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Name : H04402_01127 (H04402_01127) Accession : YP_005677681.1 Strain : Clostridium botulinum H04402 065 Genome accession: NC_017299 Putative virulence/resistance : Resistance Product : ABC transporter ATP-binding protein Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 1216192 - 1217994 bp Length : 1803 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGGATAAGAAAAAGAAGGGTATTCCAAGGTTGTTGGAAATAGCTGGAGAAAAGCGAGGGTTACTTATTGGTTCATCCAT ATTTTCAGCTATCAGTGCAATTTTGATGCTATTACCATATATAGCGGTTTATTTTATAATAGCAGAGCTTTTAAAAAATG CTGCAAACCCTATAAATGTTAATTCTACACAAATGCTACACTGGGGTACTGCTGCTCTTGTAGGATTAGTAGGAGGAATT GTTTTCATGTATATATCGGGGTTAATGTCTCATACAGCAGCATACAGAATATTATATAGCTTAAGGGTTCGTATGTCAGA GCATATTGGTAAATTACCTCTAGGCTATTTAAGTAATACATCAACGGGGATAGTAAAGAAAACCTTTGAACAAAACGTAG AAAAGATTGAAGCCTTTGTTGCTCACCAGTTACCGGATATGGTAAATGTATTTGTAACAATGATTATTACAATAATTATG ATGCTAACTTTAAATCCATGGCTTACATTGGCTGCTATGGTACCACTTGTTTTGGGATTCTTAATACAGATGAAAAAAAG AAGTGGTAAGGCTGCAGAGGAAAGTGCAAAAAAATACTATAATGCCTTAGAGAGAATCAACTCATCAACTATTCAATATG TAAAGGGAGTGCCTGCTGTAAAGATATTTGGTAGAAACGTATATTCTTTTCGCAAATTTTATGATGATATGATATCTTAT AGGGATTATTGTGTAAAGTATACAGATCAGTATCAAAATACCTATATAACTTCAAAGGTATTATTAAATTCAACTTTAAC ATTTATATTACCAGTGGGTATTCTTTTAATGGGAGGAAGATCAGGAGATTCTTCCTTTGTACAAACTCTTTTATTTTTTA TTATTTTGGCACCAGGAGTTGCGTCACCTATGTTGCGTTTTATGACTTTTGCATCTTCATTAGGAGATATTTCTGAGGGA GTTCAGCGTATTGATAAGATCTTTGCTGAGAAAACTATTTGTGAGGCAAATAATCCTAGGATACCTTCCTCTTATGATAT TGAGTTTGATAATGTGTCCTTTTCTTATGAGTCTGAGGACACATCCACTAGGAAAGAAGCATTATCAAAAGTAAGTTTTA AGGCGAAAAAAGGTTCATGTACAGCACTTGTAGGACCTTCAGGTTCTGGAAAATCTACAGTGGCTAACCTTATTCCACGT TTTTGGGATATTCAAAAAGGTCATATTAGAATCGGTGAGATAGATATTAAAGAAATTTCTACAGAGAATTTGATGGATTT AGTTTCCTTTGTTTTTCAAGATACATTTTTATTTCATGATACCTTATATGAAAATATCCGTGTAGGCAGACCAGATGCCA CAAAGGAAGAAATATTTAAGGCTGCAAAAGCTGCTCAGTGTCATGAGTTTATTACAGGACTTGAAAAAGGTTATGACACT ATCGTTGGTGAAGGAGGCACTCATCTTTCAGGTGGTGAAGAACAAAGAGTATGTGTGGCAAGAGCAATTTTAAAAAATTC TCCTATACTAGTTCTAGATGAAGCTACTGCTTTTTCAGATCCAGAAAATGAGTATCATATGCAGCTGGCTCTAAGAGAGC TTATGAAGAATAAAACTGTTATTATGATTGCACATAGGCTAACAACTATTAAAGATGCTGAAAATATAGTGGTTATGAAA GATGGAACTATTGTAGAGGCGGATACTCATGATGTACTTATAAATAAAGATGGATTGTATAAAAAGCTTTGGAACTCATA TACAGTGGCCTCTAATTGGGGTATAAGTAAAGGAGGGATTTAG Protein sequence : MDKKKKGIPRLLEIAGEKRGLLIGSSIFSAISAILMLLPYIAVYFIIAELLKNAANPINVNSTQMLHWGTAALVGLVGGI VFMYISGLMSHTAAYRILYSLRVRMSEHIGKLPLGYLSNTSTGIVKKTFEQNVEKIEAFVAHQLPDMVNVFVTMIITIIM MLTLNPWLTLAAMVPLVLGFLIQMKKRSGKAAEESAKKYYNALERINSSTIQYVKGVPAVKIFGRNVYSFRKFYDDMISY RDYCVKYTDQYQNTYITSKVLLNSTLTFILPVGILLMGGRSGDSSFVQTLLFFIILAPGVASPMLRFMTFASSLGDISEG VQRIDKIFAEKTICEANNPRIPSSYDIEFDNVSFSYESEDTSTRKEALSKVSFKAKKGSCTALVGPSGSGKSTVANLIPR FWDIQKGHIRIGEIDIKEISTENLMDLVSFVFQDTFLFHDTLYENIRVGRPDATKEEIFKAAKAAQCHEFITGLEKGYDT IVGEGGTHLSGGEEQRVCVARAILKNSPILVLDEATAFSDPENEYHMQLALRELMKNKTVIMIAHRLTTIKDAENIVVMK DGTIVEADTHDVLINKDGLYKKLWNSYTVASNWGISKGGI |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| smi_1698 | YP_003446800.1 | multidrug ABC transporter ATPase/permease | Not tested | The aminoglycoside resistance gene cluster | Protein | 3e-113 | 42 |
