|
Name : secA (MOUSESFB_1175) Accession : YP_005668893.1 Strain : Candidatus Arthromitus sp. SFB-mouse-Yit Genome accession: NC_017294 Putative virulence/resistance : Unknown Product : Preprotein translocase subunit SecA Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 1334110 - 1336611 bp Length : 2502 bp Strand : - Note : - DNA sequence : ATGGGATTATTAACAAAAATATTTGGTACATATAGCGATAAAGAATTGAAACAAATAAACAAGATAATAAAAAAGATTAA TTCTTTAGAGCCATCAATACAAAATTTATCAGATGATCAGTTAAGAGGTAAGACTGATGAATTTAGACAGAGGTATAAGA AAGGTGAATCTCTTGATAAAATGCTTCCAGAGGCTTTTGCTGTAATAAGGGAAGTTTCAAGGAGAGTGATAGGTAAGAGA CATTATGATGTTCAATTGATTGGTGGAATTGTATTACATCAGGGGAGAATTGCGGAAATGAAGACTGGAGAAGGAAAGAC ATTGGTTTCTACACCTCCAGCTTATTTGAATTCTATAACAGGAGAGGGAGTCCACATAATAACTGTTAATGATTATTTAG CACAGAGAGATTGTGAAATAAATAAGCCTATATATGATTTTTTAGGTGTTAGCGTTGCTCCTATAGTTCATGGAATTACA TCTAAACAAAGGCAGGAAGCTTATGCTTGTGATATTACATATGGAACAAATAATGAGTTTGGATTTGATTATTTAAGAGA TAACATGGTTATATTTAAAGAGGAGAAAGTTCAGAGAGGATTGAATTTTGTAATTATAGATGAGATAGATTCTGTTCTTA TAGATGATGCAAGGACTCCTTTAATAATATCTGGTGCTGCAGATAAATCTACTGATTTTTATAGGATAGCAGATTATTTT GCTAAAACTCTTAAGGAAGATGATTATAAGAAAGATGAGAAAACAAATTCTGTAATTTTAACTGATAATGGTGTTAAAAA AGCAGAAACTTTCTTTAGGGTTGATAATTATGCAGACCCTCAAAATATGAGTATACAACACCATGTTTCCCAATCTTTAA GGGCTAACTATGCTATGAAAAGAGATAAGGATTACATTGTTGTAAATGGAAAAGTTGAGATAATTGATGATAATACTGGT AGGGTAATGGAAGGAAGAAGATATGGTGATGGTTTGCACCAGGCTATAGAAGCTAAGGAAGGTGTAAAAGTTGAAAAGGA ATCGAAAACGCTTGCGACTATTTCCTATCAGAATTTATTTAGAATGTATAAAAAGTTAAGTGGTATGACAGGTACTGCTG CAACTGAAGAAAATGAATTTAGAGAAATATATAGCTTGGATATAGTAGTTATTCCAACTAATAAGCCTATTAAGAGAATT GATCATTCAGATAAAGTATTTAAAACTGAAGGTGGGAAAATAAAAGCAATAATAAAAGATATTGAGGAAAGTAATTTTAA AGGTCAACCTGTTTTGGTTGTTGCTCCTAGTATTTCTAAGGCTGAGGCCATGTCTGATGAATTGAGAAGGAAAGGAATGA AGCACCAACTTCTAACAGCTAAATCACATGAAAAAGAGGCTGAAATTGTAGCTCAGGCTGGTCAATCAGGAATGATAACA GTTGCAACAAACATGGCTGGAAGAGGTACTGATATAAAGCTTGGTAAGGGTGTTCCGGAAGCAGGAGGTCTTAAAATTAT AGGAACTGAAAGAGCAGAATCTCGTCGAGTTGATGGTCAGATGAAGGGAAGAGCTGGGCGCCAGGGAGATCCAGGTAGTT CTAGATTTTATATAAGTCTAGATGATGATTTGATGAGAATATTTGGATCTGATAGATTAAAAGCTGTTGTAGATAGACTT GGGCTTTCAGATGATGATGCTATTGAGAGTAAATTTGTTTCTAAAGCTATTGAGAATGCACAAAAAAATGTTGAGGGTAA CAATTTTGATGTCAGAAAATCTCTTATAGGATATGATGATGTTATAAATAAGCAAAGAGAGATAATATATTCTCAACGTT CTAGAGTACTTGAGGGTGAAAATTTAAAGGAACAAATAATTTCTATGATTGAAGATGTTGTTTCATATGAGGTTAATGTA CACTTACTTGGATCTGATTCTGAAGAGAATGATTTAAATAAACTTATAGAATATATGGAAATGTTGTATGTTCCTGTTGG GTTAATTAAGCCTGAGATGCTTGAAGATTTAAATACAAAGGAAATAATAAATAAATATGTGTCTATAGCAAAGAAAATAT ATGCAAAAAAAGAGGAGGAGTTCGGAGAAAAACAGCTTCGTGAGGTTGAGAGAGTAATATTACTTAGAGTTGTTGACCTT AAATGGATGGATCATATAAATAATATGGATCATTTAAAACAAGGTATAGGGCTTAGAGCATATAAACAACAAGATCCAAT TCAGGCATATCAATATGAGGGAAGTGCTATGTTTGAAGAGATGATAATGAATATAAAATTGGATACTATCAAGTATTTAA TGCACGTTAGAGGTGATAAAGCTCCTCAGAGAGAAAGAGTTGCTAGGGAAACAGGTACGAATGAAACTTCTTCTGATACT AAAGCAAAACCAATTAGGAAAGAAGCTAAAGTTGGAAGGAATGATAACTGTCCTTGCGGGAGTGGAAAGAAATATAAGTC TTGTTGTGGTAAAAATTCTTAA Protein sequence : MGLLTKIFGTYSDKELKQINKIIKKINSLEPSIQNLSDDQLRGKTDEFRQRYKKGESLDKMLPEAFAVIREVSRRVIGKR HYDVQLIGGIVLHQGRIAEMKTGEGKTLVSTPPAYLNSITGEGVHIITVNDYLAQRDCEINKPIYDFLGVSVAPIVHGIT SKQRQEAYACDITYGTNNEFGFDYLRDNMVIFKEEKVQRGLNFVIIDEIDSVLIDDARTPLIISGAADKSTDFYRIADYF AKTLKEDDYKKDEKTNSVILTDNGVKKAETFFRVDNYADPQNMSIQHHVSQSLRANYAMKRDKDYIVVNGKVEIIDDNTG RVMEGRRYGDGLHQAIEAKEGVKVEKESKTLATISYQNLFRMYKKLSGMTGTAATEENEFREIYSLDIVVIPTNKPIKRI DHSDKVFKTEGGKIKAIIKDIEESNFKGQPVLVVAPSISKAEAMSDELRRKGMKHQLLTAKSHEKEAEIVAQAGQSGMIT VATNMAGRGTDIKLGKGVPEAGGLKIIGTERAESRRVDGQMKGRAGRQGDPGSSRFYISLDDDLMRIFGSDRLKAVVDRL GLSDDDAIESKFVSKAIENAQKNVEGNNFDVRKSLIGYDDVINKQREIIYSQRSRVLEGENLKEQIISMIEDVVSYEVNV HLLGSDSEENDLNKLIEYMEMLYVPVGLIKPEMLEDLNTKEIINKYVSIAKKIYAKKEEEFGEKQLREVERVILLRVVDL KWMDHINNMDHLKQGIGLRAYKQQDPIQAYQYEGSAMFEEMIMNIKLDTIKYLMHVRGDKAPQRERVARETGTNETSSDT KAKPIRKEAKVGRNDNCPCGSGKKYKSCCGKNS |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| secA2 | YP_006310687.1 | preprotein translocase subunit SecA2 | Not tested | FWisland_3 | Protein | 2e-122 | 44 |
