|
Name : nifJ (MOUSESFB_0521) Accession : YP_005668239.1 Strain : Candidatus Arthromitus sp. SFB-mouse-Yit Genome accession: NC_017294 Putative virulence/resistance : Virulence Product : pyruvate ferredoxin/flavodoxin oxidoreductase Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 605511 - 609044 bp Length : 3534 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGACTGTTGATGGTAATGGTGCTGCAGCATATGTCGCATATGCATTTACAGAAATAGCAGCTATTTATCCTATATCACC TTCAAGTGGTGTTGGAGAAAATATAGATGAAATGGCATCACAAGGCAAAAAAAATATATTTGGGAGAGTTGTTGACATTG TAGAAATGCAATCAGAGGCAGGGGCAGCAGGTACGGTTCATGGCTTACTACAAGGCGGAACTCTTACAACTACTTATACA GCGTCTCAAGGATTATTATTAATGATACCTAATATGTATAAGATTGCTGGAGAGTTGCTTCCAGGAGTGTTTTATGTAAC AGCAAGAGCTGTAGCAGCACAAGCACTATCTATATTTGGTGATCATCAAGACGTTATGGCAACTAAACAAACAGGATTTT CTTTGTTAGCAGTTAGTGGAGTTCAAGAAATTATGGATTTAGCTCCTATTGCTCATTTATCTGCAATTAAAGGGAAAGTT CCATTTCTTGTATTTTATGACGGATATAGAACATCACATGAAGTTCAAAAGGTAGAAGCATTTGAATACGAAGAATTAAA GAAATTAGTTGATTTTGATGCTTTGAATGAGTTTAAGAGCAGAGCATTAAATCCTGGAAATCCTGTAAGTAGAGGTACTG CACAAAACCCTGATATATATTTTCAGGCTAGAGAGGCTGCAAATACTTATTATGAGGAATTACCAAAAATAGTTGAGCAG TATATGGGCAAAATAAATGAGCTTACTGGTAAGAATTATAAATTGTTTAATTATTATGGGGCACAGGATGCTGAAAGAAT AATAATTTGTATGGGATCTTCTGCAGAGACTGTAGAAGAAACTGTTGATTATTTGATGTCAAAAGGTGAAAAAGTTGGTG TTCTCATAGTTCATTTATATAGACCGTTTAGTGTTAAGCATTTGTTAAATGAGATTCCTATGAGTGTCGAGAAAATAGCT GTTTTGGATAGAACCAAAGAGCCAGGATCTCAGGGTGAACCATTATACAAAGATGTTATATCAGCTTTTTATGGAACGGA TAGAAATCCAACAATAGTTGGTGGACGTTATGGATTAGCTTCTAAAGAGATTAATCCTACTCATGTGGTTTCTGTATTTG AATTATTAAAATCTAATAGTGTAGTTAATGGATTTACTGTTGGTATAGTAGACGATGTTACAAATACTAGTATAGATTTA GTAGATGATGTATTAATAGAGGATTCGGCAATGATTAGCTGTAAGTTCTGGGGATTGGGATCTGATGGAACTGTTGGAGC TAATAAAATGGCTATTAAAATAATTGGAGATAATACTGATAAACATGTTCAAGCTTATTTTGAATATGATTCTAAAAAAT CTGGTGGGATAACAATTTCTCATTTAAGATTTGGAGATAGCAGGATTAGATCTACTTATGGAATAGTTAAGGCTGATTTT GTAGCTTGTCATAATCAGGCGTATATGAGTAAATATGAAACAATTGTTACCGGTGTAAAAAATAATGGTGCATTTTTGTT GAATACATTGTGGACTCCTGAAGAATTAGAGGAAAAATTGCCTGCACACGTTAAGAGAACGATTGCAAATAATAATATAC ATTTTTATACAATAAATGCTGTTAAGATTGCTAGAGAGTTAGGTCTTGGTGGAAGAATTAATATGATAATGCAATCAGCG TTCTTTAAACTAGCGAAAATAATACCTATAGAGGATGCTGTTAAATATTTAAAGGCATCTGCAGAAAAAGCATATGGTAA AAAAGGTGAAAAAATTGTAAAAATGAACTTTGATGCTATAGATGCAGGTGTTTCTGCTATAGTTAAAATTGATGTTCCAG AAAGCTGGAAGAATGCACAGGATATTGATAAAAAAGATGTTTACACTTGTAATTTAGGTAAAACTGATTACGTGAAGAGT ATTCTTGAACCAGTAAATAAACTTCAAGGAAATACTTTACCTGTAAGTGTATTTAAAGGTAGAGAAGATGGTACATTTGA GCATGGAACTTCTAAGTTTGAGAAGAGAGGTATTGCGGTTACCGTACCTAAGTGGAATCCTGAGACATGTATCCAATGTA ATATGTGTGCGTTTGTTTGTCCACATGCCGTTATTAGACCGTTCCTGTTAACAGATGATGAGATGAAAAATGCTCCAGAA GGATATTTATCTGCTGAGGCAAAAGGTATTAAGACAGAAAATAAATTACAATTTTCTATGCAAGTTTCTATAGAAGATTG TACAGGATGCGGTAACTGTGTAGATGTATGTCCATCTAAACCAAAATCATTGGAAATGGTTTCTACTGATGGTGAACGTG ATAAGCATAAGCAAGAGCATTATGATTATTCATTTGATCCAGAAAAAGTTTCTCCTAAAAAGAATCCACTCCCACTTACA ACAGTTAAAGCGAGTCAATTCCAAGAACCATTGATGGAATTTAGTGGGGCTTGTGCTGGATGTGGCGAGACTCCTTATTC TAAACTTGTAACTCAATTGTTTGGACCAAGAATGGTAGTTGCCAACGCAACTGGATGTTCTTCTATTTGGGGTGGATCTG TACCAGCTATGCCTTATACTAAAAATAGTGAGGGAAGAGGACCAGCTTGGGCTAACTCCTTATTTGAAGATGCTGCCGAG TTTGGTTATGGGTTATATTTAGCTTCAAAAAATAGAAGAAACGATAATCTTTCTTTGGCTAATGAATTGATTGAAAAAGG AAATATTTCTTCAGAACTAAGTGCGTTATTAAAAGAGTGGTGTGAGAATTTTAATAATGGTGATATGACTTTGGAATTGC AAAAGAAAATAGTTCCATTATTAGAGAAAGAATCAGACGCTATAGCTAAGAAATTGTTAAATAATAAAGAGTTTTTTGTT AAAACTTCTAATTGGATATTTGGAGGAGATGGATGGGCTTATGATATTGGATTTGGTGGTCTAGATCATGTTATTGCACA GAATCAAGATATCAACATTCTAATATTTGATACCGAAATATATTCAAATACTGGAGGTCAATCTTCTAAGTCAACTCCAT TTGGTGCTATAGCTAAGTTTGCTGCACAAGGTAAGAGAGTCAAGAAGAAAAATTTAGCTGCAATGGCTATGAGTTATGGA TATGTTTATGTTGCTCAAGTATCTTTAAGTGCTGACTTTAATCAAGCATTGAAGGCTATAAAAGAAGCTGAGGCTTATCC AGGACCATCAATAGTAATTGCATATAGTCAGTGTATAAGTCACGGAATATTGACTGGAATGGGTACAGCTCAAAAGCAAG CTAAGAGAGCTATAGAGGCTGGATATTGGAGTTTATTTAGATATAATCCGGCATTGAAAGATGAAGGAAAGAATCCATTT ATATTAGACTCTAAAGAGCCAACTCAAGACTTTAAAGAGTATATTAAGAGTGAGATAAGATTTAATTCTTTATCTAAGAT TGTTCCAGAAGAGATGGAAAAAATATTTGATCAAGCAGCTAGAGATGCTGAAGAGAAAAATAAACAATATAGAGATCTTG CTGGTTTAGAATAA Protein sequence : MTVDGNGAAAYVAYAFTEIAAIYPISPSSGVGENIDEMASQGKKNIFGRVVDIVEMQSEAGAAGTVHGLLQGGTLTTTYT ASQGLLLMIPNMYKIAGELLPGVFYVTARAVAAQALSIFGDHQDVMATKQTGFSLLAVSGVQEIMDLAPIAHLSAIKGKV PFLVFYDGYRTSHEVQKVEAFEYEELKKLVDFDALNEFKSRALNPGNPVSRGTAQNPDIYFQAREAANTYYEELPKIVEQ YMGKINELTGKNYKLFNYYGAQDAERIIICMGSSAETVEETVDYLMSKGEKVGVLIVHLYRPFSVKHLLNEIPMSVEKIA VLDRTKEPGSQGEPLYKDVISAFYGTDRNPTIVGGRYGLASKEINPTHVVSVFELLKSNSVVNGFTVGIVDDVTNTSIDL VDDVLIEDSAMISCKFWGLGSDGTVGANKMAIKIIGDNTDKHVQAYFEYDSKKSGGITISHLRFGDSRIRSTYGIVKADF VACHNQAYMSKYETIVTGVKNNGAFLLNTLWTPEELEEKLPAHVKRTIANNNIHFYTINAVKIARELGLGGRINMIMQSA FFKLAKIIPIEDAVKYLKASAEKAYGKKGEKIVKMNFDAIDAGVSAIVKIDVPESWKNAQDIDKKDVYTCNLGKTDYVKS ILEPVNKLQGNTLPVSVFKGREDGTFEHGTSKFEKRGIAVTVPKWNPETCIQCNMCAFVCPHAVIRPFLLTDDEMKNAPE GYLSAEAKGIKTENKLQFSMQVSIEDCTGCGNCVDVCPSKPKSLEMVSTDGERDKHKQEHYDYSFDPEKVSPKKNPLPLT TVKASQFQEPLMEFSGACAGCGETPYSKLVTQLFGPRMVVANATGCSSIWGGSVPAMPYTKNSEGRGPAWANSLFEDAAE FGYGLYLASKNRRNDNLSLANELIEKGNISSELSALLKEWCENFNNGDMTLELQKKIVPLLEKESDAIAKKLLNNKEFFV KTSNWIFGGDGWAYDIGFGGLDHVIAQNQDINILIFDTEIYSNTGGQSSKSTPFGAIAKFAAQGKRVKKKNLAAMAMSYG YVYVAQVSLSADFNQALKAIKEAEAYPGPSIVIAYSQCISHGILTGMGTAQKQAKRAIEAGYWSLFRYNPALKDEGKNPF ILDSKEPTQDFKEYIKSEIRFNSLSKIVPEEMEKIFDQAARDAEEKNKQYRDLAGLE |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| unnamed | AFJ97267.1 | pyruvate ferredoxin | Virulence | Not named | Protein | 0.0 | 56 |
