Gene Information

Name : hlb (SATW20_19320)
Accession : YP_005731919.1
Strain : Staphylococcus aureus TW20
Genome accession: NC_017331
Putative virulence/resistance : Virulence
Product : phospholipase C precursor (pseudogene)
Function : -
COG functional category : -
COG ID : -
EC number : 3.1.4.3
Position : 2108276 - 2153895 bp
Length : 45620 bp
Strand : +
Note : CDS is disrupted by the insertion of a prophage after codon 61

DNA sequence :
ATGGTGAAAAAAACAAAATCCAATTCACTAAAAAAAGTTGCAACACTTGCATTAGCAAATTTATTATTAGTTGGTGCACT
TACTGACAATAGTGCCAAAGCCGAATCTAAGAAAGATGATACTGATTTGAAGTTAGTTAGTCATAACGTTTATATGTTAT
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AATAAGCCGTCTATTTGATATTTATATTATGGTGTGTTAATTTATATATATAAAAAGGGCAACATGCGCAAACATGTTAC
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CCTTATACTCAGATAGCCACCATCTATCCAACTTGCTCAAAGCATATTATAGCACATATACTTTTTTTACTGCTTGTAAA
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TGCAGTATGCTTCCTGTCTTTTTAGCTGTGTAATACCATGTACGTACCTCTTTTCAATCAAAATAAAAAGCCAGTGCCGA
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CTCCCTTAAGGTAATAACGCAGTAATTGATGCAGTAATGACTGCAATCATAACAATTGTTACAAGCGCCCATATGGCACC
TACGAGCCATTTATTTTGGGCGAGTGTCTTTTCTTCATTTTTTTGCGCAACATCTACTTGCGTTTGATATCTTTCTTCAA
TTCTGTTTAATATCTTTGTTTGCTCTAAATTCTCATCTACAACTTTATCTTGCTTATCTTTAAGTTCTTTATGAGATTCT
CTTAGTTCATTATGATGTTGCTTATGTTCCTCTCTAAGTTCAAGCACATGATCAGCTGTTTCGTTTGCTAGTATTTCAAC
ATCATCAACACGTTCAACTAATTCAGAAAGCTCTTTTTTTATTTTCTGAATATCATCCAAAACTACACCTACTTTCTAAG
AAAGCTATGAGCGTAATGCTCATAACTTAGTATAGTTACATTGTTTCGCTATCAACTGATTTATCAGATGACAAGTCAGT
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TCTTTTTAGCGTTTTCCTCAGATTTAAAATCTTGTGCATAACTTGCTGAATCGGACGTTGTAAAACTGCCTACAAAATCT
TGATACAAAACGCGCTCTGTTCCCTCTTTGTCAATTTGTACTAAAATAAATCTCTCTGTTTTTTTGATAATTTCATTTGC
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TTTGTTCTTGTATATATGCTTTTAACATTGCATTTTCTTGTGTTACTCTTGTGATTTCTTGCGATAAATAGTGAATTGTA
TATTGTGGATTGGCTTGTAAACCTTGATTGCTATCATTCATTTATTAATTCCTCCAGTTTTTCGATTTTTGATTGCTGGT
TTTTAATAATAGGTATTAAATGAACCCAAAGTCTATCGTATGCGATACCTTCGATTTCTCCGTTGTCATCATAAATAACA
AATTCATTAAATCCTAATTCTTCAACCTCTTCCGCTATTAAGCCAGTATGTCGACTAAGTTTAAAAGTATCATCAGATAA
CTTTTTACCACTTTCCAATTCTTTAGCCATTATTTCCGATTCATATTTGTCAAACCATGTACGAATTGGAAGCTTTAAAA
TCTCTTTTGAATGACTGAACTGATCGTCTTCATTGATGTATTGGTTTTCGATTGAAATTTTATACTTTTTGGCAGAAGTA
GCACGCCCAATTGTTCCAGCAGAAGTAATGTGTAAGTTAGCAGGTGCTGAATAAGTACGCTTATAAATAGAATTAGAAGC
GACTCTATCGCCAGCATTATCAGAACCTACCGCCAATAAATCATAACTTTGAATGCTAACGTAACTATTTCCATCTCTTC
GTTTAACTAAGTTGAATTTGCCCATACCTGATTCAATTGTAGTGTCTCCGCCTGTAGCATAGTCACCATTAACGACTTGA
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ACCGTCAGTTTCGTATGCACTATCAGCGTTTGATAATGTGAATGCGAATCGGTTTAAACCAGGTTTATTTTTGGTGTTCG
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GTTAAAGCGACTACACCGCCATAAGAATTGATTGTTATGCCATTCATACCGCTATCACTGTAAGTTTTATCCCACCATTG
AATAGTACCGGATGAACCTCCGTCTTCGCCTTCACCATCAATATAAGTCGAAATACCAAAATGTGACATATAAAGTGAAC
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CTCGCATATTTTGGATAAGAAGGTTTATTTCTCTATTACCGTTAATATCAATTTTATCAGCATTTAATCTAATACCACGT
GGCCCCACATTCAAAGCTTGAGCCACTCCGTTATCATCATATCTGATTGTTGTTCCATCTGTAACATTTTGAACAATCTC
GTTTAATATATTTGAAAGTGTACGATTGGTTGCATTAAACTCTTCTTTAGTAGTTCTTAATTTGATTTCCTTACCATTTT
GTATAATTTGAGAACCATAGCGAGTCAATGTTTTCCTCTGTGCATCTGTGCTTTCTTTGACCTTGTTGTCTGTATAAGCA
TTAGCTTTCTTTTCAGCGTTTCTAGCCTTTAGTTCTGCGTTTTGTTTTGCCTCTTCAAGTTTAGCTTGAGCATCTTGTAT
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TGTATGATTTTAAAGCTTCTTGCGCTTCTTGATTTGCTTGTTCAATACTTGCTTTAATCTCAGGATTATTGGACAAATCA
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TTTTTACATAATCACGTAATTGTTCTTTTGTGGATTCTCTAGCTGCTTCAATAGCTGATTTAACAACATTAGGTTCTCCG
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TTCCAATATCTACGCAAGACAGCAACATCAGGGTTACTTGTATCATACCAAAGCGTATCATTGACTGGATTTTCTGGCGG
TGTATCACTTTTATGAATTTTGCGTTCAAAGTATTCTAATTCACCATCTACAACATCTTTTACTATAGTATTGATATTGC
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TTAGGTTGACCGAATGTATATGTGCTATTTTCTGAAATTATGTTATATTCTTCAGCAATAACTTCTGCCTCTACATACAA
TGGCGGGTTAAAATCTCTATGTTTTACTCTGACTGTATCGCCAATTGATATAATCTCGTGCGGATACGTAACTTCCAAAT
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TCATTCATATTTTGATCATCTGATTGTGGTTCATATATCCCCCAAATATAGCGCATAGGTAGGTTGAATTGACTTTGCGC
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CTGACATATCAATCTTCCTAGTTAACCCGACTAAATCTTTACCATATTCAATTTCTTTACCTTTGAATAAGCTGTTTTTC
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TCTATCTTGCCATTTAACCGTCGTATCAAAGACGTTTTCAGGTTGTATGATTAATTCACTGTACCCAGAATCAACATTGA
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CTGATAGTCGTATATCTTTTTGGGGTCTCCTTTTTGGTTATACAACGTAACAACAATATGTCCTATTTTTCTATCATGAT
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CTTGGTCTGAAATCGCAGTATTTTTATTTCCTGTTACTGAATATTTGTAAGGGTCTGTTAGTACTACTTTGATAGTGAAC
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TTGTAATTTAACTTGTTCCTCGTAGTTAAAAAACTTTACTAATTCATTCAAGACGTCATCATGTGTTTTAATGCCGTTGT
GAGATAAATAGTCATTACGTACCACCAAAGGTATATCAAAACTATAAGATTCAAGCCTACGCCCTTTATATATAGACCCC
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TTGCCTTTCTCGCTTTTCTATAGACGCGTTCACCTTTTTATCAAAAGCGTATTCGTCAATAATCGGCTGATAATCTTTAT
CTGCAATCACATCGTTAGATTGTGCTATTTTCAGTAATAAAGCTATTTGTTGTTGCTGTTGTTCAATCATTTTCAATAAT
AAGCTAGGATCATCAAACCCGTTTAAGTCTGATAATTGGCTAGGACGCTTATTTTTACTCGCTTTTTTCCCTCTTACTTC
TGCTGCTGCATAATGCAAAATCTTCATTGCATCATTTCTACGAGCTGGATCTGTTGGAATAATCCATTCTGGATGACCGT
CTTCACCTAAGTTATACCAACCATCAAAAACTTTTCCACCTGTAGCATATGCGTAATCACCAGCACGTTTAAAACCACCC
CAACCATATCGTCTAACAATGTACTGCATTGCTGAGATACCTTGATGTACTGGATTATTATAATTAGTGTACCCTCGTTT
AGCGTTAGCTCTAAAAGTTGAGCCGATAATTTGGAATAATCCTCTAGACGGGTCTCCTCTTTGAGCATTAATATCCCAAT
TATTCACTGCATTTGATTGATAGTTGCTTTCACGCTTTGCAACTCGCATCATCTGGTCATGAATCCACTTACCTTTATAA
CGTCCTCCTAAAATACTTTGCGCTTGTCGGATTACTCGGCTGGCATAAGTTGCACCACTTCCAGAAGTAGCATCACCGCC
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CTAGGTGGTGATTTGCTAAAGTTTTTCAAATGCGCAAATAGCATATCGATAACGCCACTAGTAATTTTTACATAGTTACC
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CGACACCTTCATGAAATGGTCTTCCAGTTGCAGCGGTATAAGCTGCGGTACGTCCATAATGATAATTAATTTTGTCAGGG
TCTAATATTCCGCCGACTAAATCGCCACCGCCCATAGCTTCTAAATTTTCTTTTATCCAATCAGTAGCACTTTTCTTAAT
CTTAGACCATGCAGCTTTTGTTATGTCGCCTGCAATTCCCATTCCTTTAGTTAAAGAATTGAAATCAATTCCAAAAGCTT
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TAGTATCTGTATTTGGTGTGATTACACGTTTACCATTAGGGAATTCAATCATTTCGTTTCTAAAACCATTTGGACCATTT
CCGCGTCCCTTATCTCCAACTGTAGCGAATGTGTCACGTGCAATCTTACCGTTCTTAACTAATCTTGTAGTAGTATGTGT
GTGCTCTGTACCAGTATGTAACTTAGGTATTTTATCCATGCCCAACTTACCACCGACCCAGTTTAAACCGTCGATTAATT
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AATATTTGACATCCAATTTCTTAAATTACTAAAAATTTCTTTCGTCGCATTCCATAAATTAGTAAATTTTGATTTGACGC
CACTAAATAATGACTGCGCTTTTCCTATCGTATTCGTACGGATACTACTCCAAGTATTAGATAACCAATTTTTCATATTC
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GAATATACTTTTTATTACGTCCCAAATACCTGCTATTAATCCTTTTAGCAATCCGCCAAAGTACCTAACAACGCCAAGTA
TTTTGCCTACAAACCATAATTGAATTAAATTCCATATTAATTGAACGACTCCTTTAAGAATCATAACAATCGCATCCCAA
ACTCCTCGCCAATCTCCAGTAAATAAACTTGAGAAGAACTTAATTAAACCTAGTATGATATTTAAAGCTCCTTGTATCAC
ACCTTTTATATTCTCCCAAGTACTGACAATTAAAGCTTTAACCGCCGGCCAAATAAATTGCATCACTTGCCAAATCGCGA
ACATGATTGGTTTAATTACAAAATTTATAATAAATTCAAATATAGCTTTGATAAAATTGCATATATTTTGAAGCGCTTGA
ACAATAGAAATTCCGTTTTCATTAAAGAATCCATTAATTTGACTCCAAATATCTTTAGCAAAATCAACTATTGCTGATAT
CGCTTGTTTAAAGATGTTTTTAACAGAATCAATGAAAGGTTGAATAAATTGAATAAAATTACTAAATGTTTGTTTAACAC
TTTCAATTGCACCATTAACAAAATTTCTGAAAGTTTCAGATTTCTTATAAGCAATTGTAAATGCGACTGCTAAGCCAGCC
AAAACACCTAATACAATGCCAATTGGACCAGTTAAAGCCGTGAAGACAGTTCCTAATATAGGTACTTTAGTCGATAAAAA
ACTAATTAATCCATCAGCCTTTGCAATACCAGCTAATAGTGGGGCTAATACAGTTACTGCATTGCCAATTGTACTTATAA
ATGCGCCTAATCCAAAAACTACAGGACCAATTGCAGCAGCAATACCACCGAAAATAACAATTGATCTTTTAGAACCATCA
CTTAAATTGGAAAACCAATCAACCGCTATAGATAGCTTTTTGATTAATTCTTCCATTACTGGTGCAAACGCACTTTCAAT
AGAAGTCCATACATCAGCACCTACTAATTTTAATTTATTCATTGCTACTTTAAATCTTTCGGAGCCACTTTCAGAATCTT
TAAACGTTTGATTTACTGTGCCTTGGGAATCTTCGATAGTTTTTAAAAATTCTTGATAACTAAAACGACCACCTTTAATA
GCATCTGCTAAATCAGGACCTGCTTTTGCACCAAATGCTTCAATCGCTAAACTTGTTGCGCTAGCTATATCCGGCGTCTT
TTCAATTTCTGCTAATGTCTTCTTAAATTCTTCTCTTGGATTTTTACCAGCTTTACCCCAATTGGATATAGCTTTTTTCA
AACCACTGAAGGCTATTTCAGTATTAACACCTGATTTCTCCCATTGAGAGAATAAAGCGATTGATTCTTTCATCTCAAAG
CCCATAGCCCTCATTGGAGCACCGTATTTAGTAATGCTATCAGCTAATGTATCAACACTTATACCGCTAGCCTGTGCTGC
TTTCGCTACCATATCAAGTACACTTTGATACTCATCAGCTTCAATACCTGCATCACCCATTGCACGCGTAATTAATTGAA
CGGCTTGTACGCCTTCAGAACCTGTTATGTGACTAAATTTCAAGAATGACTCTGTGGCACTCTCAAGTTCTTTGCCAGTG
AAACCTAACCTTGTGTTAACTTCCCCTAAAACACCGCCTACAGTCTCAGCATCTGCTGGAAAGTTGCCATAAACATCTTT
AAATGAATTCTGCAACTTCTTAAGCTCTCCGCCGGTTGCTCCTGTTGCTTGGGTAACTGTATCTAAACCTTTATCAACTT
CTGCAAAAGCTTTTCCTGATGCTGCTGCAATACCTAAAACAGGTGCGGTAACACCAATCATCATACCTTTACCAATAGAT
TTTAAACCATCACCCATTTTTGTTAATTTAGGTCCCATACTTTCAAAAATTTTACTGGTTTTCCCCCAGCCACTTTCTGC
CATTCTTTGAGCTTCAACTTGGGCTTTTTTGAACTCTTCAAACTCAGCCGATGTTTTTTGCAATTCTCTTTCTAAATAAT
TCAGCTCATTTGCTTGTTTGTTATATTCTTGCCGTAATTTTTGAGCTTCTGCACTGTTTTCACCCTGTTCTTGAGATACC
TTGTCATATTGCTTGGCTAAATCATCAACATTTTTCTTATAACCTATGATAGTTCCGTCAAGTTCTTTAATCCTTTGTTG
GTAACTATCAGTTGATTTTTCGGTATATTTGAAGTTGTTGCCGGTTAACTTTAAGTCAGAATTTAAAGTTTTAAAGTTTC
GTTTGATTTCTGCAAATGATCTATTTAAATTTGCTGCATCCAAATCCAAACCTATAGATAAACCTTTTATTCTTTCTCCC
ATTTTTTACCTCCTTTCTAAAAAAGTTCAAAAAAATAACCCTAACCAAACGGTTAAGGTTAAAATGCATCAATTAAAGCC
TCTGCTTTTTCTTCAGAAATGTCATTGTTTTTATTTTGATATATGGAAAGTACATAATGAAATGGCATTTTTAAAACTTC
GTTAGCGTCTTTACCATTTTCAATTAAGTCCATCATGAGAGTATCCATATTTTTCAACATTGCTTTATATGTTAAATCTT
CAGGCTTTATTTCATGTTCTGGATAAAATTTCTAGTTTCCTCAGTTTGCTGACCTTGAGTAATGAAAATTACTTGTTCAC
GAAGTGCATTCATTCCATCAGGTGCATGCATACGTTCTTTTAAGTCTTTAACTGTGAATTGGTTATCGTAAATTTTTACA
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TCAAAGCCTATAGTAAATAG

Protein sequence :
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VVIFNEAFDNGASDKLLSNVKKEYPYQTPVLGRSQSGWDKTEGSYSSTVAEDGGVAIVSKYPIKEKIQHVFKSGCGFDND
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LKNLNVNDVLYAGHNSTWDPQSNSIAKYNYPNGKPEHLDYIFTDKDHKQPKQLVNEVVTEKPKPWDVYAFPYYYVYNDFS
DHYPIKAYSK

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
hlb NP_646757.1 truncated beta-hemplysin Not tested ¥ÕSa3 Protein 2e-125 99
truncated-hlb NP_372527.1 hypothetical protein Not tested ¥ÕSa3 Protein 2e-124 99
hlb NP_375112.1 hypothetical protein Not tested ¥ÕSa3 Protein 6e-125 99
unnamed CAA70683.2 sphingomyelinase-c Virulence LIPI-2 Protein 5e-72 56

• Homologs from VFDB (virulence genes)

GeneGenBank Accn Product ID of source DB Alignment Type E-val Identity
hlb YP_005731919.1 phospholipase C precursor (pseudogene) VFG1798 Protein 2e-139 100
hlb YP_005731919.1 phospholipase C precursor (pseudogene) VFG0674 Protein 3e-72 56