Gene Information

Name : ABED_0476 (ABED_0476)
Accession : YP_005538003.1
Strain : Arcobacter butzleri ED-1
Genome accession: NC_017187
Putative virulence/resistance : Resistance
Product : sodium-solute symporter
Function : -
COG functional category : -
COG ID : -
EC number : -
Position : 488606 - 490255 bp
Length : 1650 bp
Strand : -
Note : -

DNA sequence :
ATGTTAAAAATACTTACTTTATTAGGTTTATCATCATTAGCATTATTTGCAGCTGATGGTGCGGGTGCCGTTAATATTAA
CGCTGTTATCATGTTCTTCGTATTTATCGTAGGAACTATGGGTATTACAAAATGGGCTGCAAGTAAAACAAAATCTGCTT
CAGATTTTTATACTGCTGGTGGAGGAATCACAGGATTCCAAAATGGTCTAGCAATTGCTGGAGATTATATGTCTGCTGCA
TCATTCCTTGGTATTTCTGGAATGATTTTCCTACACGGATTTGATGGTATGATTTATGCTATTGGATTCTTAGTTGGTTG
GCCAATTATTTTATTCTTAATGGCTGAAAAATTAAGAAACTTAGGTAAATTCAACTTTACAGATATTGCAGCATATAGAC
TTGATCAACAAAAAATCAGAATTCTTGCTGCATTTGGTTCTTTAACAGTTGTAACTTTCTATTTAATTGCTCAAATGGTT
GGAGCTGGAAAATTAATCGAATTATTATTCCATATTCCTTATGGTTGGTCAGTTGTAATAGTTGGTGCGTTAATGATTAT
TTATGTAACTTTTGGTGGTATGCTTGCAACTACTTGGGTACAAATTATTAAAGCTGTATTACTTCTATCAGGGGTAACAT
TTATTGCTATTATGGTTCTTTCTCACTATGGTTTCTCATTTGGAGAATTAGCAGCTCAAGCTGTTAGTATGCACCCAAAA
GCTGATGCTATCTTAAAACCAGGACCATTCGTTGCTGATCCAGTTTCGGCTGTATCATTAGGACTAGCATTAATGCTTGG
AACTGCTGGATTACCACATATTCTTATGAGATTCTTTACAGTTGGTAACGCAAAAGAAGCTAGAAAATCTGTTGTTTACG
CAACTGCATTTATTGGTTACTTCTATTTAATCATTGGTGTTGTTGGTTTAGGTGCAATTGTTTTCTTATTAAGCCCTGAA
GGTGCTGTTTACTTTAAAGATGGTGTAATCGATCTTAAAGGTATAATCGGTGGAAACAATATGGCTGCTGTTCACTTATC
ACAAGCTGTTGGTGGAGATATTTTCTTAGGATTCATTGCTGCTGTATCATTTGCTACAATCTTAGCTGTTGTTGCAGGTC
TTACATTAGCTGCTTCTAACTCTATTGCACACGACTTATATGCAATCGTTATTAGAAAAGGTCAGGCTACAGATGCTGAA
GAGATGAAAGTTTCTAAAAGAACAGTTTTAGTTATTGGTATCGTTGCGATTTTACTAGGGTTTGCATTTGAAAAACAAAA
TATTGCATTCATGGTTGGTCTTGCTTTTGCTATTGCTGCATCAGCTAACTTCCCAATATTAATTTTATCAATCTACTGGT
CAAAATTAACAACAAGAGGTGCATTTATTGGTGGATTCTTAGGTCTTATCACAGCTATCGTTTTAGTTGTATTAAATAAA
ACTGTATGGGTTGATATCTTTGGATTTGAAAAAGCGATATTCCCTTATACACAACCTGCATTATTCTCTATACTTGCAGC
ATTTATTGGTATTTGGTTCTTCTCTATTACTGATAGTTCAGCTAGAGCAGAAGAAGATAAATCTGGATTTGAAGCTCAAA
AAATTAGAGCTGAAACTGGGATTGGTGCTGACGGAGCTGTTTCTCACTAA

Protein sequence :
MLKILTLLGLSSLALFAADGAGAVNINAVIMFFVFIVGTMGITKWAASKTKSASDFYTAGGGITGFQNGLAIAGDYMSAA
SFLGISGMIFLHGFDGMIYAIGFLVGWPIILFLMAEKLRNLGKFNFTDIAAYRLDQQKIRILAAFGSLTVVTFYLIAQMV
GAGKLIELLFHIPYGWSVVIVGALMIIYVTFGGMLATTWVQIIKAVLLLSGVTFIAIMVLSHYGFSFGELAAQAVSMHPK
ADAILKPGPFVADPVSAVSLGLALMLGTAGLPHILMRFFTVGNAKEARKSVVYATAFIGYFYLIIGVVGLGAIVFLLSPE
GAVYFKDGVIDLKGIIGGNNMAAVHLSQAVGGDIFLGFIAAVSFATILAVVAGLTLAASNSIAHDLYAIVIRKGQATDAE
EMKVSKRTVLVIGIVAILLGFAFEKQNIAFMVGLAFAIAASANFPILILSIYWSKLTTRGAFIGGFLGLITAIVLVVLNK
TVWVDIFGFEKAIFPYTQPALFSILAAFIGIWFFSITDSSARAEEDKSGFEAQKIRAETGIGADGAVSH

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
unnamed AAK01502.1 putative amino acid transport protein Not tested PAGI-1 Protein 3e-134 56
cur_1523 YP_001800917.1 transporter Not tested Not named Protein 3e-79 47

• Homologs from CARD and BacMet (resistance genes)

GeneGenBank Accn Product ID of source DB Alignment Type E-val Identity
ABED_0476 YP_005538003.1 sodium-solute symporter BAC0564 Protein 2e-155 66
ABED_0476 YP_005538003.1 sodium-solute symporter BAC0570 Protein 1e-153 64