Name : RTTH1527_02805 (RTTH1527_02805) Accession : YP_005427648.1 Strain : Rickettsia typhi TH1527 Genome accession: NC_017066 Putative virulence/resistance : Unknown Product : ATP-dependent DNA helicase RecG Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 750909 - 753020 bp Length : 2112 bp Strand : - Note : COG1200 RecG-like helicase DNA sequence : ATGATATTAGCTACTTTAGAACAATTCTTATTTGCTCCTGTAAAAGCATTTATCAATATACGTGAAGATACAGTATCTGC TTTTAAAAGGCTTGGTATTAACAATATTCGTGATTTATTATTTTATCTACCTGTTTCATATCAAAATAAAATATTATCAC CTAATTTAACTGAAGTTAGAGGTGGTGAAATAATACAAACAGAAATTATAGTTAATAGTATTAATTTACAAAAAAAAGGT AATCAGCCTTTAAAGATTACAGCTAGTAATAATACAGGTTCTATATTATTAGTGTTCTTTCATAAGCCACCACAGTTTAT TTTAAATAAGCTGAAAGTTGGAACGAAGCATATTATTAGTGGAAAAGTACAATTCTTTAATTATCAATTACAAATTTTGC ATCCTGAATTTATTACGAATCCTAAACTTTCAAAAGCTATAGAACCACTTTATTCGATTACATATTCACTTAGTAACAAG CAGTTATATTCATATATAATAAAAGCAATAGAAATATTTGAAGAAAAGTGTAAGGGTATAGAAGATAAAGAAGTACATGA ATATTTGGATGTTATATTGCAGAATTTGAAGATTTTGCATGTTTTTTTCTCACCACATAACTTGATCTCATGGTCTAGCA CAATGGATATCGTTGTTAATCCGCGTTATGCCACTGTGGCTGCCAAAAAACAACTAGCCATTAAAGAATTAATCGCTAAT CAAATATCTCTTTTAAATGTACGTATGCAAATAAATAGAAAACAAGGTAATATTTACCCTAAAGCTACATCTATTCAAGA CAATATATTAAGAGAGTTAGGATTTGAGTTAACCTATTATCAAAAGCAAGTGATAGAAGAAATCGAGTCTGAGCAAAGCG ATAAAGTAGAGATGATGAGATTGTTACAAGGCGATGTTGGCTCTGGTAAAACTTTGGTAGCTTTACTCACGATGGTAAAT GTTGTCACCACTGGACTTCAAGCAACACTTATGGCTCCAACCGATTTACTTGCAAATCAGCATTATGATTTTTTTGTTAA AGCTTTAAAAAATACTAATATCAAGGTTGGATTACTTACAGGTAAGATACTTGGCAAAGCTCGTAAAAATATTATTATTC AACTTGTAAACGGTAAGATTGATATATTAATTGGTACTCATGCGTTATTTCAAGAAAAAGTCAGTTTTAAAAAACTAGGT TATATAGTTATCGATGAGCAGCATAGATTTGGAGTGCAGCAACGTTTGAATCTAATAAATAAAGGAGTTAATCCTGATGT TTTAATTATGACTGCAACACCAATTCCAAGAAGTTTAGCACTCACTATGTTTGGTGATATGACTATTTCCAAGCTAATGG GAAAACCAAAAGATCGTTTATCTATTGTTACAAAGACTATGTCGATTAATAAGATAGGATATATTATAGAAGCAATAAAT AAGCGGCTTATTGCAGGTGAAAGGGTATATTGGATATGCCCGTTGATAACGCAAAGAGAGAAAGAAGCGCTGCAAGAAGA TCATTTATTAATGGATGTGATAAATCGTTTTAACTCTATCGAAAATGTATATCAAGGTTATACTGGTATTATTCATGGTA AAATGGCAAATGATCAGAAAGAGCGAATAATGAAGCAGTTTAAGGAAGGTAAAATTAAGATATTAGTTGCAACAAACGTT ATTGAAGTTGGAATAGACGTATCTGAGGCTACTTTAATTGTTATTGAAAATGCTGAGCAATTTGGTTTAGCGCAACTTCA TCAGCTGAGAGGTAGAGTAGGGCGATGTAGTTTGCAGTCATATTGTATATTATTATACAATCCAAAAAGGCTTGGAAAAG TGGCACAAAACAGGTTTAAGATAATGAAACACACTAATGATGGATTTTATATTGCTGAGCAGGATTTAAAACTACGTGGT AGTGGTGAGATTTTAGGTATAAAACAAAGTGGCGAAATCGACTTTTTCTTTGCAGATTTAAAAGACGATTATGAACTACT CATAAAAGCGCATAAAGTTGCAGAAAGAGCAATATGCACAAAAGATAATGTGAATTTTATTAACTTTCAGATTAAACTCT TCGCAAAATCGCAAGTAAGTTATTTGATTTAA Protein sequence : MILATLEQFLFAPVKAFINIREDTVSAFKRLGINNIRDLLFYLPVSYQNKILSPNLTEVRGGEIIQTEIIVNSINLQKKG NQPLKITASNNTGSILLVFFHKPPQFILNKLKVGTKHIISGKVQFFNYQLQILHPEFITNPKLSKAIEPLYSITYSLSNK QLYSYIIKAIEIFEEKCKGIEDKEVHEYLDVILQNLKILHVFFSPHNLISWSSTMDIVVNPRYATVAAKKQLAIKELIAN QISLLNVRMQINRKQGNIYPKATSIQDNILRELGFELTYYQKQVIEEIESEQSDKVEMMRLLQGDVGSGKTLVALLTMVN VVTTGLQATLMAPTDLLANQHYDFFVKALKNTNIKVGLLTGKILGKARKNIIIQLVNGKIDILIGTHALFQEKVSFKKLG YIVIDEQHRFGVQQRLNLINKGVNPDVLIMTATPIPRSLALTMFGDMTISKLMGKPKDRLSIVTKTMSINKIGYIIEAIN KRLIAGERVYWICPLITQREKEALQEDHLLMDVINRFNSIENVYQGYTGIIHGKMANDQKERIMKQFKEGKIKILVATNV IEVGIDVSEATLIVIENAEQFGLAQLHQLRGRVGRCSLQSYCILLYNPKRLGKVAQNRFKIMKHTNDGFYIAEQDLKLRG SGEILGIKQSGEIDFFFADLKDDYELLIKAHKVAERAICTKDNVNFINFQIKLFAKSQVSYLI |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
recG | CAJ77039.1 | ATP-dependent DNA helicase | Not tested | AbaR1 | Protein | 2e-108 | 42 |