|
Name : MCI_00220 (MCI_00220) Accession : YP_005391081.1 Strain : Rickettsia montanensis OSU 85-930 Genome accession: NC_017043 Putative virulence/resistance : Unknown Product : succinate semialdehyde dehydrogenase Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 38593 - 40020 bp Length : 1428 bp Strand : + Note : COG1012 NAD-dependent aldehyde dehydrogenases DNA sequence : ATGAACTTACTTAAAAACATTACGGGAAAGAATTATATAAACGGTGAATTTATAGAGTTCGGGAAGCAAATATCCGTTAT TAATCCTGCGACCTTAAAAGAAATTGCTACAGTTCCGAATTTGGGATTATCTGAGATTAATTCAGCGATTAATAATACGG TGACTAGTTTTTCTTCATGGTCACAAAGCTCATTTGAAGCGAGAATAGCGATTCTTAGAAGATGGTATAATTTAGTAATC GAAAATATTGAGGAGTTAAGTCATATATTAACCCTAGAGCAAGGTAAAGTACTTGCTGAATCAAAAAAAGAAATTTTATA TGGAGTCTCTTTTATTGATTGGTATACATATGCTATACATAATATTCATTCGACTATCAAACCCGGTAATAGTAAAGCTC ATAAAATTGTTACGCAATATGAGCCTGTAGGACCGTCTGCTGCTATAACTCCTTGGAATTTTCCAAATGCAATGATTACT CGCAAGGTAGTACCTGCAATAGCTGCGGGTTGCAGCGTTATATTAAAACCGTCAAGTCTTACGCCTCTATCAGCTTTAGT ACTTGCTAAATTTGCAAGCGATGCCGGTTTGCCTGCCGGAGTATTTAATGTAATTACAGGTAGTTCAGATATTATAGGTA AGGCTTTTTGTGAAGATTTTAGGCTTCGGAAGTTATCATTTACCGGCTCTACAAATGTCGGTAAAATTCTATATCAAAAT GCCGCAAATACTCTAAAACGTTTATCTTTGGAACTTGGCGGCAATGCTCCTTTCATTATAACGGCAGATAATAATTTAGA GAAAGTAGTAAGTGATTTAATAACCGCTAAAACTAGAAATAGTGGACAGTCTTGTATTTCACCTAACAGAATATTTATAG AAGAATCTATATATGAAAAATTTATAGAAATTCTAAAGGCTAAATTTACTAAGCTTAAAGCCGGTGACGGATTTGATAAG GAATCGGATGTAGGCCCGTTAATTAATTCTGCTGCCATAGAAAAAATACAAAAGTTACTCGCTGATGCACAAAGTAAAGG AGCTAAATTAATTTGCGGCGGTAAAGCTGTTGATAATTTTATTGAGCCTACTATTATTATTGACTGTTTGGATAATATGG ATATCTTTAGAACAGAAATATTCGGTCCGGTAGTTGCTTGTTATAAATTTAAAGATTTGGATGAAGTAATAGAACGTGCA AATAATACTGAATACGGCTTGCAAGGATATGTATATTCAAATAATATATCCGTGGTACAAATGATAGCGTCTAAGCTTGA TTTTGGTATGGTATCGATTAACGACCCGTTACCTGCAAATGCAAAAGCACCTTTTGCAGGACGTAAAGCTTCAGGTTTTG GAGTTGAAGGCTCATTTGAAGGGATATTTGAATATCTAAATACGAAATATATAAATTTACAACATTAA Protein sequence : MNLLKNITGKNYINGEFIEFGKQISVINPATLKEIATVPNLGLSEINSAINNTVTSFSSWSQSSFEARIAILRRWYNLVI ENIEELSHILTLEQGKVLAESKKEILYGVSFIDWYTYAIHNIHSTIKPGNSKAHKIVTQYEPVGPSAAITPWNFPNAMIT RKVVPAIAAGCSVILKPSSLTPLSALVLAKFASDAGLPAGVFNVITGSSDIIGKAFCEDFRLRKLSFTGSTNVGKILYQN AANTLKRLSLELGGNAPFIITADNNLEKVVSDLITAKTRNSGQSCISPNRIFIEESIYEKFIEILKAKFTKLKAGDGFDK ESDVGPLINSAAIEKIQKLLADAQSKGAKLICGGKAVDNFIEPTIIIDCLDNMDIFRTEIFGPVVACYKFKDLDEVIERA NNTEYGLQGYVYSNNISVVQMIASKLDFGMVSINDPLPANAKAPFAGRKASGFGVEGSFEGIFEYLNTKYINLQH |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| orf17 | AAO17183.1 | Orf17 | Not tested | tcd island | Protein | 8e-93 | 47 |
