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Name : treA (Bint_1505) Accession : YP_005594704.1 Strain : Brachyspira intermedia PWS/A Genome accession: NC_017243 Putative virulence/resistance : Unknown Product : trehalose-6-phosphate hydrolase Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 1724048 - 1725712 bp Length : 1665 bp Strand : - Note : - DNA sequence : ATGAATTTTAAAAATAAAGTTGTTTATCAAATATATCCAAAATCTTTTATGGACAGCAACAATGATGGATTTGGAGATAT AAAAGGAATAATATCAAAATTAGACTATTTACAAAATTTAGGAGTAGATATTATTTGGAGTACACCTTTCTTCGTTTCTC CTCAAAAAGATAATGGATACGATGTTGCTGATTATTATAATGTTGCTCCTTCTTATGGTACTATGGAAGATGTTGAAGAA CTTATAAAAGAAGCTAAAAAAAGAAATATAGATATAATGTTTGATATGGTATTCAATCATACTTCTACAGAGCATGAATG GTTTAATAGAGCTATGAATGGAGAAGAAAAATATAAAAATTATTATATATTCAAAAAGGGCAAAGTAGTTGATGGGAAAA AAATACCTCCTACAAATTGGGTATCTAAATTCGGAGGAAATGCTTGGCAGTATGTAGAAAAATTTGATGAGTATTATTTG CATTTATTCGATGTCAGTCAGGCTGATTTGAATTGGGATAATAAAGAAGTAAGAAAAGAAATTTTTGATATAGTTAACTT CTGGATAAAAAAAGGAGTTTATGGATTCAGATTTGATGTTATAAACCTTATATCAAAGCCTGAAGTTTTTAAAGATGATT TTGAAGGTGACGGCAGACGCTTCTATACTGACGGAATAAATATACATAAATATTTAAAAGAGTTAAATAAAAATACTTTC GGAAAATATGATAATGCTATCACAGTAGGCGAAATGTCATCAACAAGCATAGAAAACTGCATTAAATATTCAGGTGAAAA AGAAAATGAACTTAGTATGGTATTTAGCTTTCATCATTTGAAAGTTGATTATAAAAATAATGATAAATGGCAGTTAATGG ATTTTGATTTTCAGGAATTAAAAAATATTTTATTCTCTTGGCAGGAAGGAATGCAGGATAATAATGCATGGTCAGCTTTA TTTTGGTGCAATCATGATCAGCCTAGAATAGTATCAAGATTCGGAGACGATAAAAAATACCATAAAGAATCTGCTAAAAT GCTTGCTACAGTTATTCATTGTTTGAGAGGCACTCCTTATATTTATCAAGGTGAAGAAATAGGTATGACTAATGCTTATT TTGATAATATCAATCAATATAAAGATGTTGAGTCAATAAACTATTTCAATATACTTAAAAATAATGGTATAGAAGAAAAA GAAATATATAAAATACTTCAAAGTAGATCAAGAGATAATTCAAGAACTCCTATGCAATGGAATAACAAAGAGAATGCAGG ATTTTCAAATGCTAAACCTTGGATAGAAGTGATTTCTAATTACAAAGATATCAATGCAGAAAATAATATTAATGATGAAA ACTCTATATTTAATCATTATAAAAAATTAATAAAATTAAGAAAAGATTATAAAGTTATTTCAGAAGGTAAAACTATACCT ATATTAAAAGATGATAAAAATGTATTTGCTTTCATAAGAGAATATAACAATGAAAAACTTTTAGTAATAAATAATTTTTA CGGTAATGAGTGCACTATAGATTTAAGCAATATTGATTTTGATATAAAAAAATCGAAATGCCTTCTTTCAAATTATGATG AGGCAGTACTTGATAATACTTTAAAGTTGAGACCTTATGAATCTATAGTTTTATATAATAAATAA Protein sequence : MNFKNKVVYQIYPKSFMDSNNDGFGDIKGIISKLDYLQNLGVDIIWSTPFFVSPQKDNGYDVADYYNVAPSYGTMEDVEE LIKEAKKRNIDIMFDMVFNHTSTEHEWFNRAMNGEEKYKNYYIFKKGKVVDGKKIPPTNWVSKFGGNAWQYVEKFDEYYL HLFDVSQADLNWDNKEVRKEIFDIVNFWIKKGVYGFRFDVINLISKPEVFKDDFEGDGRRFYTDGINIHKYLKELNKNTF GKYDNAITVGEMSSTSIENCIKYSGEKENELSMVFSFHHLKVDYKNNDKWQLMDFDFQELKNILFSWQEGMQDNNAWSAL FWCNHDQPRIVSRFGDDKKYHKESAKMLATVIHCLRGTPYIYQGEEIGMTNAYFDNINQYKDVESINYFNILKNNGIEEK EIYKILQSRSRDNSRTPMQWNNKENAGFSNAKPWIEVISNYKDINAENNINDENSIFNHYKKLIKLRKDYKVISEGKTIP ILKDDKNVFAFIREYNNEKLLVINNFYGNECTIDLSNIDFDIKKSKCLLSNYDEAVLDNTLKLRPYESIVLYNK |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| malL | YP_251987.1 | oligosaccharide alpha-1,6-glucosidase | Not tested | SCCmec | Protein | 8e-118 | 48 |
