Gene Information

Name : H04402_01478 (H04402_01478)
Accession : YP_005678028.1
Strain : Clostridium botulinum H04402 065
Genome accession: NC_017299
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : arginine/ornithine antiporter ArcD
Function : -
COG functional category : -
COG ID : -
EC number : -
Position : 1596808 - 1598328 bp
Length : 1521 bp
Strand : +
Note : -

DNA sequence :
GTGACAAAAAAGAAAAAGAAAATAAGCTTTCCGACAGCTTTTACGGTATTGTTTATTGTATTAATTATTGCAGCTATACT
TACTTATGTAGTTCCAGCTGGATCTTATTCAAAATTAAGTTATGATAACGATAGTAAAGTTTTTGTTGTAACTAAACCGG
ATGAATCGACAAATGAATTACCAGCAACACAAAAGACTTTGGATAAACTTAAGATTAAAGTAAGTGTAGAAAAATTTAAA
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GGTTCCAGTTTTTATAGCAGCAGGATACGATGCTTTAGTTTGTATTGCAGCCTTGTATATGGGATCATCTATAGGTACTA
TGTTTGCTACGGTAAATCCTTTTTCTGTTGTTATAGCATCTAATACTTCAGGAATATCTATTGCTTCAGGATTTATATTT
AGAATTGTAGGACTTATTTTAGCAGTAGCTATAACTATTGTTTACATTGTAAAATATGGAGTTAAGGTTAAAAAAGATCC
AAGCAAATCTATAATATATGAACAAAGGAAAGAAATACAAGAGAAGTTTTTAAAAGATTATAGTAAGGATGATGTTACTC
TAAAATTTTCTTTAGGTCGTAAGCTAATGTTAATAATATTCGCATTAACATTCGTAGTTATGATTTGGGGTGTAGCTTAT
AAAAAATGGTGGTTTACTGAGATGACAGCTCTGTTCCTTGTTGTAGGGATTATTTTAGGTGTAATCTCACGAATGGGAGA
AAAGAATTTTGTAGATAAGTTTGTAGCTGGTTCAGCTGATTTGGTAGGAGTTGCATTAGTAATTGGAGTTGCAAGATCTA
TTAATCTTGTTATGGAAAATGGAATGATTTCTGATACAATTTTGTATCATTCTTCAAATATGATATCAGGAATGAATTCT
AGTGTATTTATAATATTTATGTTAATTGTATTTATAGGACTTGGATTTTTTATACCATCATCTTCAGGACTTGCAGTGCT
TTCAATGCCTATTATGGCACCTCTAGCAGACAGTGTAGGATTGCCAAGAGAGACTATAGTAAATGCTTATATGTTTGGCC
AGGGATTAATTTCATTCATAACTCCAACAGGGCTTATATTAGCTACATTAGCTATGGTAGATGTTACTTATGATAAATGG
ATTAAATTTATAATGCCACTTATGGGATATATAGCAGCCTTATCAGCTATAATGTTATTAATACAAAGCTTTGTTGCTTA
A

Protein sequence :
MTKKKKKISFPTAFTVLFIVLIIAAILTYVVPAGSYSKLSYDNDSKVFVVTKPDESTNELPATQKTLDKLKIKVSVEKFK
DGSINKPVAIPDTYEQVEQKPQGFFEVIEAPIKGVYDTIDIIMFVLILGGVIGVVNSSGAFDAGIAKLSVATKGKEYLLI
VIITTLIALGGTTFGLAEETIALYPILVPVFIAAGYDALVCIAALYMGSSIGTMFATVNPFSVVIASNTSGISIASGFIF
RIVGLILAVAITIVYIVKYGVKVKKDPSKSIIYEQRKEIQEKFLKDYSKDDVTLKFSLGRKLMLIIFALTFVVMIWGVAY
KKWWFTEMTALFLVVGIILGVISRMGEKNFVDKFVAGSADLVGVALVIGVARSINLVMENGMISDTILYHSSNMISGMNS
SVFIIFMLIVFIGLGFFIPSSSGLAVLSMPIMAPLADSVGLPRETIVNAYMFGQGLISFITPTGLILATLAMVDVTYDKW
IKFIMPLMGYIAALSAIMLLIQSFVA

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
SAKOR_01092 YP_008491280.1 Arginine/ornithine antiporter Not tested vSa¥ã Protein 4e-95 46
SAV1171 NP_371695.1 hypothetical protein Not tested vSa¥ã Protein 4e-95 46
SA1014 NP_374287.1 hypothetical protein Not tested vSa¥ã Protein 4e-95 46
MW1052 NP_645869.1 hypothetical protein Not tested vSa¥ã Protein 3e-95 46
SACOL1183 YP_186046.1 hypothetical protein Not tested vSa¥ã Protein 5e-95 46
SAUSA300_1064 YP_493762.1 TRAP family protein Not tested vSa¥ã Protein 5e-95 46