Gene Information

Name : MCC_03670 (MCC_03670)
Accession : YP_005390396.1
Strain : Rickettsia rhipicephali 3-7-female6-CWPP
Genome accession: NC_017042
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : cytochrome c oxidase polypeptide I
Function : -
COG functional category : -
COG ID : -
EC number : -
Position : 629833 - 631431 bp
Length : 1599 bp
Strand : -
Note : COG0843 Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidases, subunit 1

DNA sequence :
ATGGATATAACTACTACCGAAATTTATCACGATGACCACCACACCCCACACGGTTGGAGGCGATGGCTTTTTTCTACCAA
TCACAAAGATATCGGCATTATGTATATCATATTTGCCGTTTTTGCTGGAATTATCGGAGGTGTGTTCTCACTGCTTTTTA
GGTTAGAGCTTGCAATGCCCGGCGGCACTTTCTTAAATCATGATTTCCAGCTATATAACGTGCTTATCACAGCACATGCG
GTTATTATGGTATTCTTTATGATTATGCCGGCTTTGTTCGGTGGCTTTGGTAACTATTTCGTACCTCTGTTAATAGGGGC
TCCCGATATGGCATTTCCACGCCTTAACAATATCAGTTTTTGGCTACTAGTTCCTGCTTTTCTTTTACTTATGGGATCAG
CTTTTGTTGACGGTGGGCCGGGAACGGGCTGGACGCTCTACCCTCCTTTAAGTAATTTAAGTGGTCACCCCGGTGCAGCC
GTTGATATGGCTATTTTCAGTTTACATTTAACCGGTCTATCGTCAATCCTTGGATCAATTAACTTAATCGTTACTATCTT
TAATATGAGAGCTCCGGGAATGGGGCTTTTCAAGATGCCGTTATTCGTTTGGTCTATTTTAGTTACCGCATTTCTAATAA
TTCTTGCTATGCCAGTACTTGGTGGAGCTATTACTATGCTACTTACAGATCGTAATTTTGGAACTACTTTCTTTAAGCCT
GACGGCGGCGGTGATCCTGTATTATTTCAGCATCTATTTTGGTTTTTTGGTCATCCTGAAGTATATATCGTAATACTTCC
AGGCTTTGGTATAGTAAGTCAAGTTATTTCAACTTTTTCACGCAAACCTATATTCGGCTATCAAGGTATGGTCGGGGCTA
TGGTGATAATAGGCTTTGTTGGATTTATCGTATGGGCTCACCATATGTTTACTGTTGGGCTTTCTTATAATGCACTTATA
TATTTCACTGCCGGAACGATGATTATAGCAGTTCCGACGGGTATTAAAATATTTAGCTGGATAGCGACTATGTGGGGTGG
TTCGATTACATTCCCAACTCCTATGCTATTTTCGATAGGATTTATTATATTATTCACGATCGGCGGCGTAACCGGCATAA
TCCTATCAAATTCAGCACTTGATAGAGTTCTGCACGATACATATTATGTTGTTGCACATTTCCATTATACGATGTCGCTC
GGTGCTTTATTTACGGCATTTGCAGGCTTTTATTATTGGTTTGGCAAAATATCCGGTAAACAATATCCGGACATTTTAGG
CAAAATTCATTTTTGGATTACCTTTATAGGCGTTAATTTAACTTTCTTCCCGCAGCATTTCTTAGGTCTTGCGGGCATGC
CAAGAAGAATACCGGACTACCCTGAAGCTTTCGCCGGCTGGAATATGGTTTCGTCGATAGGAGCCGGTATTTCTATGTTT
GCTGCCCTTTATTTTGTATTTATCGTTTTCTATACGCTAAAATACGGCAAAGATTGTCCAAACAATCCTTGGGGAGAAGG
AGCAGACACATTAGAGTGGACACTTACCTCACCACCGCCGTTCCATACTTTTGAAACACCACCGCATATTGAGGGGTAA

Protein sequence :
MDITTTEIYHDDHHTPHGWRRWLFSTNHKDIGIMYIIFAVFAGIIGGVFSLLFRLELAMPGGTFLNHDFQLYNVLITAHA
VIMVFFMIMPALFGGFGNYFVPLLIGAPDMAFPRLNNISFWLLVPAFLLLMGSAFVDGGPGTGWTLYPPLSNLSGHPGAA
VDMAIFSLHLTGLSSILGSINLIVTIFNMRAPGMGLFKMPLFVWSILVTAFLIILAMPVLGGAITMLLTDRNFGTTFFKP
DGGGDPVLFQHLFWFFGHPEVYIVILPGFGIVSQVISTFSRKPIFGYQGMVGAMVIIGFVGFIVWAHHMFTVGLSYNALI
YFTAGTMIIAVPTGIKIFSWIATMWGGSITFPTPMLFSIGFIILFTIGGVTGIILSNSALDRVLHDTYYVVAHFHYTMSL
GALFTAFAGFYYWFGKISGKQYPDILGKIHFWITFIGVNLTFFPQHFLGLAGMPRRIPDYPEAFAGWNMVSSIGAGISMF
AALYFVFIVFYTLKYGKDCPNNPWGEGADTLEWTLTSPPPFHTFETPPHIEG

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
cur_1478 YP_001800872.1 cytochrome c oxidase subunit I Not tested Not named Protein 1e-92 46