|
Name : SAMSHR1132_19020 (SAMSHR1132_19020) Accession : YP_005326404.1 Strain : Staphylococcus aureus MSHR1132 Genome accession: NC_016941 Putative virulence/resistance : Unknown Product : putative potassium-transporting ATPase a chain Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : 3.6.3.12 Position : 2076104 - 2077783 bp Length : 1680 bp Strand : - Note : - DNA sequence : ATGGTAGAAATAATTTTATTCTTAGTAATTATAGTTTTTATTGCTTATGTATTTAGTAAGTATCTTTATCGTGTAGCATT AATTCAACCAACATTTGCTGATGGGATATTTAGAAATTTTGAAAATGTATGTTTTAAAATAATCGGAACAGATTTAGAGC ATATGTCAGCTAAAAGATACTTAAAGCACTTTTTAGCATTTAATGCATTAATGGGTTTAATTGCATTTGTGTTGTTGTTA ACGCAACAGTGGCTTTTTTTAAATCCAAATCATAATTTGAATCAGTCGTTTATTTTAGCGCTTAATACGGCAGCATCATT TTTAACAAATACTAATTTACAACATTATAGTGGCGAAACTGGAGCTACGTATTTAACGCAAATGATTGTTATGACTTATT TAATGTTTACATCAAGTGCATCAGGTTATGCCGTATGTATTGCAATGTTGCGTAGGTTAACGGGATTGACAGATATTATA GGAAATTTCTATCAGGATATTATTAGGTTTATAGTGCGTGTACTATTACCAATTTCATTTTTACTAAGTATTTTATTAAT GATTCAAGGAGTACCACAAACATTGCATGGCAATTTAATGATTTGCACATTAAGTGGTCAAATACAGCATATTGCTATTG GACCAATAGCTTCACTTGAATCTATTAAACACCTTGGTACCAATGGTGGAGGGTTTTTAGGAGGTAATGCATCAACACCT TTTGAAAATCCAAATATATGGAGTAATTTTATTGAAATGGGCAGTATGATGCTACTTCCGCTAGCAATATTATTTTTATT TGGGCGTATGTTGACTAAAAATGGTAGACACGTACATCGTCATGTTTGGGTATTATTTGTAACAATGTTCATCATTTTTA TTAGTGGAATAATTTTAACGATGTGGAGTGAGTACCATGGTAATCCACTATTTAATCATTTAGGTATTCATGATGCTAAT TTTGAAGGCAAGGAGGTACGATTTGGTATTGGATTATCATCAGTATTTTCGATTATAACGACTGCTTTTACTACTGGATC TGTTAATAATATGCATGATAGTTTAACGGCATTAGGTGGTTTAGGGCCAATGATATTTATGATGTTAAATATTGTATTTG GTGGAGAAGGTGTCGGATTAATGAATCTATTAATCTACGTATTGTTAACTGTATTTATTTGCAGTTTGATGGTTGGAAAA ACACCAGAATATTTAAATATGCCTATCGGAGGTCGTGAGATGAAATGTATAGTGTTAGCATTTCTCATTCATCCAATTTT AATATTAGTTTTCTCTGCACTCGTGTATGTCATTCCTGGTGTTAGTGACACTATTACGAATCCATCATTTCATGGCGTAT CTCAAGTACTTTATGAAATGACATCTGCATCTGCAAATAATGGCTCAGGGTTTGAAGGGTTAAAAGACAATACACCGTTT TGGAATATTTCAACAGGTATCATAATGATATTTGCTAGATATATACCAATTATCTTGCAATTGATGATTGCGTCTAGCCT AGTTAGGAAAAAATCTTACCACCAAGAAAAGTATACGATTGCAATTGATAAACCTTATTTTGGTGTATCACTAGTTGTCT TTATCATTTTACTTAGTGGATTAACATTTGTTCCTGTGTTACTTCTCGGTCCAATCGGTGAATTTTTAACTTTAAAATAA Protein sequence : MVEIILFLVIIVFIAYVFSKYLYRVALIQPTFADGIFRNFENVCFKIIGTDLEHMSAKRYLKHFLAFNALMGLIAFVLLL TQQWLFLNPNHNLNQSFILALNTAASFLTNTNLQHYSGETGATYLTQMIVMTYLMFTSSASGYAVCIAMLRRLTGLTDII GNFYQDIIRFIVRVLLPISFLLSILLMIQGVPQTLHGNLMICTLSGQIQHIAIGPIASLESIKHLGTNGGGFLGGNASTP FENPNIWSNFIEMGSMMLLPLAILFLFGRMLTKNGRHVHRHVWVLFVTMFIIFISGIILTMWSEYHGNPLFNHLGIHDAN FEGKEVRFGIGLSSVFSIITTAFTTGSVNNMHDSLTALGGLGPMIFMMLNIVFGGEGVGLMNLLIYVLLTVFICSLMVGK TPEYLNMPIGGREMKCIVLAFLIHPILILVFSALVYVIPGVSDTITNPSFHGVSQVLYEMTSASANNGSGFEGLKDNTPF WNISTGIIMIFARYIPIILQLMIASSLVRKKSYHQEKYTIAIDKPYFGVSLVVFIILLSGLTFVPVLLLGPIGEFLTLK |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| kdpA | YP_251948.1 | potassium-transporting ATPase subunit A | Not tested | SCCmec | Protein | 4e-162 | 69 |
| unnamed | BAB43902.1 | potassium-transporting ATPase(A chain) | Not tested | Type-II SCCmec | Protein | 2e-161 | 68 |
| SAR0070 | YP_039538.1 | potassium-transporting ATPase subunit A | Not tested | Type-II SCCmec | Protein | 3e-161 | 68 |
| truncated-kdpA | NP_370596.1 | potassium-transporting ATPase subunit A | Not tested | Type-II SCCmec | Protein | 3e-161 | 68 |
| kdpA | NP_373308.2 | potassium-transporting ATPase subunit A | Not tested | Type-II SCCmec | Protein | 3e-161 | 68 |
| kdpA | YP_190030.1 | potassium-transporting ATPase subunit A | Not tested | Type-II SCCmec | Protein | 3e-161 | 68 |
