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Name : serS (CJM1_0367) Accession : YP_005657344.1 Strain : Campylobacter jejuni M1 Genome accession: NC_017280 Putative virulence/resistance : Unknown Product : seryl-tRNA synthetase Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 353256 - 354491 bp Length : 1236 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGCTAGATTTAAAAAATTTGCAAAATAATTTTGATGAAGTGGCTAAAAAGTTAAAAAATAAAAAAGTTGATGAAAATAT CTTAAAAAAACTTGCTGAACTTTTTGCAAGTTTAAAAAAAGAAAAAACAGCTTTAGAAGAATTTCAAGCTTTTCAAAATA AATTCAGTAAAGAGCTTGCTACAGCCGAAGATAAAGAAAGTTTAAAAGCAAAATTAAGCGAAAATAAAAGCAAAATTAAT GAGCAAAGCGTTAAAGTAAATGCTTTAGAAAATGAGCTTGAAGAAATCGCTCATGCCATCCCAAATATTCCTGATGAATG TGTGCCTGTGGGTGAAGATGAAGATGAAAATGTGGAGCTTAAAAAAGTATTAAATCCGCCTAGCTTTGATTTTACTCCAA AAGAACATTTTGAATTAGGCGAGAGTTTAAATTGGCTTGATTTTGTGCGTGGGGTAAAAATTTCACAAAGCCGTTTTTGT GTGCTTAAGAACGAAGGAGCTTTATTAAGCCGTGCTTTGGTAAATTATATGATAGATTTTAATAGAAGTCATGGATTTGA GTTTGTTAATGTACCTTTTTTGGTAAATGGTGCTACTATGTTTGGGACGGGTCAGTTGCCAAAATTTAAAGAAGATATGT ATAAGGTAGATGATGAGGATTTGTATTTAATCTCAACTTCTGAAATTCCAGTAACCAATCTTTATAGTGGAGAAATTTTA GCGAGTGAAACTTTACCTATAAAAATGACTTGTTATAGCGCTTGTTTTAGAAAAGAAGCAGGTAGTGCAGGGCGTGATAC AAGAGGTATTATCAGACAACACCAGTTTGAAAAAGTAGAGCTTGTAAGTATCACTAAACCTGAGCAAAGTGATAGTGTGT TTAATGAAATGCTTGAGTGTGCAAGTGATTTGCTGAGTTCTTTAGGTTTAGCACATAGACATTTGATGCTTTGCACTGGA GATTTGGGTTTTAGTGCAGCAAAAACTGTGGATCTTGAAGTGTGGCTTCCAGGACAAAATAAATATCGTGAGATTAGCTC GGTTTCAAATTGTCGTGATTTTCAAGCAAGACGTGCTAAAATTCGCTATAAAAATGAACAAGGAAAAAATGAACTCGTTC ACACTCTTAATGGCTCATCTTTGGCAGTAGGAAGAACCTTGGTAGCGATTATGGAAAATTATCAAGATAAAGAAGGAAAA ATTCATATTCCTGATGCTTTGAAAAAATATTTTTAA Protein sequence : MLDLKNLQNNFDEVAKKLKNKKVDENILKKLAELFASLKKEKTALEEFQAFQNKFSKELATAEDKESLKAKLSENKSKIN EQSVKVNALENELEEIAHAIPNIPDECVPVGEDEDENVELKKVLNPPSFDFTPKEHFELGESLNWLDFVRGVKISQSRFC VLKNEGALLSRALVNYMIDFNRSHGFEFVNVPFLVNGATMFGTGQLPKFKEDMYKVDDEDLYLISTSEIPVTNLYSGEIL ASETLPIKMTCYSACFRKEAGSAGRDTRGIIRQHQFEKVELVSITKPEQSDSVFNEMLECASDLLSSLGLAHRHLMLCTG DLGFSAAKTVDLEVWLPGQNKYREISSVSNCRDFQARRAKIRYKNEQGKNELVHTLNGSSLAVGRTLVAIMENYQDKEGK IHIPDALKKYF |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| serS | YP_003446791.1 | seryl-tRNA synthetase | Not tested | The aminoglycoside resistance gene cluster | Protein | 2e-86 | 49 |
