Name : potB (CBF_0609) Accession : YP_005673587.1 Strain : Clostridium botulinum 230613 Genome accession: NC_017297 Putative virulence/resistance : Unknown Product : spermidine/putrescine ABC transporter permease PotB Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 672315 - 673277 bp Length : 963 bp Strand : + Note : identified by match to protein family HMM PF00528 DNA sequence : ATGTGGGGGAAATTTAGCAATGCTTTTTCAAATATTTTTAAAAAGCAATTGCATAATAAAAATACAGATATTATTTTAGA AGAAGACAAAGAAGGAATAAGAGGTAAACTAAAAAAATCTACCCCTATATTTAAAACAGTGGGGCCCGTTGCCCTATGGC TCATTACATTTTTTATTGTTCCTTTACTTCTTGTATTAGTGGTTAGTTTTCTATCAAGAGGTGAATATGGAGACGTAAGA TTACCTTTTACATTAAAAAATTATAAAAGACTCATGGATCCTATGTACGGACAAATTTTAATTAAAACTTTAATGATTTC TATTAGTACTACTTTAGGGTGTTTGATTATAGGTTATCCTTTTGCATATTTTATTGGAAGATCAAACAAAAAATATAGAG GAATACTATTATTATTAGTTATATTACCTTTTTGGACTAATTCTTTAGTTCGAACTTATGCATGGATAATACTTTTAAAA ACAGAGGGAGTAATTAACACATATCTTATGAAATTTGGATTAATTCACTCTCCATTGCAAATGCTTTATACAGATGGTGC TGTATTTATAGGAATGCTTTATATAATGTTACCTTTTATGGTGCTACCTATTTATACATCTATAGAAAAATTAGATATGA GTTATGTAGAAGCTGCCAATGATCTTGGAGCATCACCTTACAAAACCTTTAAAGAAATAACGTTACCATTAACTCTACCG GGTATTATAGCAGGATGTATGCTTGTATTTATACCAACCTTAGGTTATTTCTTTATATCTGACTTAATGGGTGGAAGTAA AACTATGTTAATTTCAAATCTAATCAAAAATCAATTTTTAACCTCTAGAGATTGGCCCTTTGGTTCAGCTATAGCAGTAA TATTAATTATTTTAATGCTTATAGCTATAGGTTTTTATTTTAAAGGAAATAAGCCAAAGAAGGGGATAAAGGAGGTTAGC TAA Protein sequence : MWGKFSNAFSNIFKKQLHNKNTDIILEEDKEGIRGKLKKSTPIFKTVGPVALWLITFFIVPLLLVLVVSFLSRGEYGDVR LPFTLKNYKRLMDPMYGQILIKTLMISISTTLGCLIIGYPFAYFIGRSNKKYRGILLLLVILPFWTNSLVRTYAWIILLK TEGVINTYLMKFGLIHSPLQMLYTDGAVFIGMLYIMLPFMVLPIYTSIEKLDMSYVEAANDLGASPYKTFKEITLPLTLP GIIAGCMLVFIPTLGYFFISDLMGGSKTMLISNLIKNQFLTSRDWPFGSAIAVILIILMLIAIGFYFKGNKPKKGIKEVS |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
potB | BAA36746.1 | - | Not tested | LIM | Protein | 6e-60 | 52 |