Gene Information

Name : YPD8_0672 (YPD8_0672)
Accession : YP_005507755.1
Strain : Yersinia pestis D182038
Genome accession: NC_017160
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : ABC-transporter transmembrane protein
Function : -
COG functional category : -
COG ID : -
EC number : -
Position : 835356 - 837113 bp
Length : 1758 bp
Strand : -
Note : -

DNA sequence :
ATGATTAAGTTATCAGGTTTAAGCACGTTAACCGGAGGCCGCTTAAAGGGGCTGAAAGGCATGGTCAGTATTGCCATCAT
TGATGCTTTTCTGGCATCGCTACCCTATGCTTTTCTCTATTATATTGTGTTGGATATGTTGTCCTCTCACCCTGATGCCA
TCTATCAACTTAAACTGACCGGATTTTGTGGGTTATTGATGTTGGTCCGAGTGATATTAGCCAGAGTCCTGTACTTCCAT
GTCGCAATTATTGGGTTCGATGCAGGGGCTAAAATTCGAATACGTCTTGGTGAGCACCTACGACGTTTGCCGATGGGTTT
TTTCTACCGTTCGGATATGAGCAGTGTCAATAATACGCTGCTAAAAGACATTGATATGATCGAAAATATTTTCACTCATC
TCTATGCGCCCATTATTGCGACTGCTTCGGTGCTCTGTTTCTTTTCCTTAGGACTCTTGCTAAAAGATTGGCGCATGGCG
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TGACAGGGGCCGCTTTTCAGCGGTTATCACAGGTATTAACCACCACCTATCAACAATCATTAACGGCAGAAAAAGCCGGT
GTCTGGCCGATCTACAGTTTTAATGTATTGGTTGAGTGCGGCTTTATTGTGTTGTTGGTTGCACTCACCTGGGGCTGGGT
AGGGGGGAGGATCCCCTTGTCTGAAGTATTGATTTTTTTAATTGCTGCAGTACGGTTTTTCCGTCCTTTACTCAACATGT
CGATGTTTTTGGCAGAGCTAAATTACTTTGGGTTAGCCGTAGAGCGAGTCGAAAAGGTTTTTGCTATTCCTGAACTTGTT
CATGGTGATTTACAGCCTAATATTACTGATATGCGGATTCGATTGGATAATGTTTGTTTTGCATATCCGGATAAACCATT
GCTATTTAATCATCTCAATCTCACGATAGAGAAAAATAAGATTACTGCATTGGTCGGGCCTTCCGGTTCGGGGAAATCAA
CACTGGCATCATTAATTGCACGTTTTTGGGATATTGAACAAGGCCATATATTGGTTGGCGATAAAGCTAATGAAATGAGT
CTTGCAGAGATAGATGTGGACTATTGGCAGCGCCATTTAAGCGTAGTCTTCCAAAAAAGCTATGTGTTAAATGAGACGAT
CGCCAATAATTTAAGGGTTGCCTGCCCTGATGCGACGAATGAGCAGTTGCTGTCGGTTTGCCGTGCAGCACAACTCTTGC
CATTGCTTGATAAGCTCCCCTCAGGGTTAGACACCGAGATCGGGGCGGGTGGTGTGCATCTCTCCGGTGGGGAGTTACAG
CGGCTGGCCATTGCCAGAGCTTTATTAAAAGATGCGCCCTTGATTATTTTAGATGAAGCCACCGCATCACTCGATCCAGA
AAATGAACAAGATATTCAGTTGGCAATGCAAGCCTTAATCCGAGGGAAAACCGTGCTGGTGATTGCGCATAAATTATCTT
CTATTCAATATGTCGATCATATTATTGTTATGGATAGCGGGCAGATTGTTGAAGAAGGGGACCATTCGACACTTATTCAG
CATCAAGGGCTTTACGCTGAATTATGGTCATTACAACAGCAAGCACAAGCCTGGCAACCAGGGAGACTGGGTGAATAG

Protein sequence :
MIKLSGLSTLTGGRLKGLKGMVSIAIIDAFLASLPYAFLYYIVLDMLSSHPDAIYQLKLTGFCGLLMLVRVILARVLYFH
VAIIGFDAGAKIRIRLGEHLRRLPMGFFYRSDMSSVNNTLLKDIDMIENIFTHLYAPIIATASVLCFFSLGLLLKDWRMA
LAMLSTLPLAVCAYILTRRYAQRWQEYMQLLMFKLNDALMEYIDGLKELKAYRMTGAAFQRLSQVLTTTYQQSLTAEKAG
VWPIYSFNVLVECGFIVLLVALTWGWVGGRIPLSEVLIFLIAAVRFFRPLLNMSMFLAELNYFGLAVERVEKVFAIPELV
HGDLQPNITDMRIRLDNVCFAYPDKPLLFNHLNLTIEKNKITALVGPSGSGKSTLASLIARFWDIEQGHILVGDKANEMS
LAEIDVDYWQRHLSVVFQKSYVLNETIANNLRVACPDATNEQLLSVCRAAQLLPLLDKLPSGLDTEIGAGGVHLSGGELQ
RLAIARALLKDAPLIILDEATASLDPENEQDIQLAMQALIRGKTVLVIAHKLSSIQYVDHIIVMDSGQIVEEGDHSTLIQ
HQGLYAELWSLQQQAQAWQPGRLGE

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
YPO0770 YP_002345826.1 ABC transporter transmembrane protein Not tested HPI-2 Protein 0.0 100