Name : YPC_0341 (YPC_0341) Accession : YP_005622378.1 Strain : Yersinia pestis Harbin 35 Genome accession: NC_017265 Putative virulence/resistance : Unknown Product : hypothetical protein Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 321235 - 322602 bp Length : 1368 bp Strand : - Note : - DNA sequence : ATGTTAAGACCAACAAAGCCATTAATATCTTCCGGCATTTCGCAGTCTACCACTGCGGTCTATTGCCGCCGCCCATATTT TCTTGCTGGGATGACATTACTGATTGGGTTATTTAGCACCTCCGCATGGTCAAACTGCACCCGTATTACCGCACAAAATC AGATAAGTTCCAGTGATGGTACCGCCGCTTCATGGTTGGGTTCCAGAGACGATAATAATGGTTCGCTCAACTTACCCAGT ATTGTTGATCTCAGCACCAATGCGAATTTTCAGCCCGATGGCACGTTACTGGCATCAGCAACCTCAGACTTTACGACCTT TGCAGTGAATACCGGTTATGCCCTTGACCAGGTCCTCTTTCGCTGTGATGCGGCTGATGTGGATCAGCTCTATGAGATGT ATGCCACTAACGGTGACAGCACTTATGGTGGCAGATATGAAGACGGCACGATTGCAGGCAATGTGTCCTATGGCTATGCT ACTACAGTGATGAATGTGGTTATTCGGTTTACCAACCTGGCAACGGGGGAGTATTACGCTCGTATTTGGAAAGGCCGACG CTTAACCGGGCTTGATACTGACAGTAGCGGACGGATTTTAGTTAAAGCGAAAAATTTCAGTAATGTGTATACCGAGCTAT TTCGTATTGATTATGCCCGTAGTGGCGCTAACAATACGCCATCTTATCTCTATGGACGTAGTCAGCCCAATGCCTATATC GCGTTTAAAGGGCCAGGAATTACTGGCCCGATTGAGGGTACTGACTCGTACTCAAACTGGCCCGGTTGGTATTCTACCTG GCCTGCATCACTTGGTTTGTACAAATACGTCACATTCCGCCGGACCACTATTTGTGCGGTAAGCAACTTTACCCCGACGG TCGTGTTACCCAGGATTTCGGTGGCAGAACTGAATAATGGGAATACCAGCTCTGCTGATTTTAATGTGGATTTTCAGTGC CAGACCGGAATTAACTCTGGCGTGACGGCTGGCACAGTGGCGATGGGATTTTTAGTGCCGGCGGCCAATGCAGCCAAAGC TCAGGCGCTGGGGTTAATGAACGGCAACGGGGGAGTAAGCCATTTGGTCTCCGATAACTATGGCGCTGCTGGCACCGCGG GCGGGGTGGGTATTCGCATCTACCGTAACAATAGCCCGATGTATCTACTGTCAAAAAACGTAACTCAGACAGGTAACAAT GGGGGGTGGTATGGTATCTTACAGGGCGCACAAGAAACCACAGGCAGCGTAGATGGGGGGAACAGTTACACCGAAACTTT CCGTGCTGAGTTAAGCAAAATAAGCGGGCAAACAGTGACCGCCGGAGCAGTGAATGCACATGCGCAAGTGGTTATCCGTG TCCAATAA Protein sequence : MLRPTKPLISSGISQSTTAVYCRRPYFLAGMTLLIGLFSTSAWSNCTRITAQNQISSSDGTAASWLGSRDDNNGSLNLPS IVDLSTNANFQPDGTLLASATSDFTTFAVNTGYALDQVLFRCDAADVDQLYEMYATNGDSTYGGRYEDGTIAGNVSYGYA TTVMNVVIRFTNLATGEYYARIWKGRRLTGLDTDSSGRILVKAKNFSNVYTELFRIDYARSGANNTPSYLYGRSQPNAYI AFKGPGITGPIEGTDSYSNWPGWYSTWPASLGLYKYVTFRRTTICAVSNFTPTVVLPRISVAELNNGNTSSADFNVDFQC QTGINSGVTAGTVAMGFLVPAANAAKAQALGLMNGNGGVSHLVSDNYGAAGTAGGVGIRIYRNNSPMYLLSKNVTQTGNN GGWYGILQGAQETTGSVDGGNSYTETFRAELSKISGQTVTAGAVNAHAQVVIRVQ |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
cupD4 | AAP84168.1 | fimbrial subunit | Not tested | PAPI-1 | Protein | 8e-74 | 44 |