|
Name : SATW20_05430 (SATW20_05430) Accession : YP_005730556.1 Strain : Staphylococcus aureus TW20 Genome accession: NC_017331 Putative virulence/resistance : Unknown Product : putative glycosyl hydrolase Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 575781 - 577421 bp Length : 1641 bp Strand : + Note : - DNA sequence : GTGTCGAAAGAAATAGATTGGAGAAAATCCGTTGTATATCAAATTTATCCTAAGTCGTTTAATGATACGACGGGGAATGG TATAGGAGATATCAATGGAATTATACAAAAATTGGATTATATCAAGTTATTGGGTGTTGATTATATTTGGTTAACACCAG TGTATGAATCACCGATGAATGATAATGGCTATGATATCAGCAATTATTTAGAAATCAATGAAGACTTTGGAACGATGGAT GATTTTGAAAAGTTAATCAAAGTTGCGCATCAAAAAGACTTGAAAGTGATGTTAGATATTGTCATTAATCATACGTCGAC GGAGCATGAATGGTTTAAAGAAGCCCGTAAATCTAAAGATAACCCTTATAGAGATTATTACTTTTTCAGATCATCTGAAG ACGGGCCGCCAACAAATTGGTATTCTAAATTCGGTGGTAATGCATGGAAGTATGATTCTGAGACAGATGAATATTATTTA CATTTATTTGATGTCAGTCAAGCTGATTTAAATTGGGATAATCCGGAAGTACGTCAATCGTTATATCGCATAGTCAATCA TTGGATAGACTTCGGCGTTGATGGTTTTCGATTTGATGTCATTAACTTAATTTCTAAAGGTGAATTTAAGGACTCTGACA AAATAGGTAAAGAATTTTATACGGATGGTCCTAGAGTGCATGAGTTTCTGCATGAATTAAATCGTCAAACGTTTGGTAAC ACTGACATGATGACTATAGGAGAAATGTCTTCGACGACGATTGAAAATTGTATTAAGTATACACAACCAGAACGCCAAGA ATTGAATAGTGTTTTTAATTTTCATCATCTAAAGGTTGATTATGTTGATGGTGAAAAGTGGACAAATGCGAAGCTTGATT TTCATAAGTTAAAGGAAATTCTGATGCAATGGCAACGAGGTATTTATGACGGTGGCGGATGGAACGCGATTTTCTGGTGT AATCATGATCAGCCACGGGTAGTGTCTAGATTTGGTGATGATACGTCGGAAGAGATGAGGATACAAAGTGCTAAAATGTT AGCTATCGCACTGCATATGTTGCAAGGGACGCCATATATTTACCAAGGTGAAGAAATTGGTATGACGGACCCACATTTTA CATCAATAGCACAATATCGTGATGTTGAATCGATTAATGCCTACCATCAGTTGTTAAGTGAAGGGCATGCTGAAGCGGAT GTGTTAGCGATTTTAGGACAGAAGTCACGAGACAATTCGAGAACGCCTATGCAATGGAGTGATGATGTTAATGCTGGATT TACAGCTGGTAAGCCTTGGATTGATATTTCGGAAAATTATCATCAGGTCAACGTTAGACAAGCACTTCAGAATAAAGAGT CTATTTTCTATACGTATCAAAAATTAATACAATTAAGACATACGCATGATATTATTACGTATGGAGACATTGTGCCACGT TTTATGGATCATGATCATTTATTTGTTTATGAACGTCATTATAAGAATCAACAATGGCTAGTAATTGCGAATTTCTCAGC ATCGGCTGTTGATTTGCCAGAAGGATTGGCTAGAGAAGGTTGTGTTGTGATTCAAACAGGCACAGTGGAAAATAATACGA TAAGCGGGTTTGGTGCAATTGTAATCGAAACAAACGCGTAA Protein sequence : MSKEIDWRKSVVYQIYPKSFNDTTGNGIGDINGIIQKLDYIKLLGVDYIWLTPVYESPMNDNGYDISNYLEINEDFGTMD DFEKLIKVAHQKDLKVMLDIVINHTSTEHEWFKEARKSKDNPYRDYYFFRSSEDGPPTNWYSKFGGNAWKYDSETDEYYL HLFDVSQADLNWDNPEVRQSLYRIVNHWIDFGVDGFRFDVINLISKGEFKDSDKIGKEFYTDGPRVHEFLHELNRQTFGN TDMMTIGEMSSTTIENCIKYTQPERQELNSVFNFHHLKVDYVDGEKWTNAKLDFHKLKEILMQWQRGIYDGGGWNAIFWC NHDQPRVVSRFGDDTSEEMRIQSAKMLAIALHMLQGTPYIYQGEEIGMTDPHFTSIAQYRDVESINAYHQLLSEGHAEAD VLAILGQKSRDNSRTPMQWSDDVNAGFTAGKPWIDISENYHQVNVRQALQNKESIFYTYQKLIQLRHTHDIITYGDIVPR FMDHDHLFVYERHYKNQQWLVIANFSASAVDLPEGLAREGCVVIQTGTVENNTISGFGAIVIETNA |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| malL | YP_251987.1 | oligosaccharide alpha-1,6-glucosidase | Not tested | SCCmec | Protein | 4e-119 | 49 |
