Gene Information

Name : ABLL_0637 (ABLL_0637)
Accession : YP_005552829.1
Strain : Arcobacter sp. L
Genome accession: NC_017192
Putative virulence/resistance : Resistance
Product : sodium-solute symporter
Function : -
COG functional category : -
COG ID : -
EC number : -
Position : 639975 - 641624 bp
Length : 1650 bp
Strand : -
Note : -

DNA sequence :
ATGTTAAAAGTTTTAGCACTTATTTCAATTATTGCAATATCTGCATTTGCAGCAGGTGATGCAACTTTTGAAGCAACTAA
AAGAGAGCTTAATATTTCTGCAATTATTATGTTTTTCGTATTTATTGTTGGTACATTAGGGATTACTTATTGGGCAGCAA
GAAAAACAAAATCTGCAAGCGATTTTTATACAGCAGGTGGTGGAATTAGTGGATTTCAAAATGGTTTAGCAATTGCTGGA
GATTATATGTCAGCTGCAGCTTTTTTAGGGGTTTCTGGTCTGATTTATATGAAAGGTTATGATGGAGTAATTTATGCTGT
TTCATTTCTTGTTGGTTGGCCTGTTATTTTATTTTTCATGGCTGAAAAATTAAGAAATTTAGGTAAATTTACTTTTGCTG
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CTAATTGCACAAATGGTTGGAGCTGGAAAATTAATTCAAGTATTATTCGGTATGGAATATGAGTATGCTGTATTTATGGT
TGGAGCATTAATGATTATTTATGTAACATTTGGGGGAATGCTAGCAACTACGTGGGTGCAAATTATTAAAGCTTGTTTAT
TACTTTCTGGTGTTTCATTTATGGCAATTATGGTTTTATACAGTTTCGATTTTTCATTTGAAAAATTAGCTGTAAAAGCA
GTTGAAAACCATACAAGTGGTGAGTCTATTTTAAGTCCTGGAGGATTTATTTCAGACCCAATTTCAGCTATTTCATTAGG
TATGGCATTGATGTTAGGTACTGCTGGACTTCCTCACGTTTTAATGAGATTTTTTACGGTTGGAAATGCAAAAGAAGCTA
GAAAATCTGTTGTTTATGCAACTGGATTTGTTGCATATTTTTGGGTAATTATTACAATAGTTGGATTTGGAGCTATTGCA
TTTTTAAATTCAGCTGATGGAGCACAATATTTCGTTGATGGGAAATTATTTGGAGGAAGCAATATGGCTTCAGTTCATTT
ATCTCATATGTTAGGTGGAAATGCATTCTTAGGTTTTATTTCTGCTGTTGCTTTTGCTACTATTTTAGCAGTTGTTTCAG
GTTTAACACTTGCAGGTGCTAGTGCTATATCACATGACATTTATGCAAATGTAATTAATCCAAATGCAAGTGATGAAAAA
GTTGTAAAAATTTCAAAAATTACAGTTATTATAATTGGAATTATTGGAGTAACTTTAGGTATTGCATTTGAATCTCAAAA
TATTGCATATATGGTTGGATTAGCATTTGGAATTGCAGCGAGTGCAAACTTCCCTATTTTATTTTTATCTATTTACTGGA
GTGGATTAACTACAAGAGGTGCATTTATAGGTGGATTTATGGGACTTATAACTGCTGTTGCACTTGTAATTTTAGGACCA
AATGTATGGGTACAAATTTTAGGAAATGAAAAAGCAATTTTTCCTTATGCACACCCTGCACTATTCTCAGTAACTGTTGC
ATTTGTTTCTATTTGGTTCTTTTCTAAACTTGACAACTCTCCTAGAGCTCAAAAAGAAAAAGTATTATTTAGAGCTCAAA
ATGTAAGAGCAAATACAGGAATTGGTGCAGCAGGAGCTGTTTCTCACTAA

Protein sequence :
MLKVLALISIIAISAFAAGDATFEATKRELNISAIIMFFVFIVGTLGITYWAARKTKSASDFYTAGGGISGFQNGLAIAG
DYMSAAAFLGVSGLIYMKGYDGVIYAVSFLVGWPVILFFMAEKLRNLGKFTFADIAAYRLGQKEIRTLAAFGSLSVVILY
LIAQMVGAGKLIQVLFGMEYEYAVFMVGALMIIYVTFGGMLATTWVQIIKACLLLSGVSFMAIMVLYSFDFSFEKLAVKA
VENHTSGESILSPGGFISDPISAISLGMALMLGTAGLPHVLMRFFTVGNAKEARKSVVYATGFVAYFWVIITIVGFGAIA
FLNSADGAQYFVDGKLFGGSNMASVHLSHMLGGNAFLGFISAVAFATILAVVSGLTLAGASAISHDIYANVINPNASDEK
VVKISKITVIIIGIIGVTLGIAFESQNIAYMVGLAFGIAASANFPILFLSIYWSGLTTRGAFIGGFMGLITAVALVILGP
NVWVQILGNEKAIFPYAHPALFSVTVAFVSIWFFSKLDNSPRAQKEKVLFRAQNVRANTGIGAAGAVSH

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
unnamed AAK01502.1 putative amino acid transport protein Not tested PAGI-1 Protein 4e-129 55
cur_1523 YP_001800917.1 transporter Not tested Not named Protein 1e-65 41

• Homologs from CARD and BacMet (resistance genes)

GeneGenBank Accn Product ID of source DB Alignment Type E-val Identity
ABLL_0637 YP_005552829.1 sodium-solute symporter BAC0564 Protein 2e-146 65
ABLL_0637 YP_005552829.1 sodium-solute symporter BAC0570 Protein 2e-137 61