Gene Information

Name : tktB (BUAMB_089)
Accession : YP_005619850.1
Strain : Buchnera aphidicola Ua
Genome accession: NC_017259
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : transketolase
Function : -
COG functional category : -
COG ID : -
EC number : -
Position : 94096 - 96093 bp
Length : 1998 bp
Strand : +
Note : -

DNA sequence :
ATGTGTTCACGAAAAGAATTAGCTAATGCAATTCGTATGTTAAGTATAGATTCTGTTCAAAATGCAAAATCAGGACATCC
TGGAATGCCTATGGGTATGGCTGATATTGCAGAAGTTTTGTGGAGAGATTTTTTAAAACATAATCCTAAAAATCCAAATT
GGTATAATCGTGATCGATTTATATTATCAAATGGACATGGTTCGATGTTGTTATATAGTTTATTACATCTGACAGGGTAT
AATTTATCAATAGAAGAATTAAAAAATTTTAGACAACTTCATTCAAAAACTCCAGGGCATCCTGAAATAGGTGAAACACC
TGGTGTCGAAATAACTACTGGTCCTTTAGGTCAAGGATTAGCTAATGCTGTAGGTATGGCAATCGCTGAAAGAACTTTAA
GTGCTTATTTTAATAGAACAGGATATAATATTATTGATCATTATACTTGGGTTTTTTTAGGTGATGGTTGTTTAATGGAA
GGAATTTCTCATGAAGTATGTTCTTTAGCTGGTACTTTAAATCTTGGTAAATTAATTATTTTTTATGATAAAAATGGTAT
TTCAATAGATGGTAAAGTATCAAATTGGTTTACAGATGATACTGCAAAACGTTTTGAAGCTTATAATTGGCATGTGATAG
ACAATATAGATGGTCACAATGCAAATATAATTAATAAAAGCATCAAAATAGCTCAATCAGTGAAAAATAAACCATCAATT
ATTATTTGTAATACGATTATTGGTTTTGGTTCCCCTAATAAATCAGGAACATCAGAATCACATGGAGCTCCTCTTGGTGA
AATGGAGATTTCTTTAACTCGAGAACATTTAAACTGGAATTATTCTTCTTTTAAAATTCCTGATAAAATTTATAAAAAAT
GGAATTATATCAAAAAAGGTTTAGAATTAGAAAAACAATGGAACGAATTATTTGCTTTATATCAATCAAAATATCCTGAT
TTATCATCAGAATATTTAAGACGAATTAATCAAAAATTGCCTCATAATTGGAATAAAATCACTAATAATTATATTCATTT
TTTACAAAATAATAAAAAAAATATTGCAAGTCGACAAGCTTCTCAAAATACATTAGAGAAATATGCTAATATTTTACCTG
AATTAATTGGTGGTTCAGCTGATTTATCACCTAGCAATTTAACTATGTGGTCTAATTGCAATTCGATAAAAGATAATTTA
TCAGGTAATTATATTCATTATGGGGTTCGTGAATTTGGAATGACTGCTATTGCAAATGGAATAGCTCATCATGGTGGTTT
TATTCCTTATACTGCTACATTTTTAATATTTGTTGAATATGCAAGAAATGCGGTTCGTATGGCTGCTTTAATGAATACAA
AACATATTTTTGTATATACTCATGATTCTATTGGATTAGGTGAAGACGGTCCTACACATCAACCTATAGAACAAATAGCT
AGTTTACGTATGACTCCTAATATAGATGTATGGAGACCTAGTGATCAAGTGGAAACAGCAGTAGCTTGGAAACATGCTAT
TGAGAAAAAATCAGGACCAACAGCATTAATTTTATCACGTCAAAATTTACCTCAATTTTCTAGAAATTCTAAAACATTAA
ATAATATTTCTTATGGAGGATATATATTATATGATTCTGATAAACCATTGGATATTATTTTTATATCTACTGGTTCAGAG
CTTTATATTACTTTAATGGCTGCAAAAAAATTGACATGTTTAGGATATTCTACACGCGTAGTATCTATGCCTTCTACTAA
TGTATTTGATCGACAAGATTCTACATATAAACAATCTGTATTACCATCTTATGTTATAAAAAAAGTTGCAATTGAAGCAA
GTATAGAAGATTTTTGGTACAAATATGTAGGAATTAATGGTTTAATCATTGGTATGAAAACATTTGGTGCATCAGCTCCA
GCGGAAGATTTATTTAAAAAATTTGGTTTTACTATAGATAATGTAGTTAAAAAATCAATAATTTTCTTACAATCTTAA

Protein sequence :
MCSRKELANAIRMLSIDSVQNAKSGHPGMPMGMADIAEVLWRDFLKHNPKNPNWYNRDRFILSNGHGSMLLYSLLHLTGY
NLSIEELKNFRQLHSKTPGHPEIGETPGVEITTGPLGQGLANAVGMAIAERTLSAYFNRTGYNIIDHYTWVFLGDGCLME
GISHEVCSLAGTLNLGKLIIFYDKNGISIDGKVSNWFTDDTAKRFEAYNWHVIDNIDGHNANIINKSIKIAQSVKNKPSI
IICNTIIGFGSPNKSGTSESHGAPLGEMEISLTREHLNWNYSSFKIPDKIYKKWNYIKKGLELEKQWNELFALYQSKYPD
LSSEYLRRINQKLPHNWNKITNNYIHFLQNNKKNIASRQASQNTLEKYANILPELIGGSADLSPSNLTMWSNCNSIKDNL
SGNYIHYGVREFGMTAIANGIAHHGGFIPYTATFLIFVEYARNAVRMAALMNTKHIFVYTHDSIGLGEDGPTHQPIEQIA
SLRMTPNIDVWRPSDQVETAVAWKHAIEKKSGPTALILSRQNLPQFSRNSKTLNNISYGGYILYDSDKPLDIIFISTGSE
LYITLMAAKKLTCLGYSTRVVSMPSTNVFDRQDSTYKQSVLPSYVIKKVAIEASIEDFWYKYVGINGLIIGMKTFGASAP
AEDLFKKFGFTIDNVVKKSIIFLQS

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
tktA AAO17218.1 TktA Not tested tcd island Protein 0.0 66
APECO1_2641 YP_859417.1 transketolase Not tested Not named Protein 0.0 60