Gene Information

Name : ABED_0033 (ABED_0033)
Accession : YP_005537560.1
Strain : Arcobacter butzleri ED-1
Genome accession: NC_017187
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : L-lactate transport protein
Function : -
COG functional category : -
COG ID : -
EC number : -
Position : 41036 - 42676 bp
Length : 1641 bp
Strand : -
Note : -

DNA sequence :
ATGCAAACTTGGCAACAAGTATATGCACCAATTGGAGGAAGTTTAGGTTTATCTGCACTTGTAGCACTAATTCCTATTGT
TTTTTTCTTTTTGGCGCTTGCAGTATTTAGAATGAAAGGTCACTATGCAGCAATCATTACATTAGCATTATCGATGATTG
TAGCAGTTTTTGGATTTGAAATGCCAGTTAATATGGTATTTGCATCTGCTGAATATGGTTTCTTATTTGGTTTATGGCCA
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AAAATACTGGAAACCAAAAAATGTTATGAAAACAGTAGAATTAGATGAGGTTGTTTCATCATCACATACAAGTGCTCAAG
TATTTAAAGCATGGTCTCCATTTATTATTCTTTCTGTAATGGTTACAATTTGGACAACAGGTTGGTTTAAAGCTTTCTTT
GCAAAAGGTCAAGTTTTAGCAAGTACTATTTTCAAATTTGAATTTTCAGCTATTCATAATATGATTTTCAAAATGCCTCC
AATTACTAGTGCACCAAAATCTTTTGATGTTGTATATACATTTAATCCTATTTCAGCAACAGGTACAGCTATTTTCTTAA
CAGCTATTATCACTTTATTTATTTTTAGATTAAATATATCAACAGCTACAAAAACAATGGGTGAAACACTATTTGAATTA
AAATGGGCTATTGTATCAATTGGTATGGTTCTTGGTTTTGCATTTGTGATGAATTATTCAGGTATGTCTTCAACTATGGC
ATTAGTTTTAGCAAATACAGGTTTCTTATTCCCGTTCTTCTCTCCATTTCTTGGATGGCTTGGAGTATTCTTAACAGGTT
CAGATACTTCATCAAATGCACTTTTCTGCGGATTACAACAACAAACTGCTCAACAATTAGGACTTAACGAAACATTGATG
GTTGCAGCAAATACAACTGGTGGGGTTTGTGGAAAAATGATCTCTCCTCAATCAATTTCTATTGCTTGTGCATCAACAGG
AATTGTTGGAAAAGAGTCTGATTTATTTAGATTTACAGTTAAACATAGTTTAATTCTTGTAGTAATTATGGGACTTATAA
CTATGACTCAAGCTTATATTTTAACATGGATGATTCCATAA

Protein sequence :
MQTWQQVYAPIGGSLGLSALVALIPIVFFFLALAVFRMKGHYAAIITLALSMIVAVFGFEMPVNMVFASAEYGFLFGLWP
IAWIIVASVFLYKLTVKSGQFEIIRNSIISITEDQRIQVILIGFSFGAFLEGAAGFGAPVAITAAILVGLGFKPLYAAGL
CLIANTAPVAFGALGVPIIVAGQVTSIDAFTIGAMAGRQLPLLSLIIPLWLVAIMDGWKGIKEVWPAALVAGASFAVSQY
LTSNFIGPELPDVTSAIVSIVATTVFLKYWKPKNVMKTVELDEVVSSSHTSAQVFKAWSPFIILSVMVTIWTTGWFKAFF
AKGQVLASTIFKFEFSAIHNMIFKMPPITSAPKSFDVVYTFNPISATGTAIFLTAIITLFIFRLNISTATKTMGETLFEL
KWAIVSIGMVLGFAFVMNYSGMSSTMALVLANTGFLFPFFSPFLGWLGVFLTGSDTSSNALFCGLQQQTAQQLGLNETLM
VAANTTGGVCGKMISPQSISIACASTGIVGKESDLFRFTVKHSLILVVIMGLITMTQAYILTWMIP

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
glcA CAE85240.1 GlcA protein, putative glycolate permease Not tested PAI V 536 Protein 4e-133 65