|
Name : CDBI1_13050 (CDBI1_13050) Accession : YP_006199750.1 Strain : Genome accession: NC_017179 Putative virulence/resistance : Virulence Product : pyruvate-flavodoxin oxidoreductase Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 2940117 - 2943656 bp Length : 3540 bp Strand : - Note : 'COG0674 Pyruvate:ferredoxin oxidoreductase and related 2-oxoacid:ferredoxin oxidoreductases, alpha subunit' DNA sequence : ATGGCTAAGTTTATGAAAACACTTGATGGAAATACAGCTGCAGCTCATGTTGCCTATGCGTTTACAGATGTAGCAGCTAT ATATCCAATCACACCATCTTCAACTATGGCTGAAGTAGTTGATGAGTGGGCATCACAAGGAAGAAAAAATATATTTGGAC AAACAGTTAATGTTGTTGAAATGCAGTCAGAAGCAGGTGCATCAGGAACATTCCACGGTTCTTTACAAGGAGGAGCTTTA ACTTCTACTTTTACAGCATCTCAAGGTTTATTATTAATGATACCTAACATGTATAAAGTTGCAGGAGAGTTATTACCAGG AGTATTCCATGTAAGTGCTCGTGCTTTGGCATCTCAAGCGTTATCAATATTTGGGGATCACCAAGACGTTATGGCTGCTA GACAAACTGGATGTGTATTATTAGCTTCTGGTTCAGTTCAAGAAGTAGCTGATATAGCACCTGTTGCACATTTAGCTGCA ATAGAAGGTAGATTACCATTTATACATTTCTTTGATGGATTCAGAACTTCACATGAAATCCAAAAAGTTGAATTACTAGA AAATGAAGATTATGCAAGTTTATTAAACTTTGAAGCAGTTCAAGCATTTAGAGATAATGCTTTATCTCCAAATCATCCAG TTGCTCGTGGTACTGCTCAAAACCCAGATATATATTTCCAAACTAGAGAAGCTTCTAATAAATACTATCAAAATATAGTA GGTATAGTTGAAAAATACATGGAAAAAATGAGTAATTTAACAGGTAGAAAACATAGTTTATTTGATTACTATGGAGCAGA AGATGCTAAATACGTATTAATAGCTATGGGTTCAGTAACAGAAACAATAGAAGAAACTATAGATTACTTAAATGCTAAGG GAGAAAAATATGGTTTAGTTAAAGTTCATTTATATAGACCATTCTCAATGAAACATTTCTTAGATGCTATGCCATCTACT GTTGAAAGAATATGTGTACTTGATAGAACTAAAGAGCCAGGTTCAACTGGTGAACCATTATACTTAGATGTACGTGATGT ATTCTATGGAAAAGAAAATGCTCCTATGATAATAGGTGGAAGATACGGATTAGGTTCAAAAGATACTACTCCTTCAGATA TAAAAACTGTTTTTGATAACTTAGTTTCAGAACAACCTAAAAATGGATTTACAGTAGGTATAGTTGATGATGTAACTAAT ACTTCTTTAACTCCATCTGAGCCAATAAAAATAGCTTCTAAAGGAACTATAAGATGTAAGTTCTGGGGATTAGGTTCTGA CGGTACTGTTGGAGCTAATAAACAAGCTATCAAAATAATCGGTGACCATACTGAAAAATATGCTCAAGCTTACTTTGATT ATGACTCTAAAAAATCTGGTGGTATAACTATGTCTCACTTAAGATTTGGTGATACTCCAATAAGAGCTACTTATTTAATA GATGAAGCTGATTATATTGCCTGTCATAAACAATCATATGTTTATCAATATGATTTATTAAAAGGTCTTAAAAAAGGTGG TACATTTGTACTTAACACTATATGGGACCAAGCAGGACTTGAAGAACATTTACCAGCTCATATGAAACAATATATAGCTA AAAATGATATAAAATTCTATACAGTTAATGCTGTTAAACTAGGACAAGAAATAGGTCTTGGAAACAGAATAAACATGATA ATGCAATCTGCATTCTTTAAATTAGCTGAAATAATACCAGAAGAAGATGCTGTTAAATACTTAAAAGATTCTATAGTTAA AGCTTATGGTAAAAAAGGTGAAAAAATAGTTAATATGAACTATGCTGCTGTTGATGCAGGAATAAATGCTTTAGTTAAAG TTGAAGTTCCAGCTTCTTGGGAAAATGCTGTTGATGCAGATAAAGGAGAAGTTAAAGAACCAGAATTTATAAAAAATATA CTAAGACCAATGACTGCACAAGAAGGAAACAACTTACCAGTAAGTACATTCAATGGTATAGAAGATGGAACATTCCCTTG TGGTACTGCAGCTTATGAAAAACGTGGTATAGCTGTTGATGTTCCTGAATGGATAATAGATAACTGTATTCAATGTAACC AATGTTCTTTTATATGTCCTCATGCATGTATAAGACCAGTATTAGTTACTGAAGAAGAATTAGCTAATGCTCCAGAAGGA TTTGAAGCTAAAAAAGCATTAGGTAAAGGATTAGAAGGATTAAAATATAGAATTCAAGTTAGTCCACTTGACTGTACAGG ATGTGGAAACTGTGCTGACATATGTCCAGCTAAAGAAAAAGCTTTAGTTATGAAGCCAATAGATACTCAACTTGATACAG AGTTAGATAATTGGGCATTTGCAGTAAATCCTGATGAAGTAGCTCCAAAAGTTGATGTTATGCCTGCAAATACTGTTAAA GGAAGTCAATTTAGACAACCATTAATGGAGTTTTCAGGAGCATGTGCTGGATGTGGAGAAACTGCGTACATTAAAGTAGT TACACAATTATATGGAGATAGAATGATGATAGCTAATGCTACTGGATGTTCTTCTATATGGGGAGCTTCTGCACCATCAA TTCCTTATACTTGTAACCATGAAGGTAAAGGTCCATCTTGGGCAAATTCTTTATTCGAGGATAATGCTGAATATGGATTT GGTATGTACACAGCTGTTAAGCAAATAAGAAATAAAATAGTAGATGCTATGACAGAGTTAGTTTCTATGGATATCTGTGA AGATGCTAAAGCAGTATTTACAGAGTGGTTAGATTCTAGAAATGATGGAGAAGCTTCTAAAGTAGCAAGTGCTAAGGTTG TTGAATTATTAGAAAAACCAGCTTGTGATTGTACAGATGAAAAAGCTAAAGAATTAGTAAAAGCTATAAAAGATAGAAAA GATTATCTAGTTAAGAGATCTCAATGGATACTAGGTGGAGACGGTTGGGCATATGATATTGGTTACGGTGGATTAGACCA TGTTCTTGCATCTGGTGAAGATGTAAACGTACTTGTATTTGATACAGAAGTATATTCAAATACAGGAGGTCAAGCTTCTA AAGCTACTCCAGCTGCTGCTATGGCTAAGTTTGCTGCTTCAGGTAAAAAATCTAGAAAGAAAGATTTAGGAATGATGGCT ATGACATATGGAAACGTATATGTAGCTCAAGTTGCTATGGGGGCTGATAAAAATCAATTTATCAAAGCCGTTTTAGAAGC TGAAAAACATGATGGGCCATCTCTAATAATAGCTTATGCTCCATGTATAAACCATGGATTAAAAGAAGGTATGGGAAGAA CTGTGGCTAATGAAGCACAAGCTGTTGCTTGCGGATACTGGCATTTATACAGATTCAATCCAGAAGTAAAAGCTGAAGGT AAAAACCCATTCACTTTAGATTCAAAAGAACCAACTGCAAGCTTCAAAGATTTCATACTTGCACAAGTAAGATATTCTGC TATAGCTAAACAATTCCCAGAGGAAGCTGATGGATTATTTGCTAAAGCTGAAGCTGATGCTAAAGAAAGATATGAAGGAT ACAAAAAATTAGCTGAATAA Protein sequence : MAKFMKTLDGNTAAAHVAYAFTDVAAIYPITPSSTMAEVVDEWASQGRKNIFGQTVNVVEMQSEAGASGTFHGSLQGGAL TSTFTASQGLLLMIPNMYKVAGELLPGVFHVSARALASQALSIFGDHQDVMAARQTGCVLLASGSVQEVADIAPVAHLAA IEGRLPFIHFFDGFRTSHEIQKVELLENEDYASLLNFEAVQAFRDNALSPNHPVARGTAQNPDIYFQTREASNKYYQNIV GIVEKYMEKMSNLTGRKHSLFDYYGAEDAKYVLIAMGSVTETIEETIDYLNAKGEKYGLVKVHLYRPFSMKHFLDAMPST VERICVLDRTKEPGSTGEPLYLDVRDVFYGKENAPMIIGGRYGLGSKDTTPSDIKTVFDNLVSEQPKNGFTVGIVDDVTN TSLTPSEPIKIASKGTIRCKFWGLGSDGTVGANKQAIKIIGDHTEKYAQAYFDYDSKKSGGITMSHLRFGDTPIRATYLI DEADYIACHKQSYVYQYDLLKGLKKGGTFVLNTIWDQAGLEEHLPAHMKQYIAKNDIKFYTVNAVKLGQEIGLGNRINMI MQSAFFKLAEIIPEEDAVKYLKDSIVKAYGKKGEKIVNMNYAAVDAGINALVKVEVPASWENAVDADKGEVKEPEFIKNI LRPMTAQEGNNLPVSTFNGIEDGTFPCGTAAYEKRGIAVDVPEWIIDNCIQCNQCSFICPHACIRPVLVTEEELANAPEG FEAKKALGKGLEGLKYRIQVSPLDCTGCGNCADICPAKEKALVMKPIDTQLDTELDNWAFAVNPDEVAPKVDVMPANTVK GSQFRQPLMEFSGACAGCGETAYIKVVTQLYGDRMMIANATGCSSIWGASAPSIPYTCNHEGKGPSWANSLFEDNAEYGF GMYTAVKQIRNKIVDAMTELVSMDICEDAKAVFTEWLDSRNDGEASKVASAKVVELLEKPACDCTDEKAKELVKAIKDRK DYLVKRSQWILGGDGWAYDIGYGGLDHVLASGEDVNVLVFDTEVYSNTGGQASKATPAAAMAKFAASGKKSRKKDLGMMA MTYGNVYVAQVAMGADKNQFIKAVLEAEKHDGPSLIIAYAPCINHGLKEGMGRTVANEAQAVACGYWHLYRFNPEVKAEG KNPFTLDSKEPTASFKDFILAQVRYSAIAKQFPEEADGLFAKAEADAKERYEGYKKLAE |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| unnamed | AFJ97267.1 | pyruvate ferredoxin | Virulence | Not named | Protein | 0.0 | 57 |
