Gene Information

Name : ABED_0167 (ABED_0167)
Accession : YP_005537694.1
Strain : Arcobacter butzleri ED-1
Genome accession: NC_017187
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : transketolase
Function : -
COG functional category : -
COG ID : -
EC number : -
Position : 171276 - 173195 bp
Length : 1920 bp
Strand : +
Note : -

DNA sequence :
ATGTCAAAACAACTTCTACAAAAACAAGCAGATACAATCAGATTTTTAGCAGCTGATATGGTTCAACAAGCAAATTCAGG
ACATCCTGGTGCTCCAATGGGACTTGCTGATATTGCAACAGTTTTAAGTAAACATTTAAATGTAAATCCAGCTGACGAGA
AATGGCTAAATAGAGATAGATTAGTATTTTCAGGTGGTCATGCAACTGGATTAGTTTACTCTTTATTACATCTTTGGGGA
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ATGAATTTATATGGATTATTTAGAGTTTATTCTGCAACATTCTTTGTATTTAGTGATTATTTAAAACCAAGTGCAAGAAT
AGCTGCACTTGCAGGAATTCCTCAACACTTTATTTGGACTCATGACTCTATTGGTGTTGGAGAAGATGGTCCAACTCACC
AACCAATTGAGCATTTATCACAATTTAGAGCATTACCAAATTTCTATACATTTAGACCAGCTGATGCAACAGAAAATATT
GAGTCTTGGAAAGTTGCTTTAAAAATGAAAGCTCCAACAGCATTTGTTTGCTCAAGACAAGGTTTAAGGGTATTAAAAGA
TGAAAAAGCTTATGGAAATGTTTCAAATGGAGCTTATTTATTAAAAGAAAGAGAAAATGCAAATATCACTATCATGGCAT
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TGAAGCAGCACGAGGTTTAGAATACTACAAATATGCTGATGTTGTATTTGGTATGGAAACATTTGGAGCAAGTGGTCCAG
CAAATGATTTATTTGAAGAGTTTGGATTTACAAAAGATAAATTAAAAGCAAAAATTATTGCTGACTTCAAAAATAATTAA

Protein sequence :
MSKQLLQKQADTIRFLAADMVQQANSGHPGAPMGLADIATVLSKHLNVNPADEKWLNRDRLVFSGGHATGLVYSLLHLWG
FNVSINDIKNFRQTHSKTPGHPEYGHTHGIEITTGPLGQGIANAVGFAMAGKYAQNLLGSDVINHKVYCLCGDGDLQEGI
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• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
tktA AAO17218.1 TktA Not tested tcd island Protein 2e-106 43