Gene Information

Name : Q7S_18105 (Q7S_18105)
Accession : YP_005403401.1
Strain : Rahnella aquatilis HX2
Genome accession: NC_017047
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : capsular exopolysaccharide family protein
Function : -
COG functional category : -
COG ID : -
EC number : -
Position : 3956330 - 3958501 bp
Length : 2172 bp
Strand : -
Note : COG3206 Uncharacterized protein involved in exopolysaccharide biosynthesis

DNA sequence :
ATGTCATCAGCTATTTCAAAAAAAACCGCAACACCAGACTCTGACGAAATTGATTTGGGACGTCTTTACGGCGAAATTCT
CGATCACCGCAAACTGATTATTATTCTTACAGCCGTTTTCACCCTGCTGGCTATAACGTATGCCTTATTCGCCACGCCTG
TTTACCAGGCAACAGCGATGATACAGGTTGAGCAGAAACAGGGGAATGCGATCCTCAATAGTTTAAGTCAGATGTTACCC
GACTCTCAGCCTGTCTCTGAGCCTGAGATCGCATTGTTGCAGTCAAGGATGATCCTTGGCAAAACTGTTGATGATCTTAA
TTTACAAGCTGTCATTACTCAGAATTATTTTCCGTTATTCGGGCGTGGTTGGGCAAGGATGACGGGTGATGTTCCGGGTA
AACTGAGCATCAGCCGTTTATATATTCCTAAAACCAGCAATGATGTTCCGAGTATTACTCTCACTGTCATTGATAAAAAC
CGATTCCATGTTGAAGGTGATAATTTCAAGCTTGACGGAGAAGTGGGGACGCTCATCACCCAGGATGGTATTGCTCTGAA
CGTCCAAAGTATGGACGCTGAGCCAGGAACACAATTCACAGTCAATTATGTGACACGATTAGATGCTATCAATAGTATGC
AGACTGCACTAAGTGTATCAGATCAGGGAAAAGATACTGGGATCCTTAACCTGACATTTAACAGCGATAACAGTGTAATG
GCTTCTGCAATTCTCAATGATATTAGCCAAAACTATCTTGACCAAAATATTGCCCGTCAGGCTGCCCAAGATGCGAAAAG
TTTGGAGTTTTTAAATCAGCAATTGCCGCAGGTTCGCAGTGAACTGAATAATGCTGAGGATAAACTTAATCTGTATCGGC
GGCAGAAGGATTCTGTTGATTTATCCCTTGAGGCGAAATCAGTTCTTGAGCAGATCGTTAATGTAGATAGCCAGCTTAAT
GAACTGACGTTTCGTGAAGCTGAGATTTCGCAACTTTATACTAAAGATCATCCGACTTATAAAGCCCTGCTTGAAAAACG
GCAGACCTTGTTGCAGGAACGAGATAGCCTTAATAAACGTGTTACAGCCATGCCGGCCACTCAACAAGAAGTAGAACGTT
TGAGCCGTGATGTTGATTCTGGTCGGGCTATCTATATGCAGTTGCTTAATCGTCAGCAAGAATTAAGCATCGCCAAATCA
AGTGCAATAGGTAATGTGCGTATTGTCGATAATGCAATCACACAACCTAAGCCAGTAAAACCAAGAAAAACATTGATTGT
TTTGATCGGGATTATTGTTGGGTTGTTTATATCGTCTGCGCTTGTTCTACTGAAGATTTTTCTACGTCGTGGAATTGAGT
CTCCAGAACAACTGGAAGAAATTGGGGTTAGTGTTTATGCAAGCGTGCCACTTTCAGAGTGGCTCACAAAGAAAAATAAA
TCAATGCGACCTAAAGAGGGGGGAATAAAAAAAATAAAAGATGAAAAGAGATTCTTGGCTGTGGAAAACCCTGCTGATTT
AGCCATTGAAGCTATTCGCAGTCTGCGAACTAGCCTTCATTTTGCCATGATGGAAGCCAAGAATAATATTCTGATGATCT
CAGGATCAACGCAGAGTGCAGGTAAAACATTTATCGCCAGTAATTTAGCAGCAGTTATTTCGCAAGCAGGAAAAAAGGTA
TTATTTATAGATGCAGATATGCGGAAAGGATATGCACATAAACTGTTTAAATTCAATGAAGACAAGGGGTTGTCAGATAT
CCTTTCTGGAGTAATAAGTGTTAATGATATAGATAAAAGAGTCCCATCTATAGGTATTGACTTTATTCCTAGAGGGAAAG
TACCCCCAAACCCATCTGAATTGTTGATGCATAAGCGGTTTAATATTTTGCTAGACTGGGCTTCAGAAAATTATGACTTA
GTCATTGTCGATACCCCTCCTATTTTAGCTGTTACGGATGCAGCCATTATTGGTCGTAGCGTTGGTACTTCATTACTTGT
TGCTCGCTATGGAACAAACACAGTTAAAGAGGTAGAGATTAGTATCAGGCGTTTTGAGCATGTTGGTGTACAAATAAAAG
GATGTATACTTAATAGTGTAATTAAAAAGGCTAGCAGTTATTACGGGTATGGTTATAGCAACTATTCTTATGATTACAGC
GAAGATAAATAA

Protein sequence :
MSSAISKKTATPDSDEIDLGRLYGEILDHRKLIIILTAVFTLLAITYALFATPVYQATAMIQVEQKQGNAILNSLSQMLP
DSQPVSEPEIALLQSRMILGKTVDDLNLQAVITQNYFPLFGRGWARMTGDVPGKLSISRLYIPKTSNDVPSITLTVIDKN
RFHVEGDNFKLDGEVGTLITQDGIALNVQSMDAEPGTQFTVNYVTRLDAINSMQTALSVSDQGKDTGILNLTFNSDNSVM
ASAILNDISQNYLDQNIARQAAQDAKSLEFLNQQLPQVRSELNNAEDKLNLYRRQKDSVDLSLEAKSVLEQIVNVDSQLN
ELTFREAEISQLYTKDHPTYKALLEKRQTLLQERDSLNKRVTAMPATQQEVERLSRDVDSGRAIYMQLLNRQQELSIAKS
SAIGNVRIVDNAITQPKPVKPRKTLIVLIGIIVGLFISSALVLLKIFLRRGIESPEQLEEIGVSVYASVPLSEWLTKKNK
SMRPKEGGIKKIKDEKRFLAVENPADLAIEAIRSLRTSLHFAMMEAKNNILMISGSTQSAGKTFIASNLAAVISQAGKKV
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VIVDTPPILAVTDAAIIGRSVGTSLLVARYGTNTVKEVEISIRRFEHVGVQIKGCILNSVIKKASSYYGYGYSNYSYDYS
EDK

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
orf41 AAO18066.1 Orf41 Not tested TTSS locus Protein 3e-155 46