Name : HPELS_00710 (HPELS_00710) Accession : YP_005424297.1 Strain : Helicobacter pylori ELS37 Genome accession: NC_017063 Putative virulence/resistance : Unknown Product : L-lactate permease Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 146529 - 148178 bp Length : 1650 bp Strand : + Note : COG1620 L-lactate permease DNA sequence : ATGGAATTTTATCAAGTCTATGACCCATTAGGCCATATTTGGCTGAGCGCTTTAGTCGCACTTTCGCCTATTGCACTCTT TTTTATTTCTCTTATTGTCTTTAAACTTAAAGGGTATAGCGCTGGGTTTTTAAGCTTAGCGCTTTCAATCCTTATTGCGT TATTTGTGTATAAAATGCCTGTTCAAATGGTGAGCGCGAGTTTTTTCTATGGCTTTCTTTATGGCTTGTGGCCGATCGCA TGGATTGTGATCGCTGCGATTTTTCTTTACAACCTTTCAGTGAAATCCGGGTATTTTGAGATTTTAAAAGAAAGCATTTT AAGCTTGACGCCGGATCATCGCATTTTAGTGATTTTGATCGGGTTTTGTTTTGGCTCGTTTTTAGAAGGCGCGATTGGTT TTGGAGGCCCGGTAGCGATCACAGCGGCGATTTTAGTCGGCCTTGGGCTAAACCCCTTATACGCTGCCGGATTATGCCTA ATCGCTAACACCGCTCCTGTAGCTTTTGGCGCGGTGGGCATTCCTATTACGGCAATGGCTAGCGTGGTGGGTATCCCTGA ATTAGAGATTTCTCAAATGGTGGGCAGGGTGTTACCCATTTTTTCCATTGGTATTCCTTTTTTCATCGTGTTTTTAATGG ATGGTTTTAGAGGGATTAGAGAGACTTTTCCTGCAGTGGCCGTTACCGGATTTAGTTTCGCTATCGCGCAATTTTTAAGC TCTAATTATCTAGGGCCACAGCTCCCGGATATTATTTCAGCTTTAGTGTCATTGATTTCTACCACTTTGTTTTTAAAATT CTGGCAACCCAAACGCATTTTCACCAGCAATGGCAAAGAGCCTACGATTGGCACAGAAAAACACCATATTTGTAAGGTGA TCGTGGCGTGGATGCCTTTTGTGTTGCTCACGATTACGATTATCATATGGACGCAACCCTGGTTTAAAGCGCTCTTTAAA GAAGGCGGGGCTTTGGCGTTTTCTAGCTTTGCGTTTGAATTTGATTCTATCAGTCAAAAGATTTTTAAAACCGCTCCCAT TGTTACTGAAGCAAAAAGCTTTCCTGTCGTGTTCAAATTCCCCTTGATTCTAACGACAGGCACTTCCATTTTTTTAGCCG CCATTTTGAGCGTGTTTTTGCTGCGCGTGAAAATCAGCGATGCGATAGGGGTGTTTGGGGCCACTTTAAAAGAAATGCGT TTGCCGATTTTAACCATTGGCGTGGTTTTAGCGTTTGCGTATGTGGCTAATTATAGCGGCATGAGCGCTACGCTCGCTTT AGCGTTAGCAGATACCGGGCATGTTTTCACTTTCTTTTCGCCTATTGTAGGCTGGCTTGGGGTGTTTTTAACCGGAAGCG ATACGAGCTCTAATCTTTTATTTGGCTCTTTGCAAATGCTCATCGCCACACAGCTTGGCTTGCCTGAAGTGCTTTTCTTA GCGGCCAACACTTCCGGGGGCGTTGTGGGCAAAATGATAAGCCCTCAAAGTATTGCTATCGCTTGCGCGGCGGTGGGGTT AGTGGGGAAAGAGAGCGAATTGTTCAGATTTACGGTAAAATACTCCGTCGCTTTGGCGATCATTATGGGGATTATTTTCA CTCTTATTGCTTATGTCTTCCCCTTTATTATCCCCATCATTCCTAAATAA Protein sequence : MEFYQVYDPLGHIWLSALVALSPIALFFISLIVFKLKGYSAGFLSLALSILIALFVYKMPVQMVSASFFYGFLYGLWPIA WIVIAAIFLYNLSVKSGYFEILKESILSLTPDHRILVILIGFCFGSFLEGAIGFGGPVAITAAILVGLGLNPLYAAGLCL IANTAPVAFGAVGIPITAMASVVGIPELEISQMVGRVLPIFSIGIPFFIVFLMDGFRGIRETFPAVAVTGFSFAIAQFLS SNYLGPQLPDIISALVSLISTTLFLKFWQPKRIFTSNGKEPTIGTEKHHICKVIVAWMPFVLLTITIIIWTQPWFKALFK EGGALAFSSFAFEFDSISQKIFKTAPIVTEAKSFPVVFKFPLILTTGTSIFLAAILSVFLLRVKISDAIGVFGATLKEMR LPILTIGVVLAFAYVANYSGMSATLALALADTGHVFTFFSPIVGWLGVFLTGSDTSSNLLFGSLQMLIATQLGLPEVLFL AANTSGGVVGKMISPQSIAIACAAVGLVGKESELFRFTVKYSVALAIIMGIIFTLIAYVFPFIIPIIPK |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
glcA | CAE85240.1 | GlcA protein, putative glycolate permease | Not tested | PAI V 536 | Protein | 3e-129 | 56 |