Gene Information

Name : cdu2 (Bint_0413)
Accession : YP_005593627.1
Strain : Brachyspira intermedia PWS/A
Genome accession: NC_017243
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : Na(+)/H(+) antiporter
Function : -
COG functional category : -
COG ID : -
EC number : -
Position : 447888 - 449078 bp
Length : 1191 bp
Strand : -
Note : -

DNA sequence :
ATGCTTCTCAGTTTAGCTTTGATATTTTTATGCGGAATGATACTTGGAAAAATATTCTCACTTTTAAAACTTCCTTCTCT
TTTGGGTCTTATAATCACAGGTATAATATTAGGTCCATACTGCTTTAATTTGCTAGATGATTCAATACTTTCAATATCAG
CAGATTTAAGAGAATTAGCATTAATAATAATATTAACAAGAGCAGGACTTAATCTTGATATAGAAGATTTAAAAAAGGTA
GGACGTCCTGCAATACTTATGTGCTTTGTGCCTGCAACATTTGAAATAATAGGAATGATTTTAATAGCTCCTAAACTTTT
TGATATTAGCCTATTAGACGCTGCTTTAATGGGTTCGGTTGTTGCTGCTGTATCTCCGGCTGTACTTGTTCCTAAAATGC
TTAAACTTATAGATGAAAAATATGGTACTAATAAAAGCATACCTCAATTATTAATGGCTGGTGCTTCCGTTGATGATATA
TTTGTAATAGTATTATTTACATCTTTTACTTCTCTTGTAAAAGGAGGAAATATATCTTATCTTGATTTTGTAAAAATACC
TACTTCAATTATATTTGGGCTTTTGTTGGGAGTGATTATTGGTTTCATATTATCCAAATTCTTTAGTAGATTTCATATAA
GAGACAGTGCCAAAGTAGTTATAATATTAAGTATATCATTTATACTTGTAAGCATAGAAAATTCAATATCAAATCTATTT
GGAGGCATTATAGGAATATCAGGACTTTTAGCCGTTATGAGTATAGGAGCATATCTTAAAAAATCAAAAGAAGAATTATC
AAAAAGACTTTCATTAAAATATTCTAAACTTTGGGTAGCTGCTGAAATTATGCTTTTCGTACTTGTAGGAGCTGCTGTAA
ATATCAATTATGCTATGAAATCCGGAGCATTAGGAATTATATTAATATTTGCTGTCTTAATATTCAGAATGTTAGGAGTA
CTTGCTTCATTAATAAAAACTAAATTAAATAAAAAAGAAAGAATATTTAGTATGATAGCATATTGTCCTAAAGCAACAGT
TCAGGCAGCAATAGGTTCAATTCCTTTATCATTGGGTTTTGCTTCAGGAGAGATTATACTTGTTATAGCAGTTCTTGCCA
TACTGATAACAGCACCATTAGGAGCTTTTGCCATAGATGCTACTTATAAAAAATTATTAAAGCATGAATAA

Protein sequence :
MLLSLALIFLCGMILGKIFSLLKLPSLLGLIITGIILGPYCFNLLDDSILSISADLRELALIIILTRAGLNLDIEDLKKV
GRPAILMCFVPATFEIIGMILIAPKLFDISLLDAALMGSVVAAVSPAVLVPKMLKLIDEKYGTNKSIPQLLMAGASVDDI
FVIVLFTSFTSLVKGGNISYLDFVKIPTSIIFGLLLGVIIGFILSKFFSRFHIRDSAKVVIILSISFILVSIENSISNLF
GGIIGISGLLAVMSIGAYLKKSKEELSKRLSLKYSKLWVAAEIMLFVLVGAAVNINYAMKSGALGIILIFAVLIFRMLGV
LASLIKTKLNKKERIFSMIAYCPKATVQAAIGSIPLSLGFASGEIILVIAVLAILITAPLGAFAIDATYKKLLKHE

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
cdu2 CAA63558.1 - Not tested PaLoc Protein 7e-58 65