|
Name : ABZJ_00319 (ABZJ_00319) Accession : YP_005524275.1 Strain : Acinetobacter baumannii MDR-ZJ06 Genome accession: NC_017171 Putative virulence/resistance : Unknown Product : putative general secretion pathway protein Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 345128 - 347404 bp Length : 2277 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGGCTTTATTGAATCATCAACGTCCACTTTGGGCATTACTTGCAGCAGCCCCATTGATTGCGACAGTAAGTAGCAGTGC CTATGCCCAAACATGGAAGATCAATTTACGTGATGCTGACTTAACTGCCTTTATTAATGAAGTTGCAGACATTACAGGAA AGAACTTCGCTGTAGATCCGAGAGTACGTGGTAATGTCACGGTTATTTCTAATAAGCCATTAAATAAAGATGAAGTTTAT GACCTATTTCTTGGGGTCTTAAATGTAAACGGGGTGGTTGCAATTCCTTCTGGTAATACCATTAAGCTTGTACCGGATAG CAATGTTAAAAACTCGGGAATTCCTTATGATTCTAGAAATAGGGTCCGTGGTGATCAAATCGTTACACGTGTGATTTGGC TGGAAAATACTAATCCAAATGACTTAATTCCAGCACTCCGTCCCTTAATGCCACAATTTGCACATATGGCGGCAATTGCA GGAACCAATGCACTTATTGTTTCTGATAGAGCTGCGAATATTTATCAACTTGAAAATATTATTCGTAACTTGGATGGAAC TGGGCAAAATGATATTGAAGCGATCACGCTTCAGTCGAGCCAAGCAGAAGAAATTATTACCCAGCTTGAAGCGATGAGCG CAACAGGCGCATCTAAAGATTTTAGTGGTGCCCGTATTCGTATTATTGCTGATAATCGGACAAACCGTATTTTAATAAAA GGTGATCCGCAAACACGTAAACGTATTCGTCATATGATTGAGATGCTGGATGTACCTTCGGCAGATCGTTTAGGTGGCTT AAAAGTTTTCCGTTTGAAGTATGCCAGTGCTAAAAACTTGTCTGAAATTTTGCAAGGCTTAGTCACAGGACAGGCAGTAT CTTCATCGAATAATAGTAATAATTCATCTAACTCATCGAATCCGATTAATAGTTTAATTGGTAATAACCAGAATTCTGGT TCAAATACATCGGGTTCAAATGGTGCCTCAATTTCAACTCCTGCAATTAACCTAAACGGTAATTCGAACAGTAGTAATCA GAATAATATCACCAGCTTTAATCAAAACGGTGTGAGTATTATTGCAGATAATGCTCAGAACTCATTAGTAGTTAAAGCTG ATCCCCAATTAATGCGTGAAATTGAATCAGCGATTCAACAACTAGATGTTCGTCGTCAACAAGTGCTTATTGAGGCCGCA ATTATTGAAGTCTCTGGAGATGATGCAGATCAACTTGGAATTCAATGGGCACTCGGTGATTTATCTAGTGGGATTGGTTT ACTTAGCTTTAGTAATGTAGGGGCGAGTTTATCTTCTATCGCTGCTGGTTATTTATCGGGTGGTTCGGCTGGAGCTGCAT CTGCTATCGCTAATGGAGCTAATAAAGGTAATGGTGCAACTTTAGGATTGGGCAATTTTGATAATTCTCGTAAGGCATAT GGTGCACTAATTCAGGCTCTCAAAACCAATACTAAATCAAACTTACTTTCGACACCGTCCATTGTGACGATGGATAATGA AGAAGCTTATATTGTTGTAGGTCAGAACGTTCCATTTGTCACAGGGTCGGTTACTACCAATAGTACAGGTATCAATCCCT ATACAACTGTTGAGCGTAAAGATGTCGGTGTGACCTTGAAAGTTGTTCCACATATCGGTGAAGGGGGTACTGTTCGTTTA GAAGTAGAGCAAGAAGTTTCTGCTGTTCAAGATAGCCGTGGGCAAGCAGCTGACTTGGTGACAAGTAAACGCGCTATTAA AACAGCTGTTTTAGCCGAGCATGGGCAGACTGTGGTGCTAGGTGGTTTGGTGTCGGATGACACTTCGCTTTCAAGACAAG GTATACCTGGTTTAAGTAGTATTCCTTATGTTGGGCGATTGTTCCGATCAGATAACAGAAGCAATGTAAAACGTAACCTT CTCGTTTTTATTCACCCAACAATTGTGGGCGATGCAAATGATGTACGCCGTTTATCTCAGCAGCGCTATAATCAACTTTA TAGCTTGCAATTGGCTATGGATAAAAATGGCAACTTTGCAAAATTACCTGAGCAAGTTGATGATATTTATAACCAAAAAA TGACCCCGCCGAGTATTGCCTCCAAGCCAAAAAATTACCAACAGGTTCCATCAGGTGGTAAAAGTTCGACCATAACTACG CCGGTAGCTGTAGAACCTACCGTCCAAAAGCAAACCCTACAGTTGCCTGATCCTGAAATTAATCGTACTAAAAATACAGT AACAACAACGACACTGCGTCCAAGCACAGCGCCGTAG Protein sequence : MALLNHQRPLWALLAAAPLIATVSSSAYAQTWKINLRDADLTAFINEVADITGKNFAVDPRVRGNVTVISNKPLNKDEVY DLFLGVLNVNGVVAIPSGNTIKLVPDSNVKNSGIPYDSRNRVRGDQIVTRVIWLENTNPNDLIPALRPLMPQFAHMAAIA GTNALIVSDRAANIYQLENIIRNLDGTGQNDIEAITLQSSQAEEIITQLEAMSATGASKDFSGARIRIIADNRTNRILIK GDPQTRKRIRHMIEMLDVPSADRLGGLKVFRLKYASAKNLSEILQGLVTGQAVSSSNNSNNSSNSSNPINSLIGNNQNSG SNTSGSNGASISTPAINLNGNSNSSNQNNITSFNQNGVSIIADNAQNSLVVKADPQLMREIESAIQQLDVRRQQVLIEAA IIEVSGDDADQLGIQWALGDLSSGIGLLSFSNVGASLSSIAAGYLSGGSAGAASAIANGANKGNGATLGLGNFDNSRKAY GALIQALKTNTKSNLLSTPSIVTMDNEEAYIVVGQNVPFVTGSVTTNSTGINPYTTVERKDVGVTLKVVPHIGEGGTVRL EVEQEVSAVQDSRGQAADLVTSKRAIKTAVLAEHGQTVVLGGLVSDDTSLSRQGIPGLSSIPYVGRLFRSDNRSNVKRNL LVFIHPTIVGDANDVRRLSQQRYNQLYSLQLAMDKNGNFAKLPEQVDDIYNQKMTPPSIASKPKNYQQVPSGGKSSTITT PVAVEPTVQKQTLQLPDPEINRTKNTVTTTTLRPSTAP |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| BJAB07104_00335 | YP_008207800.1 | Type II secretory pathway, component PulD | Not tested | AbaR25 | Protein | 0.0 | 100 |
| BJAB0868_00339 | YP_008211665.1 | Type II secretory pathway, component PulD | Not tested | AbaR26 | Protein | 0.0 | 100 |
