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Name : ABLL_0304 (ABLL_0304) Accession : YP_005552496.1 Strain : Arcobacter sp. L Genome accession: NC_017192 Putative virulence/resistance : Unknown Product : transketolase Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 291980 - 293896 bp Length : 1917 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGTCAAAACAATTATTACAAAAACAAGCAGATACTATCAGATTTTTAGCAGCTGATATGGTGCAACAAGCAAACTCAGG ACATCCAGGTGCACCTATGGGATTAGCTGATATTGCAACAGTATTAAGTAAACATTTAAATGTAAATCCAGCTGATGAAA AATGGCTAAATAGAGATAGATTAGTATTTAGTGGTGGTCATGCTACAGGTTTAGTATACTCTTTATTACACCTTTGGGGA TTTGATGTATCAGTAAATGATATGAAAAACTTCAGACAAACTCACTCTAAAACTCCAGGACATCCAGAATATGGACATAC TCATGGAATTGAAATAACAACAGGACCTTTAGGACAAGGAATTGCAAATTCAGTTGGATTTGCTATGGCTGGAAAATATG CACAAAATCTTCTTGGACGTGATGTAATTAACCATAAAGTTTATTGTTTATGTGGTGATGGAGATTTACAAGAAGGTATC TCTTATGAAGCAACTTCAACAGCAGGGCATCTAAAACTTGATAATCTTGTAATAATTTATGATTCAAACTCTATTACAAT AGAAGGCGATACAAGTATAGCTTGGAGTGAAAATGTTAAAAAAAGATTCCAAGCTATTGATTTTGAAGTAATTGAAATTG ATGGACATAATTTTGAGCAAATTGATAAAGCGTTAGTTACAGCTAAAGCTGCAACTCAACCTGTAATTATTATCGCAAAA ACTGCAATTGCAAAAGGTGCAGTTACTATGGAAGGAAGTCATCATTCTCATGGTGCACCTTTAGGTGAAGATGAAATTGC TAAATCAAAAGAAAAAGCCGGATTTGATCCAAAAGAAAAATTCTTTGTACCAGCAGATGTGAAAGGTGCTTTTGATAAGT TAATCGTGGGTTCTACTGCACAAAATGCTTGGACTGAATCACTTTCAGCTGAAACAAAAGCGAAAATTGAAGAGTTAAAA AATCCAAATTTTGATTCTATTGTTTATCCAACTTTTGAAGTTGATTCAAGTGTTGCAACAAGAGATTCAAATCACAAAAT CTTAAATGCAATAGCACTTGCAATTCCAGGATTTTTAGGTGGAAGTGCTGACTTAGCTCCATCAAATAAAACTGAATTAA AAGATATGGGTGATTTCCCAAATGGAAGAAATATTCATTTTGGTATCAAAGAACATGCAATGGCAGCAATTACAAACGCG ATGAATTTATACGGATTATTTAGAGTTTATTCTGCAACATTCTTTGTATTTAGTGATTATTTAAAACCAAGTGCAAGAAT AGCAGCACTTGCAGGAATCCCTCAACACTTTATTTGGACACATGACTCTATTGGTGTTGGAGAAGATGGACCAACACACC AACCAATTGAGCATTTATCTCAATTTAGAGCATTACCAAACTTTTATACATTTAGACCTGCAGATGCAAGTGAAAATGTT GAAGCTTGGAAAGTAGCACTTAAAATGAAAGCACCAACTGCTTTTGTTTGCTCAAGACAAGGTTTAAAAGTATTAAAAGA TGAAAGAGCTTATGGAAATGTTTCAAATGGAGCTTATTTATTAAAACAAAGAGAAAATGCAAATATCACTATCATGGCAA GTGGAAGTGAATTAATGCTTGCTCTTCAAACAGCTTGTTCTTTAGAAGAAGAAGGAATTATTGCAAACGTAGTTTCTGTT CCTTGTTTTGATTTATTAATGGAACAAAGTAAAGAGTATGTAGAAAAAATCATTGACCCAAAAACTAAAGTATATGCAGT AGAAGCAGCGCGTGGTTTAGAATACTACAAGTATGCTGATGTTGTATTTGGTATGGAAACATTTGGAGCATCTGGACCTG CAAATGATTTATTCAAAGAATTTGGATTTACAATTGATACTTTAAAGGCTAAAATTGTTGCAGATTTTAAAAAATAG Protein sequence : MSKQLLQKQADTIRFLAADMVQQANSGHPGAPMGLADIATVLSKHLNVNPADEKWLNRDRLVFSGGHATGLVYSLLHLWG FDVSVNDMKNFRQTHSKTPGHPEYGHTHGIEITTGPLGQGIANSVGFAMAGKYAQNLLGRDVINHKVYCLCGDGDLQEGI SYEATSTAGHLKLDNLVIIYDSNSITIEGDTSIAWSENVKKRFQAIDFEVIEIDGHNFEQIDKALVTAKAATQPVIIIAK TAIAKGAVTMEGSHHSHGAPLGEDEIAKSKEKAGFDPKEKFFVPADVKGAFDKLIVGSTAQNAWTESLSAETKAKIEELK NPNFDSIVYPTFEVDSSVATRDSNHKILNAIALAIPGFLGGSADLAPSNKTELKDMGDFPNGRNIHFGIKEHAMAAITNA MNLYGLFRVYSATFFVFSDYLKPSARIAALAGIPQHFIWTHDSIGVGEDGPTHQPIEHLSQFRALPNFYTFRPADASENV EAWKVALKMKAPTAFVCSRQGLKVLKDERAYGNVSNGAYLLKQRENANITIMASGSELMLALQTACSLEEEGIIANVVSV PCFDLLMEQSKEYVEKIIDPKTKVYAVEAARGLEYYKYADVVFGMETFGASGPANDLFKEFGFTIDTLKAKIVADFKK |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| tktA | AAO17218.1 | TktA | Not tested | tcd island | Protein | 2e-104 | 44 |
| APECO1_2641 | YP_859417.1 | transketolase | Not tested | Not named | Protein | 3e-93 | 41 |
