|
Name : SAPIG0121 (SAPIG0121) Accession : YP_005732931.1 Strain : Staphylococcus aureus ST398 Genome accession: NC_017333 Putative virulence/resistance : Unknown Product : glycolate permease GlcA Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 124243 - 125835 bp Length : 1593 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGACATTACTTACTGTAAATCCATTCGATAATGTTGGATTATCAGCCTTAGTTGCAGCAGTACCTATTATTTTATTTTT ATTATGCTTAACCGTTTTTAAAATGAAAGGCATTTATGCAGCATTGACAACTTTGGTTGTTACATTGATTGTGGCTTTAT TTGTATTTGAATTACCAGCGCGTGTATCAGCAGGTGCGATTACAGAAGGCGTTGTTGCCGGTATTTTCCCAATAGGATAT ATCGTTTTAATGGCAGTTTGGTTATATAAAGTTTCTATTAAAACAGGACAATTTTCTATTATTCAAGATAGTATTGCAAG TATTTCAGAGGACCAAAGAATCCAACTATTATTAATTGGATTTTGTTTCAATGCATTTTTAGAAGGTGCAGCAGGATTTG GTGTGCCAATTGCGATTTGTGCAGTATTATTAATTCAACTTGGATTTGAACCATTAAAAGCAGCGATGTTATGTTTAATT GCTAATGGTGCGGCGGGTGCCTTTGGTGCAATTGGTTTACCAGTTAGTATTATTGATACGTTTAACTTAAGTGGAGGCGT TACAACATTAGATGTTGCGAGATACTCAGCATTAACACTTCCAATTTTAAACTTTATTATTCCATTTGTTTTAGTATTCA TTGTAGATGGTATGAAAGGTATTAAAGAAATTTTACCTGTCATTTTAACAGTGAGTGGTACATATACTGGATTACAATTA TTATTAACAATATTCCATGGTCCAGAACTAGCAGACATTATTCCATCACTAGCAACAATGGTGGTGTTAGCATTTGTTTG TCGTAAATTTAAACCGAAAAACATTTTCAGATTGGAAGCGTCTGAACATAAAATTCAAAAACGAACGCCTAAAGAAATTG TCTTTGCTTGGAGTCCGTTTGTCATTTTAACTGCCTTTGTATTAGTATGGAGTGCACCATTCTTCAAAAAATTATTCCAA CCTGGAGGTGCACTTGAAAGTCTAGTAATAAAATTGCCAATTCCAAATACTGTGAGTGATTTATCGCCTAAAGGAATTGC GTTGCGTCTCGATTTAATTGGTGCAACTGGGACAGCGATTTTATTAACAGTAATTATTACAATTTTAATTACGAAGTTAA AATGGAAAAATGCAGGTGCTTTATTGGTCGAAGCAATTAAAGAATTATGGTTACCGATCCTTACAATTTCAGCTATCCTA GCTATTGCTAAAGTTATGACATACGGTGGTTTGACTGTAGCAATTGGACAAGGTATTGCTAAAGCGGGAGCAATTTTCCC ATTATTCTCTCCAGTATTAGGTTGGATTGGTGTGTTTATGACTGGTTCAGTTGTAAATAACAATACTTTATTCGCACCTA TTCAAGCGACAGTGGCACAACAAATTTCAACAAGCGGTTCATTACTTGTGGCAGCTAACACTGCAGGTGGTGTAGCAGCG AAACTTATTTCACCACAATCAATTGCCATTGCGACTGCAGCTGTTAAAAAAGTTGGTGAAGAATCTGCATTATTAAAAAT GACGTTAAAATACAGTATTATATTTGTTGCCTTTATTTGTGTTTGGACGTTTATACTAACGTTAATATTCTAA Protein sequence : MTLLTVNPFDNVGLSALVAAVPIILFLLCLTVFKMKGIYAALTTLVVTLIVALFVFELPARVSAGAITEGVVAGIFPIGY IVLMAVWLYKVSIKTGQFSIIQDSIASISEDQRIQLLLIGFCFNAFLEGAAGFGVPIAICAVLLIQLGFEPLKAAMLCLI ANGAAGAFGAIGLPVSIIDTFNLSGGVTTLDVARYSALTLPILNFIIPFVLVFIVDGMKGIKEILPVILTVSGTYTGLQL LLTIFHGPELADIIPSLATMVVLAFVCRKFKPKNIFRLEASEHKIQKRTPKEIVFAWSPFVILTAFVLVWSAPFFKKLFQ PGGALESLVIKLPIPNTVSDLSPKGIALRLDLIGATGTAILLTVIITILITKLKWKNAGALLVEAIKELWLPILTISAIL AIAKVMTYGGLTVAIGQGIAKAGAIFPLFSPVLGWIGVFMTGSVVNNNTLFAPIQATVAQQISTSGSLLVAANTAGGVAA KLISPQSIAIATAAVKKVGEESALLKMTLKYSIIFVAFICVWTFILTLIF |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| glcA | CAE85240.1 | GlcA protein, putative glycolate permease | Not tested | PAI V 536 | Protein | 4e-72 | 43 |
