Gene Information

Name : hslU (BafPKo_0297)
Accession : YP_005592513.1
Strain : Borrelia afzelii PKo
Genome accession: NC_017238
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : heat shock protein HslVU, ATPase subunit HslU
Function : -
COG functional category : -
COG ID : -
EC number : -
Position : 302887 - 304233 bp
Length : 1347 bp
Strand : -
Note : -

DNA sequence :
ATGAATAAATTAGAAGAGCATTATATAGTTCCTAAAGATGTAGTTGCAGAACTTGATAAGTACATAATAGGTCAAGACGA
AGCTAAAAAATTAGTATCGATTGCTCTTGTTAATAGATATATAAGGTCTAGGCTTCCAAAAGAAATAAAAGATGAAGTAA
TGCCTAAAAACATTATTATGATTGGGTCAACCGGCATTGGAAAGACTGAGATTGCAAGAAGACTTTCTAAGTTAATTAAA
GCTCCTTTTATTAAAGTTGAGGCTACAAAATATACCGAGGTTGGTTATGTTGGTCGTGATGTTGAATCTATGGTTAGAGA
TTTGATGGGCATTGCAGTTAATATGGTAAAAGAAGAGATGTATAGTACTGTAAGAGAAGATGCTTTGATAAAAACAGAGG
AGAGAATAGTTGAGAGTCTTTTTAAAGGATCTGGCAATTCTGAGAATATAGATCCAAATGAAATAAAGGCAGAAGAAAAG
GTAAAAGAGAAGCTTAGAAAAAAACTTAGAGCAGGTGAGCTTGATGATACTACTATTGAAATACAAATTTCTAGTAAAAT
GCCATTTTCCACAATAGAAATATTTACAGGTGGTAATTTTGAAGAGATTGATATGGGAATTGGTGGTTTATTAGGCAATA
TATTTGATAGGAAAAAGAAAAGAGAATTGAAGATTAAAAAGGCTAAGGAAATAATTTTAGCAGAAGAACTTGAAAAATTA
GTTGATCACGAAAATATTTCAGATATTGCAAAATCTAAAGTCGAAAATATGGGGATTATTTTTATTGACGAGATTGATAA
AATAGCTGCTAAGAATAGGAGCGGTAATGATGTATCTAGAGAAGGCGTTCAAAGAGATATTTTGCCAATTATTGAAGGTT
CCAAAGTTAATACAAAATATGGAATAGTTGATACTTCTCATATTTTGTTTATTGCAGCAGGAGCATTTAATTTAGCCAAA
CCCTCTGATTTAATACCCGAGCTTCAAGGAAGATTTCCAATTAAGGTTGAGCTTAAGAGTTTAAGCATAGACGATTTGAA
AAAAATTTTAAAACAAACAAAAAATTCTTTAATAAAGCAATATGTTGCTATGTTTAAGGTTTATAATTTGGATTTAAAGT
TTAGCGAAGAGGCTATAGATAGAATTGCAGAGCTTACTTTTAATATGAATCTTGAGAATGAAAATCTTGGCGCAAGAAGA
CTTCACGGCGTTATGGAAAGAGTGCTTGCAGATCTTTTTTTTGAGGTGCCTGGTAGTAAGTTGAAAAAATTTGAAATAAA
CTTGGACTATGTTAATAAAAAAATACAAATTAACGAACAAAAAGATTTAAATTATTATATAATTTAG

Protein sequence :
MNKLEEHYIVPKDVVAELDKYIIGQDEAKKLVSIALVNRYIRSRLPKEIKDEVMPKNIIMIGSTGIGKTEIARRLSKLIK
APFIKVEATKYTEVGYVGRDVESMVRDLMGIAVNMVKEEMYSTVREDALIKTEERIVESLFKGSGNSENIDPNEIKAEEK
VKEKLRKKLRAGELDDTTIEIQISSKMPFSTIEIFTGGNFEEIDMGIGGLLGNIFDRKKKRELKIKKAKEIILAEELEKL
VDHENISDIAKSKVENMGIIFIDEIDKIAAKNRSGNDVSREGVQRDILPIIEGSKVNTKYGIVDTSHILFIAAGAFNLAK
PSDLIPELQGRFPIKVELKSLSIDDLKKILKQTKNSLIKQYVAMFKVYNLDLKFSEEAIDRIAELTFNMNLENENLGARR
LHGVMERVLADLFFEVPGSKLKKFEINLDYVNKKIQINEQKDLNYYII

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
hslU YP_003728753.1 heat shock protein HslU Not tested cag PAI Protein 2e-73 47