Gene Information

Name : MC3_03135 (MC3_03135)
Accession : YP_005426307.1
Strain : Rickettsia slovaca D-CWPP
Genome accession: NC_017065
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : cytochrome c oxidase polypeptide I
Function : -
COG functional category : -
COG ID : -
EC number : -
Position : 551010 - 552608 bp
Length : 1599 bp
Strand : -
Note : COG0843 Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidases, subunit 1

DNA sequence :
ATGGATATAACTACTACCGAAATTTATCACGATGGCCACCACACCCCACACGGTTGGAGGCGATGGCTTTTTTCTACCAA
TCACAAAGATATCGGCATTATGTATATCATATTTGCCGTTTTTGCCGGAATTGTCGGAGGTTTGTTCTCACTGCTTTTTA
GGTTAGAGCTTGCAATGCCCGGCGGCACTTTCTTAAATCATGATTTCCAGCTATATAACGTGCTTATCACAGCACATGCG
GTTATTATGGTATTCTTTATGATTATGCCGGCTTTGTTCGGTGGCTTTGGTAACTATTTCGTACCTCTGTTAATAGGGGC
TCCCGATATGGCATTTCCACGCCTTAACAATATCAGTTTTTGGCTACTAGTGCCTGCTTTTCTTTTACTTATGGGATCAG
CTTTTGTTGACGGTGGGCCAGGAACGGGCTGGACGCTCTACCCTCCTTTAAGTAATTTAAGCGGTCACCCCGGTGCAGCC
GTTGATATGGCTATTTTCAGTTTACATTTAACCGGTCTATCGTCAATCCTTGGATCAATTAACTTAATCGTTACTATCTT
TAATATGAGAGCTCCGGGAATGGGACTTTTCAAGATGCCGTTATTCGTTTGGTCTATTTTAGTTACCGCATTTCTAATAA
TTCTTGCGATGCCGGTACTTGGTGGAGCTATTACTATGCTACTTACAGATCGTAATTTTGGAACTACTTTCTTTAAGCCT
GACGGCGGCGGTGATCCTGTATTATTTCAGCATCTATTTTGGTTTTTCGGTCATCCTGAAGTATATATCGTAATACTTCC
AGGCTTTGGTATAGTAAGTCAAGTTATTTCAACTTTTTCACGCAAACCTATATTCGGCTATCAAGGTATGATCGGGGCTA
TGGTGATCATAGGCTTTGTTGGATTTATCGTATGGGCTCACCATATGTTTACTGTTGGGCTTTCTTATAATGCACTTATA
TATTTCACTGCCGGAACGATGATTATAGCAGTTCCGACGGGTATTAAAATATTTAGCTGGATAGCGACTATGTGGGGTGG
TTCGATTACATTCCCAACTCCTATGCTATTTTCGATAGGATTTATTATATTATTCACGATCGGCGGCGTAACCGGCATAA
TCCTATCAAATTCGGCACTTGATAGAGTTCTGCACGATACATATTATGTTGTTGCACATTTCCATTATACAATGTCGCTC
GGTGCTTTATTTACGGCATTTGCAGGCTTTTATTATTGGTTTGGCAAAATATCTGGTAAACAATATCCGGACATTTTAGG
CAAAATTCATTTTTGGATTACCTTTATAGGCGTTAATTTAACTTTCTTCCCGCAGCATTTCTTAGGTCTTGCGGGCATGC
CAAGAAGAATACCGGACTACCCTGAAGCTTTCGCCGGCTGGAATATGGTTTCGTCGATAGGAGCAGGTATTTCTATGTTT
GCTGCCCTTTATTTTGTATTTATCGTTTTCTATACGCTAAAATACGGCAAAGATTGTCCAAACAATCCTTGGGGAGAAGG
AGCAGACACATTAGAGTGGACACTTACCTCACCACCGCCGTTCCATACTTTTGAAACACCACCGCATATTGAGGGGTAA

Protein sequence :
MDITTTEIYHDGHHTPHGWRRWLFSTNHKDIGIMYIIFAVFAGIVGGLFSLLFRLELAMPGGTFLNHDFQLYNVLITAHA
VIMVFFMIMPALFGGFGNYFVPLLIGAPDMAFPRLNNISFWLLVPAFLLLMGSAFVDGGPGTGWTLYPPLSNLSGHPGAA
VDMAIFSLHLTGLSSILGSINLIVTIFNMRAPGMGLFKMPLFVWSILVTAFLIILAMPVLGGAITMLLTDRNFGTTFFKP
DGGGDPVLFQHLFWFFGHPEVYIVILPGFGIVSQVISTFSRKPIFGYQGMIGAMVIIGFVGFIVWAHHMFTVGLSYNALI
YFTAGTMIIAVPTGIKIFSWIATMWGGSITFPTPMLFSIGFIILFTIGGVTGIILSNSALDRVLHDTYYVVAHFHYTMSL
GALFTAFAGFYYWFGKISGKQYPDILGKIHFWITFIGVNLTFFPQHFLGLAGMPRRIPDYPEAFAGWNMVSSIGAGISMF
AALYFVFIVFYTLKYGKDCPNNPWGEGADTLEWTLTSPPPFHTFETPPHIEG

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
cur_1478 YP_001800872.1 cytochrome c oxidase subunit I Not tested Not named Protein 2e-95 47