Name : polA2 (MOUSESFB_0242) Accession : YP_005667960.1 Strain : Candidatus Arthromitus sp. SFB-mouse-Yit Genome accession: NC_017294 Putative virulence/resistance : Unknown Product : DNA polymerase I Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 290698 - 293271 bp Length : 2574 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGGAAAGGGTTTTAATATTAGATAGTAATAGTATTTTAAATAGGGCTTTTTATGCTCTTCCACTTCTTAGCTGTTCTGA AGGAATACATACTAATGGAATACTTGGATATTTGACGATGTTTTTTAAAATGCAGGAAGAATTTAATGCTACATATGTGA TTGCAACTTTTGATAGAAAGGCTAAGACATTTAGACATTTGGAGTATAGTAACTATAAATCTGGTAGAAAATCTATGCCT AATGAATTATTTGAGCAACTTGAACCACTAAAAGAAATATTAAAAGCAATGAATATAAATATTTTTGAGCTCGATGGTTT TGAGGCTGATGATTTAATAGGAACATTGTCAAGAATATATGAGGAAGAAGGATTTGAACCTATAATAGTTACAGGGGATA AAGATGCACTTCAGCTTAGTTCAAGTATAACAAAAGTAATTATAACAAAAAAAGGTATAACAGATAAAGAAGTTTATAAT GAAGAAAAGATGATTGAGGTATATGGAGTAACTCCAACTGAGTTTATAGATGTTAAGGCTATTATGGGTGATAAATCTGA TAATATTCCAGGTGTTTCTGGTATTGGAGAAAAGGGAGCAATTTCTTTAATAAAAGAGTTTAAGAGTATTGAAAATCTTT ATGAGAATTTAGAATGTTTAAAGGAAGGTAAAATTAAAAAGAATTTAATAGAAGGAATGGAGTCGGCTTTTTTATCGAAG AAATTGAGTAAGATAAATAGATTTGTACCCATTGATTTTTCTTTGAATGATATGAAAGTTTATAGTGAGTTAGACCACTT AAGAGTGTATGAATTATATAATAAATATGAATTGAAGTCTTTATTGAATAAAATAAATTCAAATAATGAGTCTTATGAAA TATTAGTTAATGAAATTTCTAGTACAGAAGATTTAACAGATTTATTAAATAAGATATATAATTCTAATTGTAATTTGTAT ATTTATTGTGATGTTTTAGGCAATAAGGTTTCTGAGATGCATTTTGGGAATATGTATATTAATTTTAATAATGAAAATTA CATATTGAAAGAGAATTTTATATGCGAAAATTTTGATGATGTGAGTAGGATTTTTTCTTCTAAGAATGATAAAATATGTT TTGATTCAAAAATGATACATAAAGTTATGCTTATAAATGGTAAAGAAGTAAATAATATAATTTTTGATTTGGTTATAGGG GATTATTTATTAAAACCAGGTAGGGAACGCACTCTTATAAGTTTGTGCAGGGATTATGTATCTGTATCTTTAGATGAGGA TGATACTTGTTTAGCAGTTTCATTTTTTGAAGATATCTATAAAACTATTTTAAATAAAATAGATAAATGCAATATGAGAG AACTTTATTTTGAAATCGAACATTTATTATCTCCAATTTTAGCTAGTATTGAATTAGAAGGATTTAGGGTTTCTGTTGAG ATGTTAGGAGAATTGAAGGAGAAGTTTGATATAAAAATAAAGGAACACTCTGAAAAAATATATAGTTTATCAGGCGAAGT ATTTAATATTAATTCTCCTAAGCAATTAGGTAAGATACTATTTGAAAAGCTGGATTTACCAGTTATAAGGAAGACTAAGA CTGGGTATTCAACTAATGCTGAAGTTTTAGAAGCTTTAATGGACAAACATGAGATTATAGAGGAAATTGTAAATTATAGA CAGATAACAAAGCTACAATCAACTTACATACTTGGACTTATGGATGTTATAGATTATGATTTTAAAGTTCATACATCTTT TAATCAAACATTAACAGCTACAGGAAGATTATCTAGTGTAGATCCTAATCTTCAGAATATACCTATTAAATATCCTCTAG GTCGAGAAATAAGAAAAGCATTTATTGCGGAGAAAAATAGCTATATATTATCTGCTGATTATTCTCAAATTGAACTTAGA ATGCTTGCGCATATATCAGAAGATGATAATATCATAAAAGCATTTAGAGAAAATTTAGATATTCATAAAATGACTGCATC AGAGATTTTTTCTGTTGATGAAGATGATGTAACAAGTGAGATGAGAAATAAGTGTAAGGCTGTTAATTTTGGAATTATAT ATGGAATAAGTGATTTTGCTTTATCTAATGATTTGAAGATATCTAAAAAAGAAGCTAGAGAGTATATGGATAGGTATTTT AATAGATATGTTGGGGTTAAGAGATATCTAGATGAAATCGTAGTTAAGGCCAAGAAAGATGGTTTCGTGACAACTATTTT TAATAGGAGAAGGGATATTCCTGAGATAAAGTCATCTAATAAAATTATAAGATCTCTTGGAGAAAGACTTGCTATGAATA CACCTATACAAGGCAGTGCTGCTGATATAATAAAACTTGCCATGATAAAAGTTTACAATAGGTTAAATGAAGAAAATTTA AAATCTAAAATAATACTTCAGGTTCATGATGAACTTGTGCTAAATGTGTATGAAGATGAGATTGATAGGGTATCTTTAAT AGTTAAGGAAGAAATGGAATTATGCTATGATGGGATATTAGTTCCATTGAGTATTAATTTATCTTATGGAAAAAATTGGT TTGAAGCGAAGTAG Protein sequence : MERVLILDSNSILNRAFYALPLLSCSEGIHTNGILGYLTMFFKMQEEFNATYVIATFDRKAKTFRHLEYSNYKSGRKSMP NELFEQLEPLKEILKAMNINIFELDGFEADDLIGTLSRIYEEEGFEPIIVTGDKDALQLSSSITKVIITKKGITDKEVYN EEKMIEVYGVTPTEFIDVKAIMGDKSDNIPGVSGIGEKGAISLIKEFKSIENLYENLECLKEGKIKKNLIEGMESAFLSK KLSKINRFVPIDFSLNDMKVYSELDHLRVYELYNKYELKSLLNKINSNNESYEILVNEISSTEDLTDLLNKIYNSNCNLY IYCDVLGNKVSEMHFGNMYINFNNENYILKENFICENFDDVSRIFSSKNDKICFDSKMIHKVMLINGKEVNNIIFDLVIG DYLLKPGRERTLISLCRDYVSVSLDEDDTCLAVSFFEDIYKTILNKIDKCNMRELYFEIEHLLSPILASIELEGFRVSVE MLGELKEKFDIKIKEHSEKIYSLSGEVFNINSPKQLGKILFEKLDLPVIRKTKTGYSTNAEVLEALMDKHEIIEEIVNYR QITKLQSTYILGLMDVIDYDFKVHTSFNQTLTATGRLSSVDPNLQNIPIKYPLGREIRKAFIAEKNSYILSADYSQIELR MLAHISEDDNIIKAFRENLDIHKMTASEIFSVDEDDVTSEMRNKCKAVNFGIIYGISDFALSNDLKISKKEAREYMDRYF NRYVGVKRYLDEIVVKAKKDGFVTTIFNRRRDIPEIKSSNKIIRSLGERLAMNTPIQGSAADIIKLAMIKVYNRLNEENL KSKIILQVHDELVLNVYEDEIDRVSLIVKEEMELCYDGILVPLSINLSYGKNWFEAK |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
polA | YP_281523.1 | DNA polymerase I | Not tested | Not named | Protein | 4e-141 | 41 |