAAAATACGGTGTGTAA Protein sequence : MAYQSEYALENEMMNQLEQLGYERVTIRDNKQLLDNFRTILNERHADKLEGNPLTDKEFQRLLTMIDGKSIFESARILRD KLPLRRDDESEIYLSFLDTKSWCKNKFQVTNQVSVEDTYKARYDVTILINGLPLVQVELKRRGIDINEAFNQVKRYRKQN YTGLFRYIQMFIISNGVETRYFSNNDSELLKSHMFYWSDKQNNRINTLQSFAESFMRPCQLAKMISRYMIINETDRILMA MRPYQVYAVEALIQQATETGNNGYVWHTTGSGKTLTSFKASQILSQQDDIKKVIFLVGRKDLDSQTEEEFNKFAKGAVDK TFNTSQLVRQLNDKSLPLIVTTIQKMAKAIQGNAHLLEQYKTNKVVFIIDECHRSQFGDMHRLVKQHFKNAQYFGFTGTP RFPENSSQDGRTTADIFGRCLHTYLIRDAIHDGNVLGFSVDYINTFKNKALKAEDNSMVEAIDTEEVWLADKRVELVTRH IINNHDKYTRNRQYSSIFTVQSIHALIKYYETFKRLNKKLEQPLTVAGIFTFKPNEDDRDGEVPYHSREKLEIMISDYNK KFETNFSTDTTNEYFNHISKNVKKGVKDSKIDILIVVNMFLTGFDSKVLNTLYVDKNLMYHDLIQAYSRTNRVEKESKPF GKIVNYRDLKKETDDALRVFSQTNDTDTILMRSYEEYKKEFMDAYRELKMIVPTPHMVDDIQDEEELKRFVEAYRLLAKI ILRLKAFDEFEFTIDEIGMDEQENEDYKSKYLAVYDQVKRATAEKNKVSILNDIDFEIEMMRNDTINVNYIMNILRQIDL EDKAEQRRNQEQIRRILDHADDPTLRLKRDLIREFIDNVVPSLNKDDDIDQEYVNFESIKKEAEFKGFAGERSIDEQALK TISNDYQYSGVVNPHHLKKMIGDLPLKEKRKARKAIESFVAETTEKYGV |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
SSP0054 | YP_300144.1 | type I site-specific restriction-modification system restriction subunit | Not tested | SCC15305cap | Protein | 0.0 | 75 |