|
Name : serS (BUAMB_293) Accession : YP_005620044.1 Strain : Buchnera aphidicola Ua Genome accession: NC_017259 Putative virulence/resistance : Unknown Product : seryl-tRNA synthetase Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 332074 - 333357 bp Length : 1284 bp Strand : - Note : - DNA sequence : ATGTTAAATCCATACTTATTAAGAAATGAATTACATTTAGTCGCTCAAAAATTATTAAAAAAAGGTTATGTGTTAGATGT TAAAGAAATATCTTCGATGGAAAATTATCGAAAAAAATTACAAATTGAAACTGAAAATTTACAGTTTAAACATAATTCAT TATCAACTTTACTTAAGCAATCTAAAGATAATACAAATCAACGGTTAATTTTAAAAAATACTCTTATAGAATCATCAAAA AATTTACACAATCTCAAAATTCAACTAAATAATTTAAAAGAGAAAATTTATAATTTTTCTATGTGTATTCCTAATATTCC TGCCGATGATGTTCCAGAAGGTAACTCTGCAATTTATAATAAAACAATTTCGTACTGGGGTAAAAAGAGAAAATATAATT TTATTATTAAAGATCATGTAGAAATAGGTAAAAAGTTTCAAGAATTAGATTTAGAATCTTCAGCTGAAATATCAGGATCA CGATTTGTTGTTATGCGTGGTAAAATTGCTCTTTTACATCGAGCACTAATTCAATTTATGTTAGATTTACATACTTTAAA TCATGGTTATATAGAAACATATGTACCTTATTTAGTACATCCTAAAGCTTTATATGGAACTGGACAATTACCTAAATTTA GTAATGATTTGTTTCATGTAACAATTTTAAATGAAAAAAAATATATATTAATTCCTACTGGGGAAGTACCATTAACTAAT TTAGTTTATAATAAAATAATAAATGAAAATGATTTACCTATTATGTTAACTGCACACACGCCTTGTTTTCGTTCAGAAGC ATCTTCGTATGGAAGAGATACTAGAGGATTAATTCGATTACACCAATTTGATAAAGTAGAATTAGTTCAAATAGTTAAAC CAAATAAATCTATGGAAGCATTAGAAATATTAACTAATCATGCTGAAAAAGTATTACAACTATTAGATTTGCCATATAGA AAAATACTATTATGTACAGGAGAAATGGGTTTTTCTTCTATTAAAACTTATGATTTAGAAGTTTGGTTTCCTGCACAAGA AAAATATAGAGAAATTTCTTCTTGTTCTAATATGCACGATTTTCAAGCACGTCGTATGAAAGCCCGTTATAAAAAAAAAT CTGAACAAAAAAATTTTTTTGTACATACATTAAACGGTTCTGGTTTAGCAATAGGAAGAACATTAGCTGCGATTTTAGAA AATTATCAGCATGCTGATGGTCGTGTAGAAATTCCTAAAATTCTTCAAAAAAAATATATGCAAGGATTAGAATTTATAAA TTAA Protein sequence : MLNPYLLRNELHLVAQKLLKKGYVLDVKEISSMENYRKKLQIETENLQFKHNSLSTLLKQSKDNTNQRLILKNTLIESSK NLHNLKIQLNNLKEKIYNFSMCIPNIPADDVPEGNSAIYNKTISYWGKKRKYNFIIKDHVEIGKKFQELDLESSAEISGS RFVVMRGKIALLHRALIQFMLDLHTLNHGYIETYVPYLVHPKALYGTGQLPKFSNDLFHVTILNEKKYILIPTGEVPLTN LVYNKIINENDLPIMLTAHTPCFRSEASSYGRDTRGLIRLHQFDKVELVQIVKPNKSMEALEILTNHAEKVLQLLDLPYR KILLCTGEMGFSSIKTYDLEVWFPAQEKYREISSCSNMHDFQARRMKARYKKKSEQKNFFVHTLNGSGLAIGRTLAAILE NYQHADGRVEIPKILQKKYMQGLEFIN |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| serS | YP_003446791.1 | seryl-tRNA synthetase | Not tested | The aminoglycoside resistance gene cluster | Protein | 5e-90 | 47 |
