Gene Information

Name : wbpM (KQS_03350)
Accession : YP_005356713.1
Strain : Flavobacterium indicum GPTSA100-9
Genome accession: NC_017025
Putative virulence/resistance : Virulence
Product : WbpM protein
Function : -
COG functional category : -
COG ID : -
EC number : -
Position : 759779 - 761722 bp
Length : 1944 bp
Strand : +
Note : -

DNA sequence :
GTGCCCGAAAATACTAGCAATAATCAATCCGTTAGTTCTTCTTTTTTGAAGAATAAGTTTCTCAATTTAGGTTATTTACC
TCGATGGGTTATTTTTTCTATAGATATTGCTATAGTGCTTTTTGCTAATTTGGTAACCTATCTAATTGTTTCCAATTTAA
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GGCTCTGTAGTTCCTTTATTTACAAAGCAAATTAATGAGGGTGGACCTTTGACTATAACGCATCCAGATATCATTCGGTA
TTTTATGACTATTCCAGAAGCTTGTCAGTTAGTATTAGAAGCAGGTGCTATGGGAAATGGTGGTGAAATTTATATATTTG
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GAATATCAATCGTTAGATAATTAA

Protein sequence :
MPENTSNNQSVSSSFLKNKFLNLGYLPRWVIFSIDIAIVLFANLVTYLIVSNLTFKYYDTASVFQRTFIIVFTQIFFFFV
FKSYAGIIRHSTLNDGFNLFKSTFSTFLALAILNYAHFYWVGSKIFLMPALVLTFLISFIFLLSFRIAVKIIYQVYIEAS
QVSSYQKVVIYGTDSHAIALANAINAEQPRKYRLVGFVDKYKNKATKTILDVPILSHDKSIVKILDALNAKNLIIADRNI
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EIKVVGLRPGEKLYEELLNDAAKTLPTHHEKIMIAKDELEDYISISTEIDELIEIAKDKKPHEVVAKMKIIVPEFVSLNS
EYQSLDN

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
cap1D AAA64643.1 type 1 capsule synthesis gene Virulence SCCcap1 Protein 7e-79 44

• Homologs from VFDB (virulence genes)

GeneGenBank Accn Product ID of source DB Alignment Type E-val Identity
wbpM YP_005356713.1 WbpM protein VFG0029 Protein 7e-75 41