Name : polA (OG1RF_10606) Accession : YP_005707663.1 Strain : Enterococcus faecalis OG1RF Genome accession: NC_017316 Putative virulence/resistance : Unknown Product : DNA-directed DNA polymerase I Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : 2.7.7.7 Position : 639919 - 642567 bp Length : 2649 bp Strand : + Note : COG: COG0749; Pfam: PF02739,PF01367,PF00476; InterPro: IPR002298 DNA sequence : ATGACCAAAAAAAAATTATTACTCGTTGATGGAAACAGTGTAGCCTTTCGTGCATTTTTTGCGCTACATAACTCATTAGA ACGATTCAAAAATAAGAACGGCTTGCATACAAATGCTATTTATGCGTTTAACAATATGTTTGAAAATGTAATGCAAAAAG AAATGCCTACTCATGTTTTAGTCGCTTTTGATGCAGGGAAAACCACATTCAGAACAGAATTTTATTCAGAATATAAAGCC GGACGTTCAAAAACACCGGGGGAATTTAAAGAACAAATGCCGTATATTCGTGAACTTTTAGAAGGTTTAGGCGTAAAATA TTATGAACTACCTAACTATGAAGCAGATGATATTATTGGTACATTAGCCAACAAAGTTGATAAAGATGAATTTGATGTTG TCGTGTTATCAGGGGACCGAGATTTGACACAATTAGCGACGGACACTGTCAAAGTAGATATCACTGTTAAAGGAGTTAGC GATATTGAATCATATACGCCTGAGCATATTGCTGAAAAATATGATGGATTAACGCCTAAGCAAATTATTGATATGAAAGG GTTGGCTGGCGACACGTCGGATAACATTCCAGGTGTAACGAAAATCGGTGAGAAAACCGCGATTAAGCTGTTAAAACAAT ATGGCTCAGTTGAAGGGGTTTATGAGAATATCGATGAAATGAAAAAAAGCAAAATGAAAGAAAACTTGATTAATGATAAA GAGCAAGCATTTCTTTCTAAACGTTTAGCGACAATTGAAGTCAATGCACCAGTCGAAGTCAATGTAGAAGACTTGGCATA TGAAGGGAAAAACTTAGAAAAATTGGTTCCTTTTTATAAAGAAATGGACTTTAAACAATTTTTAGCTAAGTTGGACATTA CAGAAGAACCTGTTGAAATGGAAGATATTTTATTTGAAGTAGTCGAAGATCAGTTAACCAATGAAATGTTTACAGACGAT ATGGCTCTTTATGTTGAGATGATGGAAGATAACTATCACACGTCACCGATTGTCGGCCTTGCTTGGGGCAACGACAAGAA GATTTATACCACGAATAATTTAGCTGTTTTTGAAAGTCAGCCATTTATCGATTGGTTGATGGATGAGACACGTAAAAAAA ATGTCTATGATGCAAAACGGACGTACGTTGCACTAAATCGCTATGTAGGAAAAATGACAGGGATTGCCTTTGATGTTTTA TTGGCTGCTTATTTACTTGATACCAATGACAATAACGCTGATATTGAAGGTGTAGCACAACATTACGGATATGATGCGAT TCAATCTGATGAAGCCATTTATGGAAAAGGGGCCAAAAAAGGCTTGCCAGAGGACGAAGAAGTTTTCTTTGGTCATTTAG CACGTAAGATTAAAGCAATTCAATTTTTAACAAGCAAATTAGATAGCGAATTAACAGAAAAAAATCAAGCTGATTTATTC TATAAAATGGAATTACCACTTTCTCGTATTTTAGGCGATATGGAAATAACTGGTATCCGTGTTGATGCCACACGCTTAAA AGAAATGCAAGTAGAATTTTCAGAACGCTTGAAAGAAATCGAAGAAAAAATCTATGCAGAAGCTGGCGAAGAATTTAATT TGAATTCACCTAAACAATTAGGCGTTATTTTATTTGAAAAAATGGGCTTACCTGTGATCAAAAAGACGAAAACTGGCTAT TCAACAGCGGTAGATGTTTTAGAACAACTAAAAGAACAAGCACCAATTGTGGCAGATATTTTAACTTATCGTCAAATTGC CAAAATTCAATCGACCTATGTTGAAGGACTCTTAAAAGTAATTCAGCCAGATAATAAAATTCATACTCGGTATGTACAAA CACTGACACAAACAGGACGATTAAGCTCAGTAGATCCCAATTTACAAAACATTCCTATCCGTTTAGAAGAAGGCCGAAAA ATTAGAGAAGCGTTCGTACCAAGAGAGGATAATTGGTTGATTTTCTCTTCTGATTACTCTCAAATTGAGTTACGTGTGCT CGCACATATTTCTAATGATGAGCATTTAAAAGAAGCGTTTGTGGAAGGACAAGATATCCATGCCAGCACTGCAATGCGAG TTTTCGGTGTTGAAAAAGCAGAAGATGTCACACCTAACATGCGTCGTCAAGCTAAAGCGGTGAATTTTGGAATTGTCTAT GGTATCAGTGATTATGGCTTGTCCCAAAACTTAGGCATTACTAGAAAGCAAGCGCAACAATATATTGACACCTATTTTGA AAAATATCCAGGTGTGAAACAGTACATGGAAGAGATTGTCCGCGATGCCAAAGACAAAGGCTATGTGGAAACATTGTATC ATCGCCGTCGTTATTTAAGTGATATTAATTCAAGAAACTTTAATCTACGTTCGTTCGCTGAACGTACAGCGATTAATACA CCGATTCAGGGAAGTGCCGCAGATATTTTAAAAATTGCGATGATTGAAATGGCGCGTCGTTTAAAAGAAGAAAAATTACA AGCGACAATGTTATTACAAGTGCACGATGAATTAGTTTTTGAAGTACCAGAATCAGAATTAGAACAATTAAATCAACTCG TCAAAGAAGTGATGGAGCACGCAGTTTCCTTACATGTGCCACTTATCACCGATAGCAGTTGGGGAAAAACATGGTATGAA GCAAAATAA Protein sequence : MTKKKLLLVDGNSVAFRAFFALHNSLERFKNKNGLHTNAIYAFNNMFENVMQKEMPTHVLVAFDAGKTTFRTEFYSEYKA GRSKTPGEFKEQMPYIRELLEGLGVKYYELPNYEADDIIGTLANKVDKDEFDVVVLSGDRDLTQLATDTVKVDITVKGVS DIESYTPEHIAEKYDGLTPKQIIDMKGLAGDTSDNIPGVTKIGEKTAIKLLKQYGSVEGVYENIDEMKKSKMKENLINDK EQAFLSKRLATIEVNAPVEVNVEDLAYEGKNLEKLVPFYKEMDFKQFLAKLDITEEPVEMEDILFEVVEDQLTNEMFTDD MALYVEMMEDNYHTSPIVGLAWGNDKKIYTTNNLAVFESQPFIDWLMDETRKKNVYDAKRTYVALNRYVGKMTGIAFDVL LAAYLLDTNDNNADIEGVAQHYGYDAIQSDEAIYGKGAKKGLPEDEEVFFGHLARKIKAIQFLTSKLDSELTEKNQADLF YKMELPLSRILGDMEITGIRVDATRLKEMQVEFSERLKEIEEKIYAEAGEEFNLNSPKQLGVILFEKMGLPVIKKTKTGY STAVDVLEQLKEQAPIVADILTYRQIAKIQSTYVEGLLKVIQPDNKIHTRYVQTLTQTGRLSSVDPNLQNIPIRLEEGRK IREAFVPREDNWLIFSSDYSQIELRVLAHISNDEHLKEAFVEGQDIHASTAMRVFGVEKAEDVTPNMRRQAKAVNFGIVY GISDYGLSQNLGITRKQAQQYIDTYFEKYPGVKQYMEEIVRDAKDKGYVETLYHRRRYLSDINSRNFNLRSFAERTAINT PIQGSAADILKIAMIEMARRLKEEKLQATMLLQVHDELVFEVPESELEQLNQLVKEVMEHAVSLHVPLITDSSWGKTWYE AK |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
polA | YP_281523.1 | DNA polymerase I | Not tested | Not named | Protein | 0.0 | 58 |