Gene Information

Name : MC5_05075 (MC5_05075)
Accession : YP_005415144.1
Strain : Rickettsia australis Cutlack
Genome accession: NC_017058
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : cytochrome c oxidase polypeptide I
Function : -
COG functional category : -
COG ID : -
EC number : -
Position : 895922 - 897520 bp
Length : 1599 bp
Strand : +
Note : COG0843 Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidases, subunit 1

DNA sequence :
ATGGATATAACTACTACCGAAATTTATCACGATGGCCACCACATCCCACACGGTTGGAGGCGATGGCTTTTTTCTACCAA
TCACAAAGATATCGGCATTATGTATATCATATTTGCCGTTTTTGCCGGGATTGTCGGAGGGTTATTTTCTCTTCTATTTA
GGTTAGAGCTTGCAATGCCCGGCGGCACTTTCTTAAATCATGATTTCCAGCTATATAACGTGCTTATCACAGCACATGCG
GTTATTATGGTATTCTTTATGATTATGCCGGCTTTGTTTGGTGGTTTTGGTAACTATTTTGTACCTCTATTAATAGGGGC
TCCCGATATGGCATTTCCACGCCTTAACAATATCAGTTTTTGGCTACTAGTTCCTGCTTTTCTCTTACTGATGGGTTCGG
CTTTTGTTGACGGCGGACCGGGAACGGGCTGGACGCTCTACCCTCCTTTAAGTAATTTGAGCGGTCACCCAGGGGCAGCA
GTCGATATGGCTATTTTCAGCTTACATTTAACAGGTCTATCATCAATCCTCGGATCAATTAACTTAATTGTTACTATCTT
TAATATGAGAGCTCCAGGCATGGGCCTTTTCAAGATGCCTTTATTTGTTTGGTCTATCTTAGTAACTGCATTTCTGATAA
TCTTAGCTATGCCGGTGCTTGGCGGGGCTATCACTATGCTCCTTACCGATCGTAACTTTGGCACCACTTTCTTTAAGCCT
GAAGGCGGCGGTGATCCTGTATTATTTCAGCATCTATTTTGGTTTTTCGGTCATCCTGAAGTATATATCGTAATACTTCC
AGGCTTTGGTATAGTAAGTCAGGTTATTTCAACTTTTTCACGCAAACCTATATTCGGTTATCAAGGTATGGTCGGAGCTA
TGGTAATAATCGGTTTCGTCGGCTTTATCGTATGGGCTCACCATATGTTTACTGTTGGGCTTTCTTATAATGCACTTATA
TATTTCACTGCCGGAACGATGATTATAGCAGTTCCGACAGGCATTAAAATATTTAGCTGGATAGCAACTATGTGGGGCGG
TTCTATTACATTCCCAACTCCTATGTTATTTTCGATAGGATTTATTATATTATTCACGATTGGCGGCGTAACCGGTATAA
TACTATCAAATTCGGCACTTGATAGAGTTCTGCACGATACATATTATGTTGTCGCACATTTCCATTATACGATGTCGCTC
GGTGCTTTATTTACGGCATTTGCAGGCTTTTATTATTGGTTTGGAAAAATATTTGGTAAACAATATCCAGAAATTTTAGG
CAAAATCCATTTTTGGATTACATTTATTGGTGTTAATTTAACTTTCTTCCCGCAGCATTTCTTAGGTCTTGCGGGCATGC
CAAGAAGAATACCGGACTACCCTGAAGCTTTCGCTGGCTGGAATATGGTTTCATCCATAGGAGCAGGTATCTCTATGGCG
GCAGCTCTTTATTTTGTATTTATCGTTTTCTATACGCTAAAATACGGCAAAAATTGTCCGGCAAATCCTTGGGGTGACGG
TGCTAATACGCTTGAGTGGACGCTTACCTCACCACCGCCGTTCCATACTTTTGAAACACCACCGCATATTGAGGGGTAA

Protein sequence :
MDITTTEIYHDGHHIPHGWRRWLFSTNHKDIGIMYIIFAVFAGIVGGLFSLLFRLELAMPGGTFLNHDFQLYNVLITAHA
VIMVFFMIMPALFGGFGNYFVPLLIGAPDMAFPRLNNISFWLLVPAFLLLMGSAFVDGGPGTGWTLYPPLSNLSGHPGAA
VDMAIFSLHLTGLSSILGSINLIVTIFNMRAPGMGLFKMPLFVWSILVTAFLIILAMPVLGGAITMLLTDRNFGTTFFKP
EGGGDPVLFQHLFWFFGHPEVYIVILPGFGIVSQVISTFSRKPIFGYQGMVGAMVIIGFVGFIVWAHHMFTVGLSYNALI
YFTAGTMIIAVPTGIKIFSWIATMWGGSITFPTPMLFSIGFIILFTIGGVTGIILSNSALDRVLHDTYYVVAHFHYTMSL
GALFTAFAGFYYWFGKIFGKQYPEILGKIHFWITFIGVNLTFFPQHFLGLAGMPRRIPDYPEAFAGWNMVSSIGAGISMA
AALYFVFIVFYTLKYGKNCPANPWGDGANTLEWTLTSPPPFHTFETPPHIEG

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
cur_1478 YP_001800872.1 cytochrome c oxidase subunit I Not tested Not named Protein 3e-92 47