Name : wbpM (KQS_03350) Accession : YP_005356713.1 Strain : Flavobacterium indicum GPTSA100-9 Genome accession: NC_017025 Putative virulence/resistance : Virulence Product : WbpM protein Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 759779 - 761722 bp Length : 1944 bp Strand : + Note : - DNA sequence : GTGCCCGAAAATACTAGCAATAATCAATCCGTTAGTTCTTCTTTTTTGAAGAATAAGTTTCTCAATTTAGGTTATTTACC TCGATGGGTTATTTTTTCTATAGATATTGCTATAGTGCTTTTTGCTAATTTGGTAACCTATCTAATTGTTTCCAATTTAA CATTTAAGTATTATGATACAGCATCAGTTTTTCAGCGAACTTTTATCATAGTATTTACACAAATATTTTTCTTTTTTGTG TTTAAATCTTATGCAGGTATCATAAGACATTCTACTTTAAATGATGGTTTTAATCTTTTTAAATCCACATTTAGCACTTT TCTTGCCTTAGCCATATTGAATTATGCTCATTTTTATTGGGTGGGATCTAAAATATTTTTAATGCCGGCTTTAGTGTTAA CATTTTTAATCTCATTTATATTTTTATTATCATTTAGGATTGCGGTAAAAATAATTTATCAAGTATACATCGAAGCGAGT CAGGTATCCAGTTATCAAAAAGTAGTGATTTATGGAACTGATAGTCATGCAATAGCTCTGGCAAATGCAATTAATGCAGA ACAACCCCGAAAATATAGATTAGTAGGATTTGTTGATAAATACAAAAACAAGGCAACCAAAACGATATTAGATGTGCCAA TTCTATCGCATGATAAATCAATTGTTAAGATTTTAGATGCATTAAACGCAAAAAATTTAATAATCGCAGATCGAAATATT CCAAACAAGTTGCAATTGTTGATTGTTGATCAATGTTTAGAACACAATATAAAATTACTAACAGTGCCAGTTGTTGCCGA TTGGAATAATCAAAAGCGTATAACAAAAAGTATTAAAACTTTTGAAATTTTAGATTTATTAGATCGAAAACCAATTGTGT TAGATAACACAAAAATATCCAATCAATTAACTGATAAAATTGTCCTTATAACTGGTGCTGCAGGGTCAATAGGAAGTGAA ATTGTTAGACAAGTTTTAGCGTTTAAACCGAGAAAAATTCTGGTTTTAGATCAAGCAGAAACCCCTTTATATCAATTAGT TTTAGAATTAGAAAAAGTAATTGCAATTGAAATTGTTTCATTGATTGCCGATGTTAGAGATAAAGAACAAATGAGAAAGA TATTCGAAAAATACCAACCTCAATTTGTTTTTCACGCCGCTGCTTACAAACATGTTCCTTTAATGGAAGAGAATCCAACT CAAGCAATTTATACCAATGTTTTAGGAACTAAAAATATGGCTGATTTAGCCGTTAAATTTAAAGTGGAACGTTTTGTAAT GGTTTCAACCGATAAAGCGGTGAATCCAAGTAATGTAATGGGAGCTAGTAAACGAATTGCAGAAAAGTATGTGCAATCTC TTTCAGCCTATTTAGAGCAAATGAAAGAGTCTTCCACTAAATTTATAACTACTCGGTTTGGAAATGTTTTGGGTTCAAAC GGCTCTGTAGTTCCTTTATTTACAAAGCAAATTAATGAGGGTGGACCTTTGACTATAACGCATCCAGATATCATTCGGTA TTTTATGACTATTCCAGAAGCTTGTCAGTTAGTATTAGAAGCAGGTGCTATGGGAAATGGTGGTGAAATTTATATATTTG ATATGGGTAAACCCGTTAAAATTATCGATTTAGCCGAAAAAATGATTCGATTAGCAGGTTATGTTCCTAACGAGGATATA GAAATTAAAGTAGTTGGATTAAGGCCAGGTGAAAAACTCTACGAAGAGTTGTTAAACGATGCTGCCAAAACGCTTCCGAC GCATCACGAAAAAATTATGATTGCTAAGGATGAACTAGAGGATTATATTTCGATAAGTACTGAAATTGATGAATTAATTG AGATAGCAAAAGATAAAAAACCTCACGAAGTAGTCGCTAAAATGAAAATTATTGTGCCTGAATTTGTTAGCTTAAATTCG GAATATCAATCGTTAGATAATTAA Protein sequence : MPENTSNNQSVSSSFLKNKFLNLGYLPRWVIFSIDIAIVLFANLVTYLIVSNLTFKYYDTASVFQRTFIIVFTQIFFFFV FKSYAGIIRHSTLNDGFNLFKSTFSTFLALAILNYAHFYWVGSKIFLMPALVLTFLISFIFLLSFRIAVKIIYQVYIEAS QVSSYQKVVIYGTDSHAIALANAINAEQPRKYRLVGFVDKYKNKATKTILDVPILSHDKSIVKILDALNAKNLIIADRNI PNKLQLLIVDQCLEHNIKLLTVPVVADWNNQKRITKSIKTFEILDLLDRKPIVLDNTKISNQLTDKIVLITGAAGSIGSE IVRQVLAFKPRKILVLDQAETPLYQLVLELEKVIAIEIVSLIADVRDKEQMRKIFEKYQPQFVFHAAAYKHVPLMEENPT QAIYTNVLGTKNMADLAVKFKVERFVMVSTDKAVNPSNVMGASKRIAEKYVQSLSAYLEQMKESSTKFITTRFGNVLGSN GSVVPLFTKQINEGGPLTITHPDIIRYFMTIPEACQLVLEAGAMGNGGEIYIFDMGKPVKIIDLAEKMIRLAGYVPNEDI EIKVVGLRPGEKLYEELLNDAAKTLPTHHEKIMIAKDELEDYISISTEIDELIEIAKDKKPHEVVAKMKIIVPEFVSLNS EYQSLDN |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
cap1D | AAA64643.1 | type 1 capsule synthesis gene | Virulence | SCCcap1 | Protein | 7e-79 | 44 |
Gene | GenBank Accn | Product | ID of source DB | Alignment Type | E-val | Identity |
wbpM | YP_005356713.1 | WbpM protein | VFG0029 | Protein | 7e-75 | 41 |