Gene Information

Name : ABED_1092 (ABED_1092)
Accession : YP_005538619.1
Strain : Arcobacter butzleri ED-1
Genome accession: NC_017187
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : ammonium transport protein
Function : -
COG functional category : -
COG ID : -
EC number : -
Position : 1117085 - 1118404 bp
Length : 1320 bp
Strand : +
Note : -

DNA sequence :
ATGAAAAAGTGGGTTTTATTAACTTCACTAATGAGTTCTTTAGCTTTTGCTGAAGAAGTAACGGAGCCAGCTGTATTAAA
TACAGGAAATACTGCTTGGATGATGATGTCAACTGCATTAGTATTACTAATGACACCAATTGGTTTAGCATTATTCTACT
CTGGTATGACAAGAGTAAAAAATGTTTTAAATACTTATTTAATGGTATTTGGTGCATTTACTATTTCATTTATTGCATGG
GTTATAGCAGGCTTTTCAATCGGATTTGGAACAATGGAAGGATCACTAAATCAGTTCATAGGTGGCTTTTCTCATATGAT
GTTAAGTGGTATTAGTTGGTCTGACCTTTCAGCTGAAACAGGGCAAACATATCCAAAGTTTGTGTTCATTGTATTTCAAG
GTACTTTTGCAGCTATTACAATAGCAATTGCAGCTGGTTCAGTTATTGAAAGAATGAAGTTTTCTACTTGGATGATTTTT
GCATTTATTTGGACTATAGTTGTTTATGCTCCAATTGTACACATGGTTTGGGGTGGAGGATACCTATTTAATGAAGGTGC
TTTAGATTTTGCTGGTGGAACAGTTGTTCATATGAATGGTGGTTTAGCTGGTTTAGTTCTTGCAATTTTACTTGGTAAAA
GAAATGATTATCCAAGAACTGCGATGAAACCTGCAAGTATCATCTTAACAGCTGTTGGTGCAGGTTTATTATGGTTTGGA
TGGTATGGATTTAATGGTGGTTCAGCATTTGGTGCAAATGAAATAGCTGGTCTTGCTTACCTTACAACAACAATTGCAAC
GTCAATTGCAGCTATTACTTGGTTGATTATTGAAACAATTATATTTAAAAAAGCTACGCTTTTAGGTGCAGCTTCAGGTG
CAATAGCAGGTTTAGTAGCTATTACTCCAGCAGCAGGATTTGTTGATGTTAGTGGTTCTTTAATAATAGGTATAGTTGGT
TCTATCGTAGCATTCTTTGGAGTTGCTATGTTGAAGAAAAAACTTGGATATGATGATAGTTTAGATGCATTTGGTATTCA
CTTCCTTGCTGGTATGTGGGGAGCAGTTGCAACAGGAATCTTTGCGCTAAATGACAAAGATCTTTTATGGGCTAGTCCAT
TAAAAGATGCTGATGATAGATTAGCTCAAATTTTTGTTCAATTTGAATCAATAGCAGTTGTAGGTATCTATACATTAATT
GGAACAATAGTTGTTTACTATATAGCTTCAATGTTAACAAAAGGTGCAAGAGTTACTGAAGAAGAAGAAAGACAAGGTCT
TGATGAGTCGTTACACGGTGAACGTGGATTTAACCTATAA

Protein sequence :
MKKWVLLTSLMSSLAFAEEVTEPAVLNTGNTAWMMMSTALVLLMTPIGLALFYSGMTRVKNVLNTYLMVFGAFTISFIAW
VIAGFSIGFGTMEGSLNQFIGGFSHMMLSGISWSDLSAETGQTYPKFVFIVFQGTFAAITIAIAAGSVIERMKFSTWMIF
AFIWTIVVYAPIVHMVWGGGYLFNEGALDFAGGTVVHMNGGLAGLVLAILLGKRNDYPRTAMKPASIILTAVGAGLLWFG
WYGFNGGSAFGANEIAGLAYLTTTIATSIAAITWLIIETIIFKKATLLGAASGAIAGLVAITPAAGFVDVSGSLIIGIVG
SIVAFFGVAMLKKKLGYDDSLDAFGIHFLAGMWGAVATGIFALNDKDLLWASPLKDADDRLAQIFVQFESIAVVGIYTLI
GTIVVYYIASMLTKGARVTEEEERQGLDESLHGERGFNL

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
BJAB07104_00287 YP_008207752.1 Ammonia permease Not tested AbaR25 Protein 7e-54 49
BJAB0868_00291 YP_008211617.1 Ammonia permease Not tested AbaR26 Protein 7e-54 49