Name : cplB (KQS_05700) Accession : YP_005357161.1 Strain : Flavobacterium indicum GPTSA100-9 Genome accession: NC_017025 Putative virulence/resistance : Unknown Product : ATPase with chaperone activity ATP-binding subunit Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 1257042 - 1259633 bp Length : 2592 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGAATTTCAAAAATCTAACTATTAAATCACAAGAAGCTCTTCAGCAAGCACAACAAATTGCACAGAGCTTTGGACATCA ACAACTAGAAAATGAACACATTTTCAAAGGTATATTAGAAGTTGATGAAAATGTAATTCCGTTTATATTGAAAAAAGTCA ATGTAAATGTGGATATTTTTAAAAAGGTATTAGACAGTACCTTAGAAAGTTTTCCAAAAGTTTCAGGAGGTGATATTATG TTGTCTCGTGATGCAGGTACAACGTTAAATGAAGCAGAACTAATTGCTAAAAAGATGAGCGATGAATTTGTTTCAATTGA ACATTTGGTTTTAGCCATTTTTAAATCGAAAAGTAAAGTTGCACAAGTTTTAAAAGATCAAGGGGTAACAGAGAAAGGCT TAGAAAGTGCTATTAAAGAAATAAGAAAGGGAGAACGAGTTACCTCAGCTTCTGCTGAAGAGACTTATAATTCGTTAAAC AAATATGCCAAAAATTTAAATGAATTAGCCCGTACAGGTAAATTAGACCCTGTTATTGGGAGAGATGAAGAAATTCGACG TGTATTACAAATTTTAACACGTAGAAGTAAAAATAATCCCATGTTAATTGGGGAGCCAGGAGTAGGTAAAACTGCAATTG CAGAGGGATTAGCACACCGAATTGTGGATGGCGATGTACCTGAAAATTTGAAAGATAAAATTGTGTATTCATTAGATATG GGTGCATTGATTGCAGGTGCTAAATACAAAGGTGAATTTGAAGAGCGTTTAAAATCGGTTGTAAAAGAAGTTACAGCGGC AGAAGGTGAAATTGTTTTATTCATTGATGAGATACATACACTTGTTGGTGCAGGTGGTGGTGAAGGAGCTATGGATGCGG CTAATATTTTAAAACCTGCTTTAGCGCGTGGTGAATTAAGAGCAATTGGTGCTACAACTTTAGACGAATACCAAAAATAT TTTGAAAAAGATAAAGCGTTAGAACGTCGTTTTCAAAAAGTAATGGTGGAAGAGCCTGATACCGAAAGTGCTATATCTAT TCTTCGTGGAATTAAGGAAAAATATGAAACACACCATAAAGTTCGAATTAAAGACGATGCTATTATAGCTGCTGTTGAGT TGTCGCAACGTTATATTACCAATCGTTTTTTACCCGATAAAGCCATTGATTTAATGGACGAAGCGGCGTCTAAATTGCGT ATGGAAATTAATTCAAAACCAGAAGAATTGGATGTTTTGGATCGAAAAATTATGCAGTTGGAAATTGAAATAGAAGCTAT TAAAAGAGAAAATGATGAAACAAAATTAAAAGTATTGAATCTGGATTTAGCCAATTTGAAAGAAGAACGCAATGAAATTT TTGCCAAATGGAAATCGGAAAAAGATGTTGTTGAAGGAATTCAGAGTGTAAAACAACAGATTGAAGATTTTAAACTGGAA GCAGAACGTGCAGAACGTGAAGGTGATTATGGTAAAGTGGCTGAGATTCGCTATGGAAAAATTAAAGAAGCACAAGAAAA ATTAGATGTGTTGCAAGTCCAATTGCAAGAAAATCAAAAAGGACAGTCTTTAATTAAAGAAGAAGTAACTCATGATGATA TTGCTGAAGTGGTAGCAAAATGGACGGGTATACCGGTTACAAAAATGCTGCAAAGTGAGCGCGAAAAGTTATTGAAGTTA GAAGATGAATTACACAAACGTGTAGTAGGTCAAGAAGAAGCAATTGAAGCGATTTCAGACGCCGTACGTAGAAGTAGAGC GGGATTACAAGACGCAAAAAAACCTATAGGTTCGTTCTTGTTCTTAGGTACAACTGGTGTGGGAAAAACGGAATTAGCCA AAGCTCTAGCGGAATATTTATTTGACGATGAAAATGCCATTACACGTATTGATATGAGTGAATATCAAGAGCGTCATAGT GTAAGTCGTTTAGTTGGTGCGCCTCCGGGATACGTTGGTTATGATGAAGGTGGTCAATTAACAGAAGCGGTGAGAAGAAG ACCGTATTCGGTAGTTTTATTAGATGAAATTGAAAAAGCACATCCAGATACCTTTAATATTTTATTACAAGTATTAGATG AAGGCCGACTTACAGATAATAAAGGTCGTTTGGCTGATTTTAAAAACACCATTATTATTATGACCTCTAATATGGGAAGT CATATTATTCAAGAAAAATTTGAAAATCTAAAAGGTGGTCTTGAAGCGGCAACAGAAGCAGCTAAAACTGAAGTTTTGGG TATGTTAAAACAAACCGTACGACCAGAGTTTATTAATCGTATTGATGAAATTGTAATGTTCACGCCATTGACCAATGATA ACATTAAACAAATTGTTGGTTTACAATTGAAAAGTGTAATTAAAATGTTAGAGCAGCAACACATCACTATGGAAGCAACT CCTGAAGCATTGGATTATTTATCGATGAAAGGATTTGATCCAGAATTTGGAGCACGACCGGTAAAACGTGTCATTCAAAG AGAAGTGTTGAATCAATTGTCTAAAGAAATTTTAGCCGGAAATGTGAAAACAGACAGCTTCATTATCTTAGATTGTTTTG ATAATAAATTGGTTTTTAGAAATCAAGAATAA Protein sequence : MNFKNLTIKSQEALQQAQQIAQSFGHQQLENEHIFKGILEVDENVIPFILKKVNVNVDIFKKVLDSTLESFPKVSGGDIM LSRDAGTTLNEAELIAKKMSDEFVSIEHLVLAIFKSKSKVAQVLKDQGVTEKGLESAIKEIRKGERVTSASAEETYNSLN KYAKNLNELARTGKLDPVIGRDEEIRRVLQILTRRSKNNPMLIGEPGVGKTAIAEGLAHRIVDGDVPENLKDKIVYSLDM GALIAGAKYKGEFEERLKSVVKEVTAAEGEIVLFIDEIHTLVGAGGGEGAMDAANILKPALARGELRAIGATTLDEYQKY FEKDKALERRFQKVMVEEPDTESAISILRGIKEKYETHHKVRIKDDAIIAAVELSQRYITNRFLPDKAIDLMDEAASKLR MEINSKPEELDVLDRKIMQLEIEIEAIKRENDETKLKVLNLDLANLKEERNEIFAKWKSEKDVVEGIQSVKQQIEDFKLE AERAEREGDYGKVAEIRYGKIKEAQEKLDVLQVQLQENQKGQSLIKEEVTHDDIAEVVAKWTGIPVTKMLQSEREKLLKL EDELHKRVVGQEEAIEAISDAVRRSRAGLQDAKKPIGSFLFLGTTGVGKTELAKALAEYLFDDENAITRIDMSEYQERHS VSRLVGAPPGYVGYDEGGQLTEAVRRRPYSVVLLDEIEKAHPDTFNILLQVLDEGRLTDNKGRLADFKNTIIIMTSNMGS HIIQEKFENLKGGLEAATEAAKTEVLGMLKQTVRPEFINRIDEIVMFTPLTNDNIKQIVGLQLKSVIKMLEQQHITMEAT PEALDYLSMKGFDPEFGARPVKRVIQREVLNQLSKEILAGNVKTDSFIILDCFDNKLVFRNQE |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
aec27 | YP_851418.1 | ATPase | Not tested | PAI II APEC-O1 | Protein | 1e-102 | 42 |
aec27 | AAQ96721.1 | Aec27 | Not tested | AGI-1 | Protein | 7e-103 | 42 |