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Name : CWU_00575 (CWU_00575) Accession : YP_005618217.1 Strain : Buchnera aphidicola JF98 Genome accession: NC_017254 Putative virulence/resistance : Unknown Product : transketolase Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : 2.2.1.1 Position : 96870 - 98867 bp Length : 1998 bp Strand : + Note : COG0021 Transketolase DNA sequence : ATGTATTCACGAAAAGAATTAGCTAATGCAATTCGTATGTTAAGTATAGATGCTGTACAAAATGCACAATCAGGACATCC TGGTATGCCGATGGGAATGGCAGATATTGCTGAAGTATTATGGAGAAGTTTTTTAAAACATAATCCAGCAAATCCTAATT GGAATGATCGCGATCGTTTTATATTATCTAACGGACATGGTTCTATGTTGCTCTATAGTTTGTTGCATCTTACAGGCTAT AATCTACCGATCGAAGAATTAAAAAAATTTAGACAACTGAATTCAAAAACTCCAGGACATCCTGAAACAGGTGAAACACC TGGTGTAGAAACAACTACTGGTCCATTGGGACAAGGGTTAGCAAATGCTGTTGGTATGGCTATTGCAGAAAGAACTTTAA GTTCTTATTTTAATCGACCAGGATATGATATAATTAATCATTATACTTGGGTTTTTGTAGGCGACGGTTGCTTAATGGAG GGTATTTCTCACGAAGTCTGTTCTTTAGCAGGAACTTTAAATCTTGGAAAATTAATCGTTTTTTATGATAAAAATGGTAT TTCGATAGATGGGAAAACAGCTCACTGGTTCACCGATGATACAGCAAAACGTTTTGAATCTTATAATTGGCATGTATTAG ATAATATAGATGGTCATGATTCAGAATCTATAGAAAGAAGTATAAAACAAGCAAAATTAATAACAAATCAACCTTCTATT ATTATTTGCAATACTATTATTGGTTTTGGTTCTCCTAATAAATCAGGAACAGCAGAATCACATGGAGCTCCTCTAGGTGA GGTTGAAATTTCTTTAATTCGAGAACAATTGAAATGGAATTATCCTCCTTTTCAGATACCTAAAGAAATTTATAAAAAAT GGAATTTTATAGAAGAAGGATCTAAACTTGAAAAGAAATGGAACGAAAAATTTTCTTTATATCAATCCAAATATCCTGAT TTATCGACTGAATATTTGCGGCGAATAAATAAAAAATTACCTGTTGAGTGGGATAGAGTAACTAATAATTACATTTCTTT TTTACAAAAAAATAGACAAAGTATTGCTAGTCGTAAAGCTTCTCAAAATACATTAGAAAAATATGCGATGATTTTACCTG AGTTAATCGGTGGTTCAGCAGATTTATCACCTAGCAACCTCACTATGTGGTCTAGATGTAATTCCATTAAAGATAATTTA TCTGGAAACTATATTCATTATGGAGTACGTGAATTTGGAATGACCGCTATTGCAAATGGCATATCTCATCATGGAGGTTT TATACCTTATACTGCTACATTTTTAATGTTTGTCGAATATGCACGAAATGCAGTTCGTATGGCTGCTTTAATGTGTACCA AACATATTTTTGTGTATACTCACGATTCTATTGGACTGGGTGAAGATGGTCCTACACATCAACCAGTAGAACAATTATCT AGTTTGAGAATAACTCCTAATATAGATGTATGGAGACCTAGTGACCAAGTAGAAACAGCTGTTGCTTGGAAAAAAGCTAT TGAAAAAACATCAGGACCTACAGCATTAATTTTATCACGTCAAAATCTTGATCAATTTGAGAGAAGTTCTGAACAATTAG AAAACATTTCTTATGGAGCATATATATTATATGATTCAAAAAAAAGACTTGATATTATCTTTATATCAACTGGATCAGAA TTAAATGTTACTTTAATTGCTGCAAAAAAATTGGCTTCTTTAGGGTATTCTGTACGTGTTGTATCTATGCCCTGTACTAG TGTTTTTGATAGACAAGATGCTTCTTATAAAGAATTTGTATTACCGACTTATGTTGCTAAAAGGGTTGCTGTTGAAGCTA GTATAGAAGATTTTTGGTATAAATACGTAGGGATAAATGGTGTAATTATTGGAATGAAAACATTTGGTGAATCTGCTCCA GCAGAAGATTTATTTAAAAAATTTGGTTTTACTGTACAAAATATCTTCAATAAATCATTAATTTTATTAAAATCTTAA Protein sequence : MYSRKELANAIRMLSIDAVQNAQSGHPGMPMGMADIAEVLWRSFLKHNPANPNWNDRDRFILSNGHGSMLLYSLLHLTGY NLPIEELKKFRQLNSKTPGHPETGETPGVETTTGPLGQGLANAVGMAIAERTLSSYFNRPGYDIINHYTWVFVGDGCLME GISHEVCSLAGTLNLGKLIVFYDKNGISIDGKTAHWFTDDTAKRFESYNWHVLDNIDGHDSESIERSIKQAKLITNQPSI IICNTIIGFGSPNKSGTAESHGAPLGEVEISLIREQLKWNYPPFQIPKEIYKKWNFIEEGSKLEKKWNEKFSLYQSKYPD LSTEYLRRINKKLPVEWDRVTNNYISFLQKNRQSIASRKASQNTLEKYAMILPELIGGSADLSPSNLTMWSRCNSIKDNL SGNYIHYGVREFGMTAIANGISHHGGFIPYTATFLMFVEYARNAVRMAALMCTKHIFVYTHDSIGLGEDGPTHQPVEQLS SLRITPNIDVWRPSDQVETAVAWKKAIEKTSGPTALILSRQNLDQFERSSEQLENISYGAYILYDSKKRLDIIFISTGSE LNVTLIAAKKLASLGYSVRVVSMPCTSVFDRQDASYKEFVLPTYVAKRVAVEASIEDFWYKYVGINGVIIGMKTFGESAP AEDLFKKFGFTVQNIFNKSLILLKS |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| tktA | AAO17218.1 | TktA | Not tested | tcd island | Protein | 0.0 | 66 |
| APECO1_2641 | YP_859417.1 | transketolase | Not tested | Not named | Protein | 0.0 | 59 |
