Gene Information

Name : CBF_0645 (CBF_0645)
Accession : YP_005673623.1
Strain : Clostridium botulinum 230613
Genome accession: NC_017297
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : nucleoside transporter, NupC family
Function : -
COG functional category : -
COG ID : -
EC number : -
Position : 706321 - 707544 bp
Length : 1224 bp
Strand : -
Note : identified by match to protein family HMM PF01773; match to protein family HMM PF07662; match to protein family HMM PF07670; match to protein family HMM TIGR00804

DNA sequence :
ATGGAAAAATTTATAAGCTTCATAGGTATTTTTGTTTTCTTAGGTATCTGTTATCTAATATCAGAAAACAAGAAAAAGGT
TAGGTTTAAACTAGTCTTTGCAGGAATCATTATTCAATTTATTTTCGCTTTTTTAATTTTAAAAACATCTATTGGTAAAA
TAACTTTTGAAAAGCTTTCTGATTTTATTACAGCTATTTTAGGATTTACTAAAAATGGTTCAGAATTTTTATTTGGTGGG
CTAGTTAACAATGTGGATAGTTTTGGGTATATATTTGCTTTTCAAGTATTGCCAACTATTATATTTTTCTCATCTTTAAT
GGCAGTTCTATATTATTTAGGTGTTATGCAATTTTTAATAAGACATATAGCTAATTTTATGGCTAAAACTTTAGGAACTT
CTGGTGCTGAATCTCTATCTGCTGCTGCGAACATATTTGTTGGACAAACTGAAGCTCCTTTAATAGTAAAACCTTACATA
GAAAAAATGACAAGATCTGAACTTCATTCTGTTATGGTTGGTGGAATGGCTACAGTAGCTGGTAGTGTAATGGCTGGATA
TATAGGTATGGGAATAAGTTCAGCTCACTTATTATCAGCCTCCATAATGTCTGCCCCAGCAGCTTTTGTGGCAGCAAAAA
TAATAGTTCCTGAAACGGAGGAACCTATAACTAAAGGTAATGTTAATTGCGAAGTAGAAAAATTAGATAAAAATGTAATT
GATGCAGCTGCTAGAGGTGCCTCTGAAGGTCTTCAAATGGCTCTTAATGTTGGAGCTATGTTAATAGCTTTTGTTGCTAT
AATCGCCATGTTAAATGCAGGTTTAGAAGGTATTGGACATTTAGTTGGAATTAATGGTTTAAACTTTGAAAATGCATTAG
GTTATATTTGTGCTCCTTTTGCTTACATAATGGGTATACCATCTCAAGATATGTTAACAGCAGGTTCCCTTATTGGACAA
AAAACCGTTATAAACGAGTTCGTAGCATATTCAAATCTATCCACATTTATAAAGCAAGGAACGTTAAATCCAAGAACAGT
AACTATACTAACTTATGCCCTATGTGGATTTGCTAATTTCAGTTCCATAGCAGTACAACTAGGTGGTATAGGAGAACTTG
CGCCAAAAAGAAGAAGTGAAATTGCCCAGCTTGGAATAAAAGCTCTAATAGGTGGTACAGTAGCTAGCTTCTTAACAGCT
TGTATTGCTGGAATATTAATATAG

Protein sequence :
MEKFISFIGIFVFLGICYLISENKKKVRFKLVFAGIIIQFIFAFLILKTSIGKITFEKLSDFITAILGFTKNGSEFLFGG
LVNNVDSFGYIFAFQVLPTIIFFSSLMAVLYYLGVMQFLIRHIANFMAKTLGTSGAESLSAAANIFVGQTEAPLIVKPYI
EKMTRSELHSVMVGGMATVAGSVMAGYIGMGISSAHLLSASIMSAPAAFVAAKIIVPETEEPITKGNVNCEVEKLDKNVI
DAAARGASEGLQMALNVGAMLIAFVAIIAMLNAGLEGIGHLVGINGLNFENALGYICAPFAYIMGIPSQDMLTAGSLIGQ
KTVINEFVAYSNLSTFIKQGTLNPRTVTILTYALCGFANFSSIAVQLGGIGELAPKRRSEIAQLGIKALIGGTVASFLTA
CIAGILI

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
yutK YP_005163383.1 putative sodium/nucleoside cotransporter Not tested Not named Protein 9e-64 44