Name : ABED_1719 (ABED_1719) Accession : YP_005539246.1 Strain : Arcobacter butzleri ED-1 Genome accession: NC_017187 Putative virulence/resistance : Virulence Product : glutamine synthase Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 1783201 - 1784628 bp Length : 1428 bp Strand : - Note : - DNA sequence : ATGGGAAAATTTGTAAATAACACAGAAGAGTTTTTTAAATATTGTCAAGAAAATGATGTTAAATTTGTAGATTTTAGATT TACAGATATGAAAGGTACATGGCACCATGTAACTTATAAATTTACTGCAGTTAGTGCTTCTACTTTAGATAATGGAATGC CTTTTGATGGTTCGTCAATTGATGCTTGGCAACCAATTCACAGATCAGATATGGTGTTAAAACCAGATGTTGGTACTGCG TTTTTAGATCCATTTACTGCAGATTCAACAATCATTGTAATTTGTGATGTTTATGATATTTATAAAGGACAAATGTATGA AAAATGTCCTAGATCTATTGCTAAAAAAACTTTAGATTATTTAGCACAATCAGGTGCTGGTGATGTTGCATATTTTGGAC CAGAAAATGAGTTTTTTGTATTTGAAGATGTAAGAATAAAAGATACAATCAATGAATCATATTATAAAGTTGATAGTGAA GATGGTGAATGGAATGATTCAACAGATTACGAAGGTGGAAATGTTGGGCATAGACCAAGAGTAAAAGGTGGATATTTCCC TGTAGCTCCAATTGATACAGGAGTTGATTTAAGAGCTGAAATGATGCAAGTTTTAGAGCAAGTTGGTTTAGAAGTTGTTT TAGGACACCACGAAGTTGCTCAAGGACAACATGAAATTGGTATTGTATTTGGAGATTTAATTGAAGCTTCTGATAACGTA CAAAAATTAAAATATGTAATTAAAATGGTTGCTCACTTAAATGGTAAATCAGCAACATTTATGCCAAAACCACTTTATGG TGATAATGGAAATGGAATGCACGTACACCAATCAATTTGGAAAGATGGGAAAAACCTATTCTATAAACAAGGTGAGTATG GAAATTTAAGTGATACTGCAAGACATTATATTGGTGGTATTTTTAAACATGCTAGAGCTGTTGCTGCATTTACAAATCCT TCAACAAACTCTTATAAAAGATTAATTCCAGGATTTGAAGCTCCTTCAATTTTAACTTATTCTTCTCAAAATAGAAGTGC TTCTTGTAGAATTCCTTATGGAGCAGGTGAAAAAGCAACAAGAATTGAAATGAGATTCCCAGATTCTACTTCTTGTCCTT ATTTAGCATTCGCTGCTATGTTAATGGCTGGATTAGATGGAATTAAAAATAAATATGAGCCTGTTGGACCAATGGATGAC GATTTATTTGAATTATCATTAGATGAAATTAGAGAAAGAGATATTCCTCAAATGCCTCATACTTTAAGAGGTTCATTAGA AGCTTTAATTAGAGATAATGATTTCTTAAAACCAGTATTTACACAAGAGATGATTGATACTTATCAACATTATAAATTTG AAACTCAAGTTTGGCCTTATGAAGCAAGACCTACACCATTTGAGTTTAAAACAATGTATTCTTGCTAA Protein sequence : MGKFVNNTEEFFKYCQENDVKFVDFRFTDMKGTWHHVTYKFTAVSASTLDNGMPFDGSSIDAWQPIHRSDMVLKPDVGTA FLDPFTADSTIIVICDVYDIYKGQMYEKCPRSIAKKTLDYLAQSGAGDVAYFGPENEFFVFEDVRIKDTINESYYKVDSE DGEWNDSTDYEGGNVGHRPRVKGGYFPVAPIDTGVDLRAEMMQVLEQVGLEVVLGHHEVAQGQHEIGIVFGDLIEASDNV QKLKYVIKMVAHLNGKSATFMPKPLYGDNGNGMHVHQSIWKDGKNLFYKQGEYGNLSDTARHYIGGIFKHARAVAAFTNP STNSYKRLIPGFEAPSILTYSSQNRSASCRIPYGAGEKATRIEMRFPDSTSCPYLAFAAMLMAGLDGIKNKYEPVGPMDD DLFELSLDEIRERDIPQMPHTLRGSLEALIRDNDFLKPVFTQEMIDTYQHYKFETQVWPYEARPTPFEFKTMYSC |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
glnA | YP_003728749.1 | glutamine synthetase | Not tested | cag PAI | Protein | 5e-146 | 62 |
Gene | GenBank Accn | Product | ID of source DB | Alignment Type | E-val | Identity |
ABED_1719 | YP_005539246.1 | glutamine synthase | VFG1399 | Protein | 2e-96 | 49 |