Name : YPD4_3423 (YPD4_3423) Accession : YP_005506630.1 Strain : Yersinia pestis D106004 Genome accession: NC_017154 Putative virulence/resistance : Unknown Product : hypothetical protein Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 4343371 - 4344738 bp Length : 1368 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGTTAAGACCAACAAAGCCATTAATATCTTCCGGCATTTCGCAGTCTACCACTGCGGTCTATTGCCGCCGCCCATATTT TCTTGCTGGGATGACATTACTGATTGGGTTATTTAGCACCTCCGCATGGTCAAACTGCACCCGTATTACCGCACAAAATC AGATAAGTTCCAGTGATGGTACCGCCGCTTCATGGTTGGGTTCCAGAGACGATAATAATGGTTCGCTCAACTTACCCAGT ATTGTTGATCTCAGCACCAATGCGAATTTTCAGCCCGATGGCACGTTACTGGCATCAGCAACCTCAGACTTTACGACCTT TGCAGTGAATACCGGTTATGCCCTTGACCAGGTCCTCTTTCGCTGTGATGCGGCTGATGTGGATCAGCTCTATGAGATGT ATGCCACTAACGGTGACAGCACTTATGGTGGCAGATATGAAGACGGCACGATTGCAGGCAATGTGTCCTATGGCTATGCT ACTACAGTGATGAATGTGGTTATTCGGTTTACCAACCTGGCAACGGGGGAGTATTACGCTCGTATTTGGAAAGGCCGACG CTTAACCGGGCTTGATACTGACAGTAGCGGACGGATTTTAGTTAAAGCGAAAAATTTCAGTAATGTGTATACCGAGCTAT TTCGTATTGATTATGCCCGTAGTGGCGCTAACAATACGCCATCTTATCTCTATGGACGTAGTCAGCCCAATGCCTATATC GCGTTTAAAGGGCCAGGAATTACTGGCCCGATTGAGGGTACTGACTCGTACTCAAACTGGCCCGGTTGGTATTCTACCTG GCCTGCATCACTTGGTTTGTACAAATACGTCACATTCCGCCGGACCACTATTTGTGCGGTAAGCAACTTTACCCCGACGG TCGTGTTACCCAGGATTTCGGTGGCAGAACTGAATAATGGGAATACCAGCTCTGCTGATTTTAATGTGGATTTTCAGTGC CAGACCGGAATTAACTCTGGCGTGACGGCTGGCACAGTGGCGATGGGATTTTTAGTGCCGGCGGCCAATGCAGCCAAAGC TCAGGCGCTGGGGTTAATGAACGGCAACGGGGGAGTAAGCCATTTGGTCTCCGATAACTATGGCGCTGCTGGCACCGCGG GCGGGGTGGGTATTCGCATCTACCGTAACAATAGCCCGATGTATCTACTGTCAAAAAACGTAACTCAGACAGGTAACAAT GGGGGGTGGTATGGTATCTTACAGGGCGCACAAGAAACCACAGGCAGCGTAGATGGGGGGAACAGTTACACCGAAACTTT CCGTGCTGAGTTAAGCAAAATAAGCGGGCAAACAGTGACCGCCGGAGCAGTGAATGCACATGCGCAAGTGGTTATCCGTG TCCAATAA Protein sequence : MLRPTKPLISSGISQSTTAVYCRRPYFLAGMTLLIGLFSTSAWSNCTRITAQNQISSSDGTAASWLGSRDDNNGSLNLPS IVDLSTNANFQPDGTLLASATSDFTTFAVNTGYALDQVLFRCDAADVDQLYEMYATNGDSTYGGRYEDGTIAGNVSYGYA TTVMNVVIRFTNLATGEYYARIWKGRRLTGLDTDSSGRILVKAKNFSNVYTELFRIDYARSGANNTPSYLYGRSQPNAYI AFKGPGITGPIEGTDSYSNWPGWYSTWPASLGLYKYVTFRRTTICAVSNFTPTVVLPRISVAELNNGNTSSADFNVDFQC QTGINSGVTAGTVAMGFLVPAANAAKAQALGLMNGNGGVSHLVSDNYGAAGTAGGVGIRIYRNNSPMYLLSKNVTQTGNN GGWYGILQGAQETTGSVDGGNSYTETFRAELSKISGQTVTAGAVNAHAQVVIRVQ |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
cupD4 | AAP84168.1 | fimbrial subunit | Not tested | PAPI-1 | Protein | 8e-74 | 44 |