Gene Information

Name : ndhF (BSNT_00353)
Accession : YP_005559336.1
Strain : Bacillus subtilis BEST195
Genome accession: NC_017196
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : NADH dehydrogenase subunit 5
Function : -
COG functional category : -
COG ID : -
EC number : -
Position : 205677 - 207194 bp
Length : 1518 bp
Strand : +
Note : from glimmer orf00244

DNA sequence :
ATGTTAGTTTCGCTGAGTTTGTCATCATTATTAACATTATTTTTTATTATGCTTATGGCTTCTGGGATTAGTGGACTATT
GTTTTTACATCCGCGAGTACCCTTGAGTTTTGTTCGCATTCATATTGGGATCTTGGCTTTACCACTTTTGGTTTCCTTAC
TGATTCTTGCCAATAGTGGTGTGAGTGGAAATGTTGGCCCTTGGCACTTAGATTCCTTAGCTTGTTTAATGACTTTCTTT
GTTCTTGCAATTGGATTCATCATTCAGCGTTTTTCTGTACGTTACTTAATGGGGGATCGATCTTATCGAAAATATTTTAC
GCTTTTTACTTTCACAACAGGAGCTGCTTCAATGACATGGTTAAGTGGTGATCTCCGCTTGATGGTTCTATTTTGGGGAG
CGACTCTTGTTGGATTAACCTTACTTATTAGGTTAAACAGTGCTTGGCAAGTGGCTAGTGAAGCAGCCAAAATTTCTGGA
CGGTTATTTTTGTTAAGTTGGTTTTCTTTGTTTTTTGCGATGACGTGGCTTTTTCATGCCACAGGTCAATGGCAGTTATC
ATTGGTTGTAACAAATGAAAGTTTAGCTGGGCTGGGAGAATGGGGGAGAACAGGGATTCAGCTATTGATTGTATTAGCAG
TGATTATTCCTGCAGCTCAATGGCCGTTCCAAAGATGGTTGGTTGAGTCTATTGTTGCTCCAACCCCTGTTTCTGCAATT
ATGCATGCAGGTTTAGTAAATGCGGGAGGAATAATACTAACTCGATTTTCACCTCTATTTCATGGTGGTATCGCTTCGAT
TATCTTACTTCTGCTTGCTAGCATTTCTGTATTGATTGGAACTGGAATTAGTTTAGTCCAGGTTGATTATAAACGTCAGT
TAGTAGGCTCCACGATTGGACAAATGGGGTTTATGCTCATTCAGTGTGCATTAGGCGCCTATATAGCAGCCATTATTCAT
CTTATTTTACATGGTTTATTCAAAGCTACGTTGTTTCTACAAGCTGGTTCAGCAGTAGGGCGTCATGAAGTATTGGCTCG
CACTAATGAAAGAACATCCTATTTATGGGTCATGGCTGGTCGGATTTTATCCTTAGTAATAGGCGTTGCTTTTTGGCTCG
CTGCTCCTGGAGAGGTATATCAATTCATTAGTGCGCTGATCTTAGGGTGGTCATTGTCCGTTTCTTGGAATCAGCTTGTC
GCTTTTGGAGAGGGTCGAATTGGCCGAATTGCCGGCTTAACTGTTTTAGGAGGAGCAGCCCTCGTATATTTTATCATTCA
TAACCTTTTCTATAAGTGGCTGCATACAACCATTTTTCAAAGTGTTCAACCTCCAATGTCAGCTGTCATGATTGTCGTAT
GTCTCTTATTATTTGGCAGTGCTTTAGGTACATGGGTTGCTCGTTATCGTTCTTCCGTTTTTTTCGCGGTGCTCTATCTT
TGGTTAGTTCGATTAGGTGAAGCAAAACCAAAGTCAGTAGAGAGTCACCCAGACTACCTTAAACAATATATTTCATAA

Protein sequence :
MLVSLSLSSLLTLFFIMLMASGISGLLFLHPRVPLSFVRIHIGILALPLLVSLLILANSGVSGNVGPWHLDSLACLMTFF
VLAIGFIIQRFSVRYLMGDRSYRKYFTLFTFTTGAASMTWLSGDLRLMVLFWGATLVGLTLLIRLNSAWQVASEAAKISG
RLFLLSWFSLFFAMTWLFHATGQWQLSLVVTNESLAGLGEWGRTGIQLLIVLAVIIPAAQWPFQRWLVESIVAPTPVSAI
MHAGLVNAGGIILTRFSPLFHGGIASIILLLLASISVLIGTGISLVQVDYKRQLVGSTIGQMGFMLIQCALGAYIAAIIH
LILHGLFKATLFLQAGSAVGRHEVLARTNERTSYLWVMAGRILSLVIGVAFWLAAPGEVYQFISALILGWSLSVSWNQLV
AFGEGRIGRIAGLTVLGGAALVYFIIHNLFYKWLHTTIFQSVQPPMSAVMIVVCLLLFGSALGTWVARYRSSVFFAVLYL
WLVRLGEAKPKSVESHPDYLKQYIS

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
SAS0410 YP_042536.1 NADH dehydrogenase subunit 5 Not tested vSa¥á Protein 9e-96 52
SAR0452 YP_039900.1 NADH dehydrogenase subunit 5 Not tested vSa¥á Protein 2e-96 52