Gene Information

Name : SAMSHR1132_03030 (SAMSHR1132_03030)
Accession : YP_005324825.1
Strain : Staphylococcus aureus MSHR1132
Genome accession: NC_016941
Putative virulence/resistance : Virulence
Product : hypothetical protein
Function : -
COG functional category : -
COG ID : -
EC number : -
Position : 355991 - 357337 bp
Length : 1347 bp
Strand : -
Note : -

DNA sequence :
ATGCAATCAATCCTTAATTTCATTGTCGATATTTTAAGTCAACCAGCAATTCTTGTTGCCCTTATTGCTTTTATCGGTTT
AATTGTTCAGAAAAAACCTGCCGCTACAATTACTTCAGGTACCATTAAAACAATATTGGGATTCTTAATTTTAAGTGCCG
GTGCCGACGTAGTTGTTCGCTCACTTGAACCTTTTGGAAAAATATTCCAGCACGCTTTCGGTGTTCAAGGCATTGTTCCA
AATAATGAAGCTATTGTTTCCCTTGCCTTAAAAGATTTCGGAACAACAGCCGCACTTATTATGGTCTGTGGCATGATAGT
GAATATCTTAATTGCACGTTTTACTAACTTAAAATATATCTTTTTAACAGGACACCATACATTTTACATGGCAGCATTTT
TAGCAATTATTTTAACAGTGAGTCATATTAAGGGATGGCTAACGATTGTTATCGGCGCACTCGTATTAGGCTTAATCATG
GCAGTCTTACCTGCATTACTCCAACCTACGATGCGTAAAATTACTGGCAATGATCAAGTGGCATTAGGGCATTTCGGTTC
AATCAGCTACTTTGCTGCAGGTGCCGTAGGTCAATTATTCAAAGGGAAATCTAAATCAACAGAAGATATTAAATTCCCTA
AAGGATTAAGTTTTTTAAGAGAAAGTACAATTAGTATTTCTATTACAATGGCATTACTCTATTTCATTGCTTGTTTATTT
GCAGGTGTCAGTTATGTACATCAATCAATTAGCAATGGACAAAACTTTATTGTTTTCTCATTAATTCAAGGTGTAACATT
TGCCGCTGGTGTATTTATCATTTTAACAGGTGTGCGGTTAATCTTAGCTGAAATCGTTCCAGCATTTAAAGGTATCTCTG
AAAAACTTGTACCAAATTCTAAGCCTGCATTAGACTGCCCTATTGTGTTTCCTTATGCACAGAACGCTGTCTTAATTGGG
TTCTTTGTCAGCTTTATTACAGGTGTCATTGGTATGTTTATCCTATTCTTATTTGGTGGCGTCGTTATTTTACCAGGCGT
TGTGGCCCACTTCTTCTTAGGTGCAACTGCCGCAGTCTTCGGTAACGCAAGAGGTGGTATTAAAGGTGCTGTTGCAGGCG
CTGCTCTTAATGGTATCTTGATTACATTCTTGCCATTATTATTCTTACCATTTTTAGGTGAATTAGGTGGTGCCGCAACA
ACATTCTCCGATACAGACTTTTTAGCTGTCGGCATTGTATTTGGTAACGCAGTAAAATATATGGGATTATTTGGTGCTGT
TCTATTTATTATCATCGTTGGAGCTACAGCGATTTTATTAAAAGGCCGTCAAAAAGCACAACAATAA

Protein sequence :
MQSILNFIVDILSQPAILVALIAFIGLIVQKKPAATITSGTIKTILGFLILSAGADVVVRSLEPFGKIFQHAFGVQGIVP
NNEAIVSLALKDFGTTAALIMVCGMIVNILIARFTNLKYIFLTGHHTFYMAAFLAIILTVSHIKGWLTIVIGALVLGLIM
AVLPALLQPTMRKITGNDQVALGHFGSISYFAAGAVGQLFKGKSKSTEDIKFPKGLSFLRESTISISITMALLYFIACLF
AGVSYVHQSISNGQNFIVFSLIQGVTFAAGVFIILTGVRLILAEIVPAFKGISEKLVPNSKPALDCPIVFPYAQNAVLIG
FFVSFITGVIGMFILFLFGGVVILPGVVAHFFLGATAAVFGNARGGIKGAVAGAALNGILITFLPLLFLPFLGELGGAAT
TFSDTDFLAVGIVFGNAVKYMGLFGAVLFIIIVGATAILLKGRQKAQQ

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
ORF8 AAK27335.1 unknown Not tested PAI-I AL862 Protein 2e-105 58
unnamed CAC39291.1 hypothetical protein Not tested LPA Protein 2e-105 58
vpeC ADD91725.1 putative PTS system-specific IIC component VpeC Virulence PAI-I AL862 Protein 2e-105 58