Gene Information

Name : join (SATW20_20390)
Accession : YP_005732024.1
Strain : Staphylococcus aureus TW20
Genome accession: NC_017331
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : ribonucleoside-diphosphate reductase
Function : -
COG functional category : -
COG ID : -
EC number : 1.17.4.1
Position : 2188041 - 2191620 bp
Length : 3580 bp
Strand : -
Note : CDS contains a group I intron

DNA sequence :
TTGAGTAAATGGATCGAAAAAAACAATGAAATTATGAGAAGAGATGAGTTAGGGCAACTTAGCTTATCGAAAGACAAAGA
AGCAATTGAGTTATATTTAGAACACATTAAGAGTAAAACAAAACAATTCTCAAATCAGATTGCAAGATTACGTTACTTAG
TAGAAGAAGATTACTACATTGATGTATTTAAAGATTATAGTGAAGAAACATTATTAGAACTTTTAGACTATGCTTATTCA
TTCGGCTTTGAATTCCAAAGCTTCATGGCAGCAAGCAAATTCTATGATACATACGCATTAAAAACTAGAGATAAGTCACA
ATGGCTTGAAGACTTTGAACAACATAACGTAATCGTTTCTCTATATTTAGCTGGTGGAGATGTTGACTTAGCTAAGAGAT
ACATTAAAGCACATACACTTCAAACAGTACAAACAGCAACTCCAACATACTTAAATGCTGGTCGTAAACATCGTGGAGAA
TTAGCTTCTTGTTACTTATTCACAATGGATGACACATTAAACTCTATCAACTTCATTAGAAGTCAAGTATCACAAGCTAG
TAAGATTGCTGGTGGTGTAGCAGTTAACCTAACACGATTAAGAGGTCGTGGTGCTACATTAAAAGGTGTTAAGAATGTAG
GAAAAGGTATTGTACCAGTTGCTAAATTAATTGAAGGTGAAGTTAGTTATGCTGATCAATTAGGACAACGTGCTGGAGCT
GGAGCTGCTTACTTAAACATTTTCCACTCAGACGTAATTGAGTTATTAAACACTAAGAAAGTTAATGCAGATGAAGATAC
ACGTTTAGCTACACTTTCAATCGGTTTAATTGTTCCTTCATTATTCTTTGATTTAGCAAAGGAAGACAAAGACTTATATA
TGTTTGAACCATACTCAATTCAAGAAGAGTTCGGTAAAGATGTAATCTTAGATGATATTAATATCAATGATTGGTATGAC
AAGTTCGTTGAGAATGAGAATGTTATCAAACACAAAATTAATGCCAGAGAAATGTTAAATCTGATCGCTCAAATTCAATT
ACAATCTGGTTATCCTTATATCATGTATAAAGATAACGCAAACAAAAACCATGCTTTAAATGAGCTTGGAGAAATCAAAA
TGTCTAACTTATGTGTTACTGGAGACACTGAGTTATTAACTGAAAAAGGTTATGTGAAAGCCAAAGACTTGTATGAAAGT
CAAGAAGATTTGAAAGTAGTAATTGATAATAGAACTAAGAATTATGATATTAACAATAAAGGTACTGATATCGTAAATGC
TATTCCAATGCAACTTACAGCTAAACAAGCTGAAATTTATGAAATTACTACTAAACAAGGGTTTAAAATTAAATCTACCG
AATGGCACAAATATTATAGAAAAATAAACGACTCAATTGAAAAAGTTCAGTTAAATCAATTAGAGGTAGGAGATAAGCTA
TTAGTTCAATCTGGTAATGGAAGTTATGGAGATTTTCATGATCCAAAATTAGCATTCTTGATGGGGCTTATCGCTGGAGA
TGGGACATTTGGAAGAGACGGTTCAGTTAAAATTTATCTATATCACGAGAAGCAATATCTTAAAGAAACTATTGAAGAAT
TAGTAGCTTATATTATAGATAAATATAGAAATAAAAATGAGTTTTTACATCATAGTGCAAACTTACATCCTAAATTTGTT
GAAAATAAAGAACTACAAAAATTAACAATTAGCAGTGTTGAGCTATACAAAATATTATCTAGATTTGGATTTAACAGAGA
GACTAAATTGCGATTTCCAAACTTATTAAAAAATGCTACAAAAAATACAATAACTGCTTATTTATCTGGCTTATATCAAA
TGGATGCTTGCGTAAATACAAATGAAAAATATAAAGCAATGAGCATCGAATTGACAACAATCAGTGAAGAATTAGCAAGA
GATATTCAAATGCAACTGTTAAATCTCGGTGTGTATTCATCAATATATCAAAGTGAGAGAGAGATAAGCTTATTACCAGA
TGGTAATGGCGGCATGAAAGAGTACAAAGTTCAAAATACATATAAAATTAGCATTCAAGACAGAAGCTCAAGAGATTTGT
TTATGAAAGAAGTAGCTTTGAAACCTAAAGATATACATAAAGCAATGATTTTTAACTTAACATTGCGACCAAATAGTAGA
AAACCGAAACATGATTTTACTGCCGAAATTACTGAAATTAAATATATTGGTAAAGAAGATGTTTATGATACCACACAAGA
AGATTATCACTCATTAATCTTCAATGGAATTGTGACAGGAAATTGTACTGAGATCTTCCAATACATGCATGTTTCAGATA
TTAAAGATTACAACGAACAAGATGAATTAGGTCAAGATATTATCTGCAACTTAGCTTCTCTTAATATGGTTAAATCAATC
GAAGAGAAAGAAATTGAAGAGTCAATTCGTACTGGAATGAGAGCTTTAACGTTTGTAGCTAACAATTCACGTATCGAACA
CTTACCAACAGTTCATAAAGCAAATAAAAACAATAGAGCAGTTGGTTTAGGTGTAATGTCATTCCATAGTATGTGTGCTA
AAAACAAAATTAGATATGGTTCAGAAGAGTCACTTGATTTACTTAATGTTTACTGCATGATGATGGACTACTATTCATTA
GATGAGTCAATGAAGATTGCAGTTGAAAGAAATGACAAATTCTATGGTTTTGATCAAACAGATTATAAAGCTAAAGATGA
TAAAGAGTTTGGAGAATACTTCTATAAAAACAATCGTGTAACTAAGAATGTAGAACCAATTACTCCAAAAATTAAAGAAA
TCTTTAAAGGTATTTACATTCCTACTAAAGAAGACTGGCAACGTTTAGCTAGAGAAGTTGATAAGAATGGTTTATATAAC
TCATACAGATTGTCCATTGCACCTTATTGATTAGGGCGGTAATAAATAAATATTATTGATAAATCTCTTGAATTGCGAAG
AAACCCTTAGAGCTTTAAGTACCAAAGTGTAATAATCTTAAAGATTGGGTAATACGCAGCTAAACCTTTTAAGTGTATGA
AATACTTAAAAGGAGAGTTCAACGACTATTCCGTTGCGGGAAGTACACTCAAGTGAGTGGAAGCGGGAGATGGCTTACTT
CAAAGTAAGTTGTGATATAGTCTGCTCTTATATGAAAATATAAGCTGTCAAAAATTGACGGGTTAAGATTAACGACCTTA
ACTGAACATAAAGGACACAATCAATAAGTTACATCACAAACTGTTCATCAGCATTAACACCAGTTGTAGATGTTGTAGAG
AAACGTAAATATGGTAACTCAGAAACTTATTATCCAATGCCTTACTTATCACCAGAAACAATGTGGTTCTATTCACCAAC
TGCATTTGATATTCCTCAAGAACATATCATCAATGTAGCGGCAGTAGCTCAGAAGTGGATAGATCAAGGTGTATCAACAA
TCTTATTTGTTAACAGTGAGATTGAAACAAACAAACTAGCAAGATTATATGCATATGCACATGATAGAGGACTTAAATCA
CTCTATTACACAAGAAACAAACTTATCAGTATCGCTGAATGTACAAGTTGTGCAGTTTAA

Protein sequence :
MSKWIEKNNEIMRRDELGQLSLSKDKEAIELYLEHIKSKTKQFSNQIARLRYLVEEDYYIDVFKDYSEETLLELLDYAYS
FGFEFQSFMAASKFYDTYALKTRDKSQWLEDFEQHNVIVSLYLAGGDVDLAKRYIKAHTLQTVQTATPTYLNAGRKHRGE
LASCYLFTMDDTLNSINFIRSQVSQASKIAGGVAVNLTRLRGRGATLKGVKNVGKGIVPVAKLIEGEVSYADQLGQRAGA
GAAYLNIFHSDVIELLNTKKVNADEDTRLATLSIGLIVPSLFFDLAKEDKDLYMFEPYSIQEEFGKDVILDDININDWYD
KFVENENVIKHKINAREMLNLIAQIQLQSGYPYIMYKDNANKNHALNELGEIKMSNLCVTGDTELLTEKGYVKAKDLYES
QEDLKVVIDNRTKNYDINNKGTDIVNAIPMQLTAKQAEIYEITTKQGFKIKSTEWHKYYRKINDSIEKVQLNQLEVGDKL
LVQSGNGSYGDFHDPKLAFLMGLIAGDGTFGRDGSVKIYLYHEKQYLKETIEELVAYIIDKYRNKNEFLHHSANLHPKFV
ENKELQKLTISSVELYKILSRFGFNRETKLRFPNLLKNATKNTITAYLSGLYQMDACVNTNEKYKAMSIELTTISEELAR
DIQMQLLNLGVYSSIYQSEREISLLPDGNGGMKEYKVQNTYKISIQDRSSRDLFMKEVALKPKDIHKAMIFNLTLRPNSR
KPKHDFTAEITEIKYIGKEDVYDTTQEDYHSLIFNGIVTGNCTEIFQYMHVSDIKDYNEQDELGQDIICNLASLNMVKSI
EEKEIEESIRTGMRALTFVANNSRIEHLPTVHKANKNNRAVGLGVMSFHSMCAKNKIRYGSEESLDLLNVYCMMMDYYSL
DESMKIAVERNDKFYGFDQTDYKAKDDKEFGEYFYKNNRVTKNVEPITPKIKEIFKGIYIPTKEDWQRLAREVDKNGLYN
SYRLSIAPYRTQSISYITNCSSALTPVVDVVEKRKYGNSETYYPMPYLSPETMWFYSPTAFDIPQEHIINVAAVAQKWID
QGVSTILFVNSEIETNKLARLYAYAHDRGLKSLYYTRNKLISIAECTSCAV

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
SERP1513 YP_189078.1 truncated ribonucleoside-diphosphate reductase 2, alpha subunit Not tested ¥ÕSP¥â Protein 0.0 99