Name : ABED_0476 (ABED_0476) Accession : YP_005538003.1 Strain : Arcobacter butzleri ED-1 Genome accession: NC_017187 Putative virulence/resistance : Resistance Product : sodium-solute symporter Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 488606 - 490255 bp Length : 1650 bp Strand : - Note : - DNA sequence : ATGTTAAAAATACTTACTTTATTAGGTTTATCATCATTAGCATTATTTGCAGCTGATGGTGCGGGTGCCGTTAATATTAA CGCTGTTATCATGTTCTTCGTATTTATCGTAGGAACTATGGGTATTACAAAATGGGCTGCAAGTAAAACAAAATCTGCTT CAGATTTTTATACTGCTGGTGGAGGAATCACAGGATTCCAAAATGGTCTAGCAATTGCTGGAGATTATATGTCTGCTGCA TCATTCCTTGGTATTTCTGGAATGATTTTCCTACACGGATTTGATGGTATGATTTATGCTATTGGATTCTTAGTTGGTTG GCCAATTATTTTATTCTTAATGGCTGAAAAATTAAGAAACTTAGGTAAATTCAACTTTACAGATATTGCAGCATATAGAC TTGATCAACAAAAAATCAGAATTCTTGCTGCATTTGGTTCTTTAACAGTTGTAACTTTCTATTTAATTGCTCAAATGGTT GGAGCTGGAAAATTAATCGAATTATTATTCCATATTCCTTATGGTTGGTCAGTTGTAATAGTTGGTGCGTTAATGATTAT TTATGTAACTTTTGGTGGTATGCTTGCAACTACTTGGGTACAAATTATTAAAGCTGTATTACTTCTATCAGGGGTAACAT TTATTGCTATTATGGTTCTTTCTCACTATGGTTTCTCATTTGGAGAATTAGCAGCTCAAGCTGTTAGTATGCACCCAAAA GCTGATGCTATCTTAAAACCAGGACCATTCGTTGCTGATCCAGTTTCGGCTGTATCATTAGGACTAGCATTAATGCTTGG AACTGCTGGATTACCACATATTCTTATGAGATTCTTTACAGTTGGTAACGCAAAAGAAGCTAGAAAATCTGTTGTTTACG CAACTGCATTTATTGGTTACTTCTATTTAATCATTGGTGTTGTTGGTTTAGGTGCAATTGTTTTCTTATTAAGCCCTGAA GGTGCTGTTTACTTTAAAGATGGTGTAATCGATCTTAAAGGTATAATCGGTGGAAACAATATGGCTGCTGTTCACTTATC ACAAGCTGTTGGTGGAGATATTTTCTTAGGATTCATTGCTGCTGTATCATTTGCTACAATCTTAGCTGTTGTTGCAGGTC TTACATTAGCTGCTTCTAACTCTATTGCACACGACTTATATGCAATCGTTATTAGAAAAGGTCAGGCTACAGATGCTGAA GAGATGAAAGTTTCTAAAAGAACAGTTTTAGTTATTGGTATCGTTGCGATTTTACTAGGGTTTGCATTTGAAAAACAAAA TATTGCATTCATGGTTGGTCTTGCTTTTGCTATTGCTGCATCAGCTAACTTCCCAATATTAATTTTATCAATCTACTGGT CAAAATTAACAACAAGAGGTGCATTTATTGGTGGATTCTTAGGTCTTATCACAGCTATCGTTTTAGTTGTATTAAATAAA ACTGTATGGGTTGATATCTTTGGATTTGAAAAAGCGATATTCCCTTATACACAACCTGCATTATTCTCTATACTTGCAGC ATTTATTGGTATTTGGTTCTTCTCTATTACTGATAGTTCAGCTAGAGCAGAAGAAGATAAATCTGGATTTGAAGCTCAAA AAATTAGAGCTGAAACTGGGATTGGTGCTGACGGAGCTGTTTCTCACTAA Protein sequence : MLKILTLLGLSSLALFAADGAGAVNINAVIMFFVFIVGTMGITKWAASKTKSASDFYTAGGGITGFQNGLAIAGDYMSAA SFLGISGMIFLHGFDGMIYAIGFLVGWPIILFLMAEKLRNLGKFNFTDIAAYRLDQQKIRILAAFGSLTVVTFYLIAQMV GAGKLIELLFHIPYGWSVVIVGALMIIYVTFGGMLATTWVQIIKAVLLLSGVTFIAIMVLSHYGFSFGELAAQAVSMHPK ADAILKPGPFVADPVSAVSLGLALMLGTAGLPHILMRFFTVGNAKEARKSVVYATAFIGYFYLIIGVVGLGAIVFLLSPE GAVYFKDGVIDLKGIIGGNNMAAVHLSQAVGGDIFLGFIAAVSFATILAVVAGLTLAASNSIAHDLYAIVIRKGQATDAE EMKVSKRTVLVIGIVAILLGFAFEKQNIAFMVGLAFAIAASANFPILILSIYWSKLTTRGAFIGGFLGLITAIVLVVLNK TVWVDIFGFEKAIFPYTQPALFSILAAFIGIWFFSITDSSARAEEDKSGFEAQKIRAETGIGADGAVSH |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
unnamed | AAK01502.1 | putative amino acid transport protein | Not tested | PAGI-1 | Protein | 3e-134 | 56 |
cur_1523 | YP_001800917.1 | transporter | Not tested | Not named | Protein | 3e-79 | 47 |
Gene | GenBank Accn | Product | ID of source DB | Alignment Type | E-val | Identity |
ABED_0476 | YP_005538003.1 | sodium-solute symporter | BAC0564 | Protein | 2e-155 | 66 |
ABED_0476 | YP_005538003.1 | sodium-solute symporter | BAC0570 | Protein | 1e-153 | 64 |