Name : Q7S_18105 (Q7S_18105) Accession : YP_005403401.1 Strain : Rahnella aquatilis HX2 Genome accession: NC_017047 Putative virulence/resistance : Unknown Product : capsular exopolysaccharide family protein Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 3956330 - 3958501 bp Length : 2172 bp Strand : - Note : COG3206 Uncharacterized protein involved in exopolysaccharide biosynthesis DNA sequence : ATGTCATCAGCTATTTCAAAAAAAACCGCAACACCAGACTCTGACGAAATTGATTTGGGACGTCTTTACGGCGAAATTCT CGATCACCGCAAACTGATTATTATTCTTACAGCCGTTTTCACCCTGCTGGCTATAACGTATGCCTTATTCGCCACGCCTG TTTACCAGGCAACAGCGATGATACAGGTTGAGCAGAAACAGGGGAATGCGATCCTCAATAGTTTAAGTCAGATGTTACCC GACTCTCAGCCTGTCTCTGAGCCTGAGATCGCATTGTTGCAGTCAAGGATGATCCTTGGCAAAACTGTTGATGATCTTAA TTTACAAGCTGTCATTACTCAGAATTATTTTCCGTTATTCGGGCGTGGTTGGGCAAGGATGACGGGTGATGTTCCGGGTA AACTGAGCATCAGCCGTTTATATATTCCTAAAACCAGCAATGATGTTCCGAGTATTACTCTCACTGTCATTGATAAAAAC CGATTCCATGTTGAAGGTGATAATTTCAAGCTTGACGGAGAAGTGGGGACGCTCATCACCCAGGATGGTATTGCTCTGAA CGTCCAAAGTATGGACGCTGAGCCAGGAACACAATTCACAGTCAATTATGTGACACGATTAGATGCTATCAATAGTATGC AGACTGCACTAAGTGTATCAGATCAGGGAAAAGATACTGGGATCCTTAACCTGACATTTAACAGCGATAACAGTGTAATG GCTTCTGCAATTCTCAATGATATTAGCCAAAACTATCTTGACCAAAATATTGCCCGTCAGGCTGCCCAAGATGCGAAAAG TTTGGAGTTTTTAAATCAGCAATTGCCGCAGGTTCGCAGTGAACTGAATAATGCTGAGGATAAACTTAATCTGTATCGGC GGCAGAAGGATTCTGTTGATTTATCCCTTGAGGCGAAATCAGTTCTTGAGCAGATCGTTAATGTAGATAGCCAGCTTAAT GAACTGACGTTTCGTGAAGCTGAGATTTCGCAACTTTATACTAAAGATCATCCGACTTATAAAGCCCTGCTTGAAAAACG GCAGACCTTGTTGCAGGAACGAGATAGCCTTAATAAACGTGTTACAGCCATGCCGGCCACTCAACAAGAAGTAGAACGTT TGAGCCGTGATGTTGATTCTGGTCGGGCTATCTATATGCAGTTGCTTAATCGTCAGCAAGAATTAAGCATCGCCAAATCA AGTGCAATAGGTAATGTGCGTATTGTCGATAATGCAATCACACAACCTAAGCCAGTAAAACCAAGAAAAACATTGATTGT TTTGATCGGGATTATTGTTGGGTTGTTTATATCGTCTGCGCTTGTTCTACTGAAGATTTTTCTACGTCGTGGAATTGAGT CTCCAGAACAACTGGAAGAAATTGGGGTTAGTGTTTATGCAAGCGTGCCACTTTCAGAGTGGCTCACAAAGAAAAATAAA TCAATGCGACCTAAAGAGGGGGGAATAAAAAAAATAAAAGATGAAAAGAGATTCTTGGCTGTGGAAAACCCTGCTGATTT AGCCATTGAAGCTATTCGCAGTCTGCGAACTAGCCTTCATTTTGCCATGATGGAAGCCAAGAATAATATTCTGATGATCT CAGGATCAACGCAGAGTGCAGGTAAAACATTTATCGCCAGTAATTTAGCAGCAGTTATTTCGCAAGCAGGAAAAAAGGTA TTATTTATAGATGCAGATATGCGGAAAGGATATGCACATAAACTGTTTAAATTCAATGAAGACAAGGGGTTGTCAGATAT CCTTTCTGGAGTAATAAGTGTTAATGATATAGATAAAAGAGTCCCATCTATAGGTATTGACTTTATTCCTAGAGGGAAAG TACCCCCAAACCCATCTGAATTGTTGATGCATAAGCGGTTTAATATTTTGCTAGACTGGGCTTCAGAAAATTATGACTTA GTCATTGTCGATACCCCTCCTATTTTAGCTGTTACGGATGCAGCCATTATTGGTCGTAGCGTTGGTACTTCATTACTTGT TGCTCGCTATGGAACAAACACAGTTAAAGAGGTAGAGATTAGTATCAGGCGTTTTGAGCATGTTGGTGTACAAATAAAAG GATGTATACTTAATAGTGTAATTAAAAAGGCTAGCAGTTATTACGGGTATGGTTATAGCAACTATTCTTATGATTACAGC GAAGATAAATAA Protein sequence : MSSAISKKTATPDSDEIDLGRLYGEILDHRKLIIILTAVFTLLAITYALFATPVYQATAMIQVEQKQGNAILNSLSQMLP DSQPVSEPEIALLQSRMILGKTVDDLNLQAVITQNYFPLFGRGWARMTGDVPGKLSISRLYIPKTSNDVPSITLTVIDKN RFHVEGDNFKLDGEVGTLITQDGIALNVQSMDAEPGTQFTVNYVTRLDAINSMQTALSVSDQGKDTGILNLTFNSDNSVM ASAILNDISQNYLDQNIARQAAQDAKSLEFLNQQLPQVRSELNNAEDKLNLYRRQKDSVDLSLEAKSVLEQIVNVDSQLN ELTFREAEISQLYTKDHPTYKALLEKRQTLLQERDSLNKRVTAMPATQQEVERLSRDVDSGRAIYMQLLNRQQELSIAKS SAIGNVRIVDNAITQPKPVKPRKTLIVLIGIIVGLFISSALVLLKIFLRRGIESPEQLEEIGVSVYASVPLSEWLTKKNK SMRPKEGGIKKIKDEKRFLAVENPADLAIEAIRSLRTSLHFAMMEAKNNILMISGSTQSAGKTFIASNLAAVISQAGKKV LFIDADMRKGYAHKLFKFNEDKGLSDILSGVISVNDIDKRVPSIGIDFIPRGKVPPNPSELLMHKRFNILLDWASENYDL VIVDTPPILAVTDAAIIGRSVGTSLLVARYGTNTVKEVEISIRRFEHVGVQIKGCILNSVIKKASSYYGYGYSNYSYDYS EDK |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
orf41 | AAO18066.1 | Orf41 | Not tested | TTSS locus | Protein | 3e-155 | 46 |