Gene Information

Name : potB (CBF_0609)
Accession : YP_005673587.1
Strain : Clostridium botulinum 230613
Genome accession: NC_017297
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : spermidine/putrescine ABC transporter permease PotB
Function : -
COG functional category : -
COG ID : -
EC number : -
Position : 672315 - 673277 bp
Length : 963 bp
Strand : +
Note : identified by match to protein family HMM PF00528

DNA sequence :
ATGTGGGGGAAATTTAGCAATGCTTTTTCAAATATTTTTAAAAAGCAATTGCATAATAAAAATACAGATATTATTTTAGA
AGAAGACAAAGAAGGAATAAGAGGTAAACTAAAAAAATCTACCCCTATATTTAAAACAGTGGGGCCCGTTGCCCTATGGC
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TTACCTTTTACATTAAAAAATTATAAAAGACTCATGGATCCTATGTACGGACAAATTTTAATTAAAACTTTAATGATTTC
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GGTATTATAGCAGGATGTATGCTTGTATTTATACCAACCTTAGGTTATTTCTTTATATCTGACTTAATGGGTGGAAGTAA
AACTATGTTAATTTCAAATCTAATCAAAAATCAATTTTTAACCTCTAGAGATTGGCCCTTTGGTTCAGCTATAGCAGTAA
TATTAATTATTTTAATGCTTATAGCTATAGGTTTTTATTTTAAAGGAAATAAGCCAAAGAAGGGGATAAAGGAGGTTAGC
TAA

Protein sequence :
MWGKFSNAFSNIFKKQLHNKNTDIILEEDKEGIRGKLKKSTPIFKTVGPVALWLITFFIVPLLLVLVVSFLSRGEYGDVR
LPFTLKNYKRLMDPMYGQILIKTLMISISTTLGCLIIGYPFAYFIGRSNKKYRGILLLLVILPFWTNSLVRTYAWIILLK
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• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
potB BAA36746.1 - Not tested LIM Protein 6e-60 52